More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2567 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2567  putative hydrolase protein  100 
 
 
275 aa  551  1e-156  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.230369  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2300  putative hydrolase protein  80 
 
 
275 aa  461  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000890498 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3240  alpha/beta hydrolase fold protein  37.25 
 
 
243 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0962986  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7519  alpha/beta hydrolase fold protein  33.46 
 
 
246 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.458705  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1925  alpha/beta hydrolase fold  33.06 
 
 
256 aa  104  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.167638  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1764  alpha/beta hydrolase fold protein  34.54 
 
 
261 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.922652 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2615  alpha/beta hydrolase fold  32 
 
 
248 aa  101  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.989556  normal  0.03074 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1567  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
261 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.151157 
 
 
-
 
NC_004310  BR1264  alpha/beta fold family hydrolase  29.88 
 
 
256 aa  97.4  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.669274  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1226  alpha/beta fold family hydrolase  30.29 
 
 
256 aa  97.8  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1112  alpha/beta hydrolase fold  31 
 
 
261 aa  96.7  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.64134 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0445  alpha/beta hydrolase fold  29.8 
 
 
257 aa  94  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0832  hydrolase, alpha/beta fold family protein  30.13 
 
 
257 aa  89.7  5e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.100419  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2545  hydrolase  33.2 
 
 
261 aa  87.8  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0377  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 
258 aa  85.9  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.303616  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7662  alpha/beta hydrolase fold protein  30.68 
 
 
254 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208122  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4138  alpha/beta hydrolase fold  40.44 
 
 
268 aa  84  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511306  normal  0.651356 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0925  alpha/beta hydrolase fold  29.15 
 
 
255 aa  83.2  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.497533  normal  0.160334 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3146  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 
250 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0833995  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6949  alpha/beta hydrolase fold  29.59 
 
 
254 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3917  alpha/beta hydrolase fold  27.91 
 
 
251 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.827272  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2134  alpha/beta hydrolase fold  27.38 
 
 
250 aa  82.4  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.470034  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0409  alpha/beta hydrolase fold protein  29.96 
 
 
258 aa  82  0.000000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.328487 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3289  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 
250 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.931458  normal  0.0266601 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5234  putative hydrolase  28.46 
 
 
249 aa  81.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373086  normal  0.217404 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1731  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 
251 aa  81.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0074  alpha/beta hydrolase fold protein  28.35 
 
 
255 aa  79  0.00000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.204649 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4204  alpha/beta hydrolase fold protein  41.09 
 
 
262 aa  78.2  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2612  alpha/beta hydrolase fold  30.17 
 
 
250 aa  77  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.899373  normal  0.0292589 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2178  alpha/beta hydrolase fold  28.96 
 
 
250 aa  76.3  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0705  alpha/beta hydrolase fold  26.77 
 
 
254 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3209  alpha/beta hydrolase fold  28.81 
 
 
250 aa  73.9  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2581  alpha/beta hydrolase fold  28.4 
 
 
250 aa  71.2  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.624662  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07970  lysophospholipase  38.02 
 
 
258 aa  69.7  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1649  hypothetical protein  31.35 
 
 
235 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.927129  normal  0.10741 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1411  alpha/beta hydrolase  30.89 
 
 
251 aa  63.2  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.731043  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22060  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  38.71 
 
 
262 aa  62.8  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00549421  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  39.13 
 
 
312 aa  62.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  39.31 
 
 
280 aa  62.8  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  40 
 
 
270 aa  62  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4204  alpha/beta hydrolase fold  31.86 
 
 
272 aa  62  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723787  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  36.07 
 
 
270 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3601  alpha/beta hydrolase fold protein  31.82 
 
 
264 aa  60.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.229176 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  33.61 
 
 
270 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  37.39 
 
 
312 aa  59.7  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2666  alpha/beta hydrolase fold  40.86 
 
 
257 aa  59.7  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  38.26 
 
 
312 aa  59.7  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  39.17 
 
 
271 aa  58.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3745  putative hydrolase  31.87 
 
 
224 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3019  putative hydrolase  31.47 
 
 
224 aa  57.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.757431  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0455  alpha/beta hydrolase fold  28.9 
 
 
250 aa  58.2  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0918  alpha/beta hydrolase fold  31.19 
 
 
255 aa  57.4  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.891406  normal  0.241554 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
270 aa  55.8  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  34.93 
 
 
309 aa  55.8  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4609  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  33.61 
 
 
270 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  33.61 
 
 
270 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  33.61 
 
 
270 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  33.61 
 
 
270 aa  55.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  33.61 
 
 
270 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  33.61 
 
 
270 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  33.61 
 
 
270 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  37.9 
 
 
272 aa  54.3  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  32.5 
 
 
270 aa  53.5  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2482  alpha/beta hydrolase fold protein  34.97 
 
 
264 aa  53.9  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  34.51 
 
 
301 aa  53.5  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2728  alpha/beta hydrolase fold  38.46 
 
 
271 aa  53.1  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.190242  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3130  alpha/beta hydrolase fold  30.98 
 
 
343 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0116924  normal  0.0589149 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3998  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 
344 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  0.902376 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  33.61 
 
 
289 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
301 aa  52  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3451  alpha/beta hydrolase fold protein  30.98 
 
 
340 aa  52  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  33.87 
 
 
273 aa  51.2  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0471  alpha/beta hydrolase fold protein  30.6 
 
 
267 aa  51.2  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6150  putative hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)(McbF)  36.52 
 
 
313 aa  50.8  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.681838 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  37.39 
 
 
313 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2962  proline iminopeptidase  28.21 
 
 
296 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.305011  normal  0.0401306 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  32.85 
 
 
323 aa  50.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  39.09 
 
 
315 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  32.73 
 
 
270 aa  50.4  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  36.44 
 
 
269 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3025  alpha/beta hydrolase fold  37.6 
 
 
344 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.4911  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  37.69 
 
 
291 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  29.67 
 
 
272 aa  50.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  37.69 
 
 
291 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  37.69 
 
 
291 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  27.74 
 
 
293 aa  49.7  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  37.17 
 
 
287 aa  49.7  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3327  alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 
340 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.445805 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  29.67 
 
 
267 aa  49.7  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  30.15 
 
 
291 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  31.71 
 
 
262 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3298  hypothetical protein  31.93 
 
 
258 aa  49.3  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.24994 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5604  alpha/beta hydrolase fold protein  29.02 
 
 
268 aa  49.7  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16228  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  35.2 
 
 
456 aa  49.7  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3399  alpha/beta hydrolase fold protein  24.81 
 
 
283 aa  49.3  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  33.14 
 
 
316 aa  49.3  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  34.51 
 
 
340 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18650  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  34.55 
 
 
350 aa  48.9  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303619  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1699  alpha/beta hydrolase fold  26.13 
 
 
254 aa  48.9  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6042  alpha/beta hydrolase fold  36.43 
 
 
298 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.567915  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>