More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7427 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7427  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  100 
 
 		 403 aa  828    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.312658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27310  alanine dehydrogenase  67.2 
 
 		 387 aa  529  1e-149  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.301898 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3668  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  66.58 
 
 		 392 aa  525  1e-148  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5627  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  65.62 
 
 		 380 aa  521  1e-147  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.962551 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3880  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  64.74 
 
 		 386 aa  511  1e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0784  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  64.51 
 
 		 390 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.176883  normal  0.706043 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0788  alanine dehydrogenase/PNT-like protein  64.51 
 
 		 390 aa  490  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0803  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  64.51 
 
 		 390 aa  490  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.509413  normal  0.23017 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1044  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  62.24 
 
 		 390 aa  480  1e-134  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.73638 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5223  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  62.83 
 
 		 390 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22750  alanine dehydrogenase  60.36 
 
 		 410 aa  468  9.999999999999999e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3833  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  46.19 
 
 		 382 aa  348  9e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.507137  normal  0.206016 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2488  L-alanine dehydrogenase  27.06 
 
 		 371 aa  93.2  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.151981  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2104  L-alanine dehydrogenase  27.35 
 
 		 371 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364817  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2087  L-alanine dehydrogenase  27.78 
 
 		 371 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2150  L-alanine dehydrogenase  27.35 
 
 		 371 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.093949 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0663  alanine dehydrogenase and pyridine nucleotide transhydrogenase  24.86 
 
 		 367 aa  91.3  3e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0662308 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4356  alanine dehydrogenase  26.29 
 
 		 379 aa  89.7  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.80752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2355  alanine dehydrogenase  26.18 
 
 		 371 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00470205 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4430  alanine dehydrogenase  26.39 
 
 		 371 aa  86.7  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.421727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1099  L-alanine dehydrogenase  26.15 
 
 		 365 aa  86.3  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.305636  hitchhiker  0.000729988 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0666  alanine dehydrogenase  23.76 
 
 		 372 aa  83.6  0.000000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1923  alanine dehydrogenase  27.65 
 
 		 371 aa  82.8  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.156676 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1743  alanine dehydrogenase  25.15 
 
 		 371 aa  81.6  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.359397  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1068  alanine dehydrogenase  23.92 
 
 		 371 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1930  alanine dehydrogenase  26.79 
 
 		 376 aa  82  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.275818  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1607  alanine dehydrogenase  26.34 
 
 		 360 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0106599  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2908  L-alanine dehydrogenase  26.84 
 
 		 374 aa  81.3  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2462  alanine dehydrogenase  27.22 
 
 		 376 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000220592  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0906  L-alanine dehydrogenase  24.93 
 
 		 367 aa  80.9  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0568  alanine dehydrogenase  26.57 
 
 		 376 aa  80.5  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19910  L-alanine dehydrogenase  24.33 
 
 		 380 aa  79.7  0.00000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.653017  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0543  alanine dehydrogenase  24.79 
 
 		 371 aa  79.3  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0346  alanine dehydrogenase and pyridine nucleotide transhydrogenase  25.51 
 
 		 357 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1767  alanine dehydrogenase  25.77 
 
 		 370 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2698  alanine dehydrogenase  25.52 
 
 		 373 aa  79  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2630  alanine dehydrogenase  24.11 
 
 		 370 aa  79  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0012805  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2292  alanine dehydrogenase  24.36 
 
 		 365 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3628  L-alanine dehydrogenase  28.1 
 
 		 374 aa  78.6  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.243923 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1608  alanine dehydrogenase  24.92 
 
 		 370 aa  78.6  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0320877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0765  alanine dehydrogenase  26.79 
 
 		 372 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3804  alanine dehydrogenase  23.89 
 
 		 366 aa  77  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2068  alanine dehydrogenase  23.97 
 
 		 371 aa  77  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000347962  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1288  L-alanine dehydrogenase  25.82 
 
 		 372 aa  77  0.0000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.109562  normal  0.0699401 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2966  L-alanine dehydrogenase  24.85 
 
 		 371 aa  76.6  0.0000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1914  alanine dehydrogenase  26.76 
 
 		 371 aa  76.3  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2442  alanine dehydrogenase  29.31 
 
 		 372 aa  76.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.4786 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3222  L-alanine dehydrogenase  25 
 
 		 372 aa  76.3  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0766245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6248  alanine dehydrogenase  24.47 
 
 		 368 aa  75.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.504475  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1700  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  26.02 
 
