More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1518 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1518  ABC transporter related  100 
 
 		 588 aa  1182    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3066  ABC transporter related  33.61 
 
 		 593 aa  334  2e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000101983  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0818  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  34.6 
 
 		 596 aa  299  1e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0830  ABC transporter, ATP-binding protein  35.13 
 
 		 596 aa  295  2e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0162208  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0817  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  31.88 
 
 		 603 aa  266  5e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0829  ABC transporter, ATP-binding protein  31.59 
 
 		 603 aa  265  2e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.588647  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3115  ABC transporter related  30.94 
 
 		 606 aa  254  4.0000000000000004e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1062  ABC transporter ATP-binding protein  28.78 
 
 		 625 aa  249  1e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.908887  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0315  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  30.7 
 
 		 594 aa  248  3e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0532583  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1061  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  31.38 
 
 		 594 aa  243  6e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00531558  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4332  ABC transporter related  28.6 
 
 		 614 aa  243  7.999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.754277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3067  ABC transporter related  32.42 
 
 		 616 aa  242  2e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000774728  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3116  ABC transporter related  28.84 
 
 		 610 aa  238  2e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1517  ABC transporter related  32.46 
 
 		 622 aa  232  1e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2200  ABC transporter related  25.98 
 
 		 626 aa  231  2e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.565977  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1189  ABC transporter related  29.73 
 
 		 586 aa  227  4e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00259948  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2522  ABC transporter, ATP-binding protein  31.66 
 
 		 608 aa  227  5.0000000000000005e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000536848  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0028  ABC transporter ATP-binding protein  28.74 
 
 		 624 aa  223  6e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.716088  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1897  ABC transporter, ATPase subunit  29.13 
 
 		 621 aa  219  7.999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.423681  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3260  ABC transporter related  24.88 
 
 		 623 aa  218  2e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3357  ABC transporter related  28.43 
 
 		 592 aa  217  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0029  ABC transporter ATP-binding protein  36.23 
 
 		 592 aa  217  5e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0444277  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2201  ABC transporter related  27.77 
 
 		 618 aa  217  5e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0878043  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0661  ABC transporter related  29.48 
 
 		 625 aa  216  5.9999999999999996e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2067  ABC transporter related  28.94 
 
 		 621 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.351689  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1982  ABC transporter-related protein  28.94 
 
 		 621 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.186428  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1915  ABC transporter related  32.34 
 
 		 613 aa  215  1.9999999999999998e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0404  ABC transporter related protein  27.56 
 
 		 609 aa  207  4e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4501  ABC transporter related  26.33 
 
 		 621 aa  206  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2000  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  43.07 
 
 		 566 aa  203  6e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0533598  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0894  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.66 
 
 		 600 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.652846  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2538  ABC transporter related  26.92 
 
 		 619 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3698  ABC transporter related  28.44 
 
 		 611 aa  202  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.736817 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0530  ABC transporter related  30.94 
 
 		 625 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2224  ABC transporter-like  29.22 
 
 		 604 aa  202  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2944  subtilin ABC transporter  28.9 
 
 		 597 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000010922  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5807  ABC transporter related  30.68 
 
 		 627 aa  196  9e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0603  ABC transporter-like protein  37.74 
 
 		 599 aa  196  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.131331 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1927  ABC transporter related  28.25 
 
 		 615 aa  195  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.682605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1248  ABC transporter related  27.88 
 
 		 604 aa  194  3e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0261442  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2524  ABC transporter, ATP-binding protein  39.43 
 
 		 423 aa  192  1e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00646333  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0429  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  38.4 
 
 		 618 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2085  ABC transporter related  38.4 
 
 		 618 aa  192  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.836292 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2541  ABC transporter related  30.92 
 
 		 613 aa  191  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684037 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7945  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.63 
 
 		 633 aa  189  9e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0478  ABC transporter related  30.06 
 
 		 611 aa  189  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0961856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1963  ABC transporter related  30.67 
 
 		 625 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0472516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2353  ABC transporter related  37.6 
 
 		 618 aa  188  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00656  ABC transporter ATP-binding protein  28.16 
 
