227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5223 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1044  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  83.33 
 
 
390 aa  679    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.73638 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5223  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  100 
 
 
390 aa  799    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0788  alanine dehydrogenase/PNT-like protein  71.35 
 
 
390 aa  566  1e-160  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0803  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  71.35 
 
 
390 aa  566  1e-160  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.509413  normal  0.23017 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0784  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  71.09 
 
 
390 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.176883  normal  0.706043 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3668  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  64.53 
 
 
392 aa  503  1e-141  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3880  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  62.77 
 
 
386 aa  501  1e-140  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27310  alanine dehydrogenase  63.02 
 
 
387 aa  490  1e-137  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.301898 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7427  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  62.83 
 
 
403 aa  484  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.312658  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5627  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  59.84 
 
 
380 aa  459  9.999999999999999e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.962551 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22750  alanine dehydrogenase  57.49 
 
 
410 aa  429  1e-119  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3833  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  44.41 
 
 
382 aa  338  9.999999999999999e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.507137  normal  0.206016 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3804  alanine dehydrogenase  25.2 
 
 
366 aa  85.9  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0666  alanine dehydrogenase  24.87 
 
 
372 aa  86.3  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3004  alanine dehydrogenase  25.14 
 
 
368 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.914674  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0346  alanine dehydrogenase and pyridine nucleotide transhydrogenase  25.8 
 
 
357 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1930  alanine dehydrogenase  26.79 
 
 
376 aa  75.1  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.275818  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1607  alanine dehydrogenase  25.41 
 
 
360 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0106599  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3222  L-alanine dehydrogenase  25.51 
 
 
372 aa  73.6  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0766245  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3628  L-alanine dehydrogenase  26.05 
 
 
374 aa  73.2  0.000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.243923 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19910  L-alanine dehydrogenase  26.02 
 
 
380 aa  72.8  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.653017  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2292  alanine dehydrogenase  23.87 
 
 
365 aa  72  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10273  alanine dehydrogenase  24.74 
 
 
399 aa  72  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12793  secreted L-alanine dehydrogenase ald (40 kDa antigen)  24.61 
 
 
371 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.74924 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1878  alanine dehydrogenase  24.47 
 
 
377 aa  70.1  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4356  alanine dehydrogenase  24.67 
 
 
379 aa  70.1  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.80752  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2488  L-alanine dehydrogenase  23.98 
 
 
371 aa  67.8  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.151981  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1847  alanine dehydrogenase  24.77 
 
 
370 aa  67.4  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1404  alanine dehydrogenase  24.18 
 
 
370 aa  67  0.0000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0875  L-alanine dehydrogenase  24.52 
 
 
406 aa  67  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2109  L-alanine dehydrogenase  24.77 
 
 
370 aa  67  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0568  alanine dehydrogenase  26.18 
 
 
376 aa  67  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0663  alanine dehydrogenase and pyridine nucleotide transhydrogenase  25.21 
 
 
367 aa  66.6  0.0000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0662308 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1485  alanine dehydrogenase  22.74 
 
 
370 aa  66.6  0.0000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.775902  hitchhiker  0.0000000116767 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2909  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  23.95 
 
 
399 aa  66.6  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.499459  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2442  alanine dehydrogenase  24.62 
 
 
372 aa  66.2  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.4786 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0986  hypothetical protein  23.1 
 
 
373 aa  65.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0627  alanine dehydrogenase  23.22 
 
 
411 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1068  alanine dehydrogenase  23.26 
 
 
371 aa  65.9  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1923  alanine dehydrogenase  23.88 
 
 
371 aa  65.9  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.156676 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1767  alanine dehydrogenase  24.93 
 
 
370 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4758  alanine dehydrogenase  23.21 
 
 
377 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4521  alanine dehydrogenase  23.21 
 
 
377 aa  64.7  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.693738  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4357  alanine dehydrogenase  23.21 
 
 
377 aa  64.7  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4368  alanine dehydrogenase  23.21 
 
 
377 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103175  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2994  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  25.82 
 
 
403 aa  64.3  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0579773  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1099  L-alanine dehydrogenase  24.46 
 
 
365 aa  64.7  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.305636  hitchhiker  0.000729988 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4873  alanine dehydrogenase  23.21 
 
 
377 aa  64.7  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4741  alanine dehydrogenase  23.21 
 
