More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3517 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3517  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 238 aa  476  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0801  transcriptional regulator, GntR family  46.93 
 
 		 238 aa  190  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.912886  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5259  transcriptional regulator, GntR family  46.02 
 
 		 254 aa  176  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  41.99 
 
 		 243 aa  167  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  40.74 
 
 		 247 aa  159  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  40.65 
 
 		 243 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15390  transcriptional regulator  42.61 
 
 		 277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.457467 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 242 aa  146  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 266 aa  144  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1424  putative transcriptional regulator, GntR family  39.47 
 
 		 246 aa  143  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 248 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 243 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 243 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 243 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 243 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 225 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8309  putative transcriptional regulator, GntR family  40.34 
 
 		 239 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  37.93 
 
 		 252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0433  transcriptional regulator, GntR family  36.36 
 
 		 238 aa  140  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3733  transcriptional regulator, GntR family  38.43 
 
 		 245 aa  139  4.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1950  transcriptional regulator, GntR family  37.66 
 
 		 256 aa  138  7.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000832464 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 243 aa  137  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  39.44 
 
 		 244 aa  137  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0554  GntR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 248 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.799552  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3697  transcriptional regulator, GntR family  36.36 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7722  transcriptional regulator, GntR family  37.77 
 
 		 269 aa  134  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0953  transcriptional regulator, GntR family  38.26 
 
 		 244 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0114  transcriptional regulator  36.61 
 
 		 239 aa  133  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.19312e-17 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2213  GntR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 264 aa  132  6e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.042368  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  37.72 
 
 		 249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  37.28 
 
 		 244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1074  transcriptional regulator, GntR family  33.77 
 
 		 242 aa  126  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000120399  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  40.85 
 
 		 241 aa  125  4.0000000000000003e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 255 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8112  transcriptional regulator, GntR family  37.66 
 
 		 252 aa  125  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4032  transcriptional regulator, GntR family  37.72 
 
 		 246 aa  124  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.495604  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4060  transcriptional regulator, GntR family  36.09 
 
 		 245 aa  124  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.533333 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 247 aa  123  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2745  GntR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 240 aa  122  6e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  34.65 
 
 		 242 aa  122  7e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 240 aa  122  7e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2432  GntR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 240 aa  121  9e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3697  transcriptional regulator, GntR family  40.29 
 
 		 252 aa  121  9e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00311768  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4162  transcriptional regulator, GntR family  35.9 
 
 		 195 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000200129  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4015  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  37.02 
 
 		 243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132462 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1076  transcriptional regulator, GntR family  35.9 
 
 		 195 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00111341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1723  transcriptional regulator, GntR family  39.72 
 
 		 246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0291  GntR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 249 aa  119  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 244 aa  119  4.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4073  transcriptional regulator, GntR family  35.38 
 
 		 195 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0292067 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2288  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  32.9 
 
 		 263 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.718754  normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0426  GntR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3959  GntR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 219 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0354607  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2603  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  36.54 
 
 		 243 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.597561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5638  transcriptional regulator, GntR family  36.68 
 
 		 255 aa  115  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.797984 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  36.56 
 
 		 270 aa  115  6e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1710  GntR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 245 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4190  transcriptional regulator, GntR family  37.85 
 
 		 248 aa  115  7.999999999999999e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3803  transcriptional regulator, GntR family  37.62 
 
 		 257 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.596979 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0513  transcriptional regulator, GntR family  34.07 
 
 		 288 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0204845 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2049  transcriptional regulator, GntR family  38.46 
 
 		 245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1804  GntR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.582068 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1471  transcriptional regulator, GntR family  36.79 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.461855  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  36.92 
 
 		 261 aa  113  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  36.92 
 
 		 261 aa  113  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5560  putative transcriptional regulator, GntR family  37.21 
 
 		 247 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15830  GntR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 247 aa  112  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.800651  normal  0.0246518 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3150  GntR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 251 aa  112  6e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000981065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  32.27 
 
 		 252 aa  112  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2634  GntR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 245 aa  112  7.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.864303 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4543  transcriptional regulator, GntR family  34.42 
 
 		 245 aa  111  8.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0292  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 244 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4132  transcriptional regulator, GntR family  38.39 
 
 		 257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.253888 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2301  GntR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 242 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7245  GntR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 286 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.375803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  33.78 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1361  putative transcriptional regulator  35.32 
 
 		 277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2009  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  34.48 
 
 		 246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.378179  normal  0.0458399 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2856  histidine utilization repressor  29.52 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 233 aa  110  3e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 256 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6505  transcriptional regulator, GntR family  35.42 
 
 		 278 aa  109  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.381857  normal  0.213544 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1730  GntR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 252 aa  108  5e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.782156  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0763  GntR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 248 aa  108  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237996 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0836  GntR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 246 aa  108  6e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.840865  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 256 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2509  GntR family transcriptional regulator  40.64 
 
 		 257 aa  108  7.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.31596  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1033  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family protein  28.76 
 
 		 234 aa  108  9.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2475  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  33.47 
 
 		 255 aa  108  9.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5106  histidine utilization repressor  32.26 
 
 		 252 aa  107  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0814369  hitchhiker  0.00493265 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1920  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 248 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2556  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 248 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000796144 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  28.82 
 
 		 233 aa  108  1e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2532  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 248 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00685301  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1364  transcriptional regulator, GntR family  35.02 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1007  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.497463  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0783  GntR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>