 		 626 aa  187  4e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1247  ABC transporter related  27.88 
 
 		 611 aa  184  3e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2389  ABC transporter related  37.6 
 
 		 615 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.168027 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1838  ABC transporter related protein  37.15 
 
 		 611 aa  182  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355315  normal  0.263806 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0971  ABC transporter related protein  25.54 
 
 		 626 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0389  ABC transporter related protein  30.66 
 
 		 616 aa  181  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0061  ABC transporter related  25.45 
 
 		 606 aa  181  4e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2658  ABC transporter related  28.29 
 
 		 623 aa  180  7e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.0555578 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2183  ABC transporter related protein  40.32 
 
 		 608 aa  179  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3487  ABC transporter related protein  24.31 
 
 		 616 aa  179  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908956  normal  0.590401 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0151  ABC transporter related  36.5 
 
 		 595 aa  179  1e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.512349  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0721  ABC transporter related  37.24 
 
 		 621 aa  178  2e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.787703  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5831  ABC transporter related  27.31 
 
 		 633 aa  178  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1188  ABC transporter related  42.62 
 
 		 579 aa  177  4e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000012355  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2245  ABC transporter, transmembrane region  37.85 
 
 		 619 aa  176  7e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1469  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.73 
 
 		 582 aa  176  9e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3591  ABC transporter related protein  36.76 
 
 		 623 aa  176  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.727827  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1278  ABC transporter related protein  35.57 
 
 		 617 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2295  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  27.8 
 
 		 603 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000465139 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1891  multidrug ABC transporter  28.1 
 
 		 598 aa  173  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4902  ABC transporter related protein  32.98 
 
 		 628 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0234  ABC transporter ATP-binding protein  29.53 
 
 		 603 aa  173  9e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0768  ABC transporter related  31.52 
 
 		 610 aa  172  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2270  ABC transporter related  36.5 
 
 		 619 aa  172  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.903332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3203  ABC transporter related  36.47 
 
 		 617 aa  173  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1868  ABC transporter related  25.72 
 
 		 638 aa  172  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133041  normal  0.243769 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0617  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.52 
 
 		 609 aa  173  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0481  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  37.94 
 
 		 600 aa  172  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1807  ABC transporter related protein  32.68 
 
 		 662 aa  172  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0965737  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1366  ABC transporter related  36.18 
 
 		 609 aa  172  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00434177  normal  0.0240824 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1431  ABC transporter related  36.18 
 
 		 609 aa  172  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0505297  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0391  ABC transporter related  35.06 
 
 		 606 aa  172  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.905375 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2655  ABC transporter related  35 
 
 		 581 aa  172  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.399774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3296  ABC transporter related  34.1 
 
 		 588 aa  172  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3756  ABC transporter related  28.78 
 
 		 595 aa  171  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2169  ABC transporter related  36.65 
 
 		 617 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0397  carbohydrate ABC transporter  26.06 
 
 		 626 aa  171  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3128  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  36.18 
 
 		 609 aa  170  7e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0691  ABC transporter ATP-binding protein  37.5 
 
 		 609 aa  170  7e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0323  ABC transporter-related protein  28.66 
 
 		 608 aa  170  8e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1685  ABC transporter related  36.03 
 
 		 606 aa  170  8e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.801202  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00918  fused lipid transporter subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  30.95 
 
 		 582 aa  169  9e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.409137  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2729  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.95 
 
 		 582 aa  169  9e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1021  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.95 
 
 		 582 aa  169  9e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0261521  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2928  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  36.65 
 
 		 617 aa  169  9e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.398164  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00925  hypothetical protein  30.95 
 
 		 582 aa  169  9e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.433065  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1012  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.95 
 
 		 582 aa  169  9e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00350049  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2682  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.95 
 
 		 582 aa  169  9e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.316458 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2206  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.95 
 
 		 582 aa  169  9e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0719842  normal  0.317534 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2131  ABC transporter related  35.29 
 
 		 617 aa  169  9e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1075  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.95 
 
 		 582 aa  169  9e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2410  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.95 
 
 		 582 aa  169  9e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>