 
377 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4731  alanine dehydrogenase  23.21 
 
 
377 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3106  alanine dehydrogenase  22.57 
 
 
373 aa  64.7  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0504  alanine dehydrogenase  23.21 
 
 
377 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4752  alanine dehydrogenase  23.21 
 
 
377 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000212885  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4430  alanine dehydrogenase  23.72 
 
 
371 aa  64.3  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.421727  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2908  L-alanine dehydrogenase  25.28 
 
 
374 aa  64.3  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4453  alanine dehydrogenase  22.92 
 
 
377 aa  64.3  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0857625  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0955  hypothetical protein  23.1 
 
 
373 aa  63.9  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3299  alanine dehydrogenase  23.21 
 
 
377 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1914  alanine dehydrogenase  23.28 
 
 
371 aa  63.2  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1995  L-alanine dehydrogenase  23.76 
 
 
371 aa  63.2  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0767  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  23.76 
 
 
403 aa  63.2  0.000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2355  alanine dehydrogenase  24 
 
 
371 aa  63.2  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00470205 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0765  alanine dehydrogenase  24.67 
 
 
372 aa  63.2  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0909  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  26.84 
 
 
363 aa  63.2  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2145  L-alanine dehydrogenase  26.92 
 
 
371 aa  63.2  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.147893 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5016  alanine dehydrogenase  24.56 
 
 
372 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0921868 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0509  alanine dehydrogenase  22.25 
 
 
377 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153171  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02114  Alanine dehydrogenase A  25.3 
 
 
323 aa  62.8  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000532758  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2995  alanine dehydrogenase  25.15 
 
 
371 aa  62.4  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2698  alanine dehydrogenase  24.47 
 
 
373 aa  62.8  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2462  alanine dehydrogenase  25.2 
 
 
376 aa  61.6  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000220592  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0761  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  24.29 
 
 
406 aa  61.6  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.716267 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3119  alanine dehydrogenase  23.41 
 
 
371 aa  62  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0458  L-alanine dehydrogenase  23.48 
 
 
372 aa  61.6  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3772  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  25.98 
 
 
363 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.504834  normal  0.386692 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1700  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  23.3 
 
 
406 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000678625 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1288  L-alanine dehydrogenase  24.85 
 
 
372 aa  60.8  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.109562  normal  0.0699401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1520  alanine dehydrogenase  24.86 
 
 
371 aa  60.8  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0484059  hitchhiker  0.000320344 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1743  alanine dehydrogenase  22.81 
 
 
371 aa  61.2  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.359397  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0563  alanine dehydrogenase  33.06 
 
 
366 aa  60.8  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545886  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7155  alanine dehydrogenase  23.38 
 
 
372 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.301485 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0062  alanine dehydrogenase  24.36 
 
 
373 aa  60.5  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.463029  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4220  alanine dehydrogenase  25.45 
 
 
371 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.757032  normal  0.167036 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0906  L-alanine dehydrogenase  22.13 
 
 
367 aa  60.1  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1495  alanine dehydrogenase  23.74 
 
 
374 aa  60.1  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000156892  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2150  Alanine dehydrogenase  23.28 
 
 
406 aa  60.1  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1428  L-alanine dehydrogenase  23.94 
 
 
371 aa  60.1  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.524498  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0822  alanine dehydrogenase  22.74 
 
 
371 aa  59.7  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.709879 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2448  alanine dehydrogenase  28.91 
 
 
366 aa  59.7  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2005  alanine dehydrogenase and pyridine nucleotide transhydrogenase  23.86 
 
 
355 aa  59.3  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1177  alanine dehydrogenase  23.42 
 
 
362 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3297  alanine dehydrogenase  25.15 
 
 
371 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1368  alanine dehydrogenase  24.54 
 
 
372 aa  58.2  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3686  L-alanine dehydrogenase  23.31 
 
 
372 aa  58.2  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4146  alanine dehydrogenase  25.15 
 
 
371 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110875  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2104  L-alanine dehydrogenase  22.14 
 
 
371 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364817  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2565  Alanine dehydrogenase  23.95 
 
 
371 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.502023 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2150  L-alanine dehydrogenase  22.14 
 
 
371 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.093949 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4118  alanine dehydrogenase  23.95 
 
 
371 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0543  alanine dehydrogenase  23.4 
 
 
371 aa  58.2  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>