 		 406 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000678625 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1847  alanine dehydrogenase  24.77 
 
 		 370 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2995  alanine dehydrogenase  26.98 
 
 		 371 aa  74.7  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4017  alanine dehydrogenase  26.49 
 
 		 371 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737201 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12793  secreted L-alanine dehydrogenase ald (40 kDa antigen)  25.07 
 
 		 371 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.74924 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2170  alanine dehydrogenase  26.45 
 
 		 369 aa  73.9  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.443019  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2109  L-alanine dehydrogenase  24.47 
 
 		 370 aa  73.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3605  alanine dehydrogenase  25.47 
 
 		 371 aa  73.6  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2378  alanine dehydrogenase  28.47 
 
 		 372 aa  72.4  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.661312 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0203  alanine dehydrogenase  24.7 
 
 		 370 aa  72.4  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193787  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0723  L-alanine dehydrogenase  28.47 
 
 		 372 aa  72.8  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5016  alanine dehydrogenase  23.78 
 
 		 372 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0921868 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0627  alanine dehydrogenase  25.88 
 
 		 411 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7155  alanine dehydrogenase  25.8 
 
 		 372 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.301485 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1131  alanine dehydrogenase  24.77 
 
 		 370 aa  71.2  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2145  L-alanine dehydrogenase  25.81 
 
 		 371 aa  70.9  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.147893 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3131  alanine dehydrogenase  25.08 
 
 		 371 aa  70.9  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0048846  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3004  alanine dehydrogenase  24.46 
 
 		 368 aa  70.1  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.914674  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02114  Alanine dehydrogenase A  24.85 
 
 		 323 aa  70.1  0.00000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000532758  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1428  L-alanine dehydrogenase  26.58 
 
 		 371 aa  70.1  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.524498  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0875  L-alanine dehydrogenase  25.73 
 
 		 406 aa  70.1  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3106  alanine dehydrogenase  22.89 
 
 		 373 aa  69.7  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2565  Alanine dehydrogenase  23.74 
 
 		 371 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.502023 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0416  alanine dehydrogenase  23.85 
 
 		 390 aa  69.3  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.533057  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0822  alanine dehydrogenase  25.22 
 
 		 371 aa  69.3  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.709879 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1654  alanine dehydrogenase  25.21 
 
 		 367 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0062  alanine dehydrogenase  23.06 
 
 		 373 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.463029  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1520  alanine dehydrogenase  24.4 
 
 		 371 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0484059  hitchhiker  0.000320344 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1368  alanine dehydrogenase  24.18 
 
 		 372 aa  67.8  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1495  alanine dehydrogenase  23.87 
 
 		 374 aa  67.8  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000156892  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0961  L-alanine dehydrogenase  26.2 
 
 		 373 aa  67.8  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0644  L-alanine dehydrogenase  22.97 
 
 		 360 aa  67.8  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0163918  normal  0.784685 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0622  alanine dehydrogenase  26.57 
 
 		 373 aa  67.8  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1334  alanine dehydrogenase  23.71 
 
 		 376 aa  67.4  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2448  alanine dehydrogenase  24.39 
 
 		 366 aa  67.4  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0509  alanine dehydrogenase  21.86 
 
 		 377 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153171  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4758  alanine dehydrogenase  23.17 
 
 		 377 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4731  alanine dehydrogenase  23.17 
 
 		 377 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4521  alanine dehydrogenase  23.17 
 
 		 377 aa  67  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.693738  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4357  alanine dehydrogenase  23.17 
 
 		 377 aa  67  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4368  alanine dehydrogenase  23.17 
 
 		 377 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103175  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4873  alanine dehydrogenase  23.17 
 
 		 377 aa  67  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3512  alanine dehydrogenase  25.15 
 
 		 377 aa  67  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1485  alanine dehydrogenase  24.7 
 
 		 370 aa  67  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.775902  hitchhiker  0.0000000116767 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4752  alanine dehydrogenase  23.17 
 
 		 377 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000212885  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1609  alanine dehydrogenase  24.03 
 
 		 363 aa  67  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1635  alanine dehydrogenase  24.03 
 
 		 363 aa  67  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.348616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0504  alanine dehydrogenase  23.17 
 
 		 377 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0561  alanine dehydrogenase  21.86 
 
 		 377 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4707  alanine dehydrogenase  21.86 
 
 		 377 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.394656 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0649  alanine dehydrogenase  21.86 
 
 		 377 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000197457 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>