More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0904 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0904  Holliday junction DNA helicase RuvA  100 
 
 
195 aa  379  1e-104  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0181  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.72 
 
 
202 aa  151  5.9999999999999996e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.595877  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1915  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.28 
 
 
201 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2204  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.78 
 
 
201 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1076  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.29 
 
 
199 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131842  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1347  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.81 
 
 
199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119387  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0745  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.8 
 
 
199 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000883401  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1333  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.44 
 
 
203 aa  124  7e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000329731  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2671  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.88 
 
 
198 aa  123  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.103257  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1453  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.71 
 
 
187 aa  122  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.112528  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0931  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.5 
 
 
199 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.97537e-17 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1216  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.44 
 
 
189 aa  119  3e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.250827  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1661  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.18 
 
 
199 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133352  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3315  Holliday junction DNA helicase RuvA  36 
 
 
199 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0952  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.18 
 
 
197 aa  118  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2212  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.5 
 
 
204 aa  117  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1248  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.68 
 
 
200 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1414  Holliday junction DNA helicase RuvA  38 
 
 
199 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000662939  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2386  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  32.96 
 
 
200 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1013  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.67 
 
 
197 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15070  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  35.23 
 
 
199 aa  114  6.9999999999999995e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.180586  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0420  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.98 
 
 
200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17520  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  31.18 
 
 
206 aa  112  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.176122 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1754  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.98 
 
 
200 aa  112  3e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000623811  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1344  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  31.21 
 
 
196 aa  112  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.151452  normal  0.533304 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1010  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.01 
 
 
197 aa  112  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.806868  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2064  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.54 
 
 
206 aa  112  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2905  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.2 
 
 
204 aa  111  7.000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.366229  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3832  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.07 
 
 
194 aa  110  9e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0457  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.16 
 
 
204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0310  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.5 
 
 
194 aa  110  1.0000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.966825  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1369  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.11 
 
 
205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0441824 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0086  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.1 
 
 
192 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3626  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.94 
 
 
198 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0674583  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1691  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.98 
 
 
198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4506  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.8 
 
 
205 aa  109  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0564328  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4316  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.8 
 
 
205 aa  109  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104076  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4154  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.8 
 
 
205 aa  109  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000374115  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4165  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.8 
 
 
205 aa  109  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000436229  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4555  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.8 
 
 
205 aa  109  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00127574  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4500  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.8 
 
 
541 aa  109  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049576 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4651  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.8 
 
 
205 aa  109  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00216004  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4268  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.31 
 
 
205 aa  108  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00764236  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0695  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.61 
 
 
205 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000711774  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3138  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.8 
 
 
205 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000211786  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4725  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.06 
 
 
202 aa  108  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.453465 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4540  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.31 
 
 
205 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000252775  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1795  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.13 
 
 
202 aa  108  6e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.115786  normal  0.0993939 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2301  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.72 
 
 
197 aa  108  6e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01215  Holliday junction DNA helicase motor protein  35.71 
 
 
193 aa  108  6e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2477  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.55 
 
 
194 aa  108  7.000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.389677  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0726  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.5 
 
 
198 aa  107  7.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3827  Holliday junction DNA helicase RuvA  27.86 
 
 
200 aa  107  8.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0335606  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2140  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.33 
 
 
199 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.497203  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2337  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.34 
 
 
197 aa  106  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.194735  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1370  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  30.94 
 
 
247 aa  106  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.903698  normal  0.141681 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0422  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.39 
 
 
200 aa  106  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.488567  normal  0.0220774 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3395  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.81 
 
 
207 aa  106  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00278946  hitchhiker  0.00000769998 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0452  Holliday junction resolvasome DNA-binding subunit  31.11 
 
 
208 aa  106  3e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0798924  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1088  DNA recombination protein RuvA  34.25 
 
 
212 aa  105  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.153708  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0891  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.27 
 
 
195 aa  106  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0818688 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0112  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.28 
 
 
201 aa  105  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2516  Holliday junction DNA helicase RuvA  35 
 
 
197 aa  105  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1758  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.44 
 
 
200 aa  105  5e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000583338  normal  0.326714 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2110  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.11 
 
 
202 aa  105  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0297912  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0028  Holliday junction DNA helicase  37.37 
 
 
199 aa  105  5e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.591728 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13950  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  33.71 
 
 
205 aa  105  6e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.190718  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0321  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.98 
 
 
203 aa  104  6e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0390  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.93 
 
 
200 aa  104  7e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1409  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.15 
 
 
202 aa  104  8e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.103613  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0837  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.39 
 
 
209 aa  104  8e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2189  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.34 
 
 
200 aa  103  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000251944  normal  0.355786 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2305  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.95 
 
 
196 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.765847 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4502  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.98 
 
 
198 aa  103  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_384  Holliday junction DNA helicase  34.2 
 
 
194 aa  103  1e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1746  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.16 
 
 
204 aa  103  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal  0.827108 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2266  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.95 
 
 
196 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0074  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.33 
 
 
196 aa  103  1e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000176454  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2313  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.95 
 
 
196 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0442  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.85 
 
 
194 aa  102  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07040  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  31.82 
 
 
197 aa  103  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00385536  normal  0.295964 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3978  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.15 
 
 
202 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0282687  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1652  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.04 
 
 
193 aa  103  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3054  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.53 
 
 
209 aa  103  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.6375 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15330  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  30.34 
 
 
209 aa  102  3e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.436101  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2032  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.65 
 
 
213 aa  102  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000340991 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4464  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.06 
 
 
196 aa  102  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.623837 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1112  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.1 
 
 
197 aa  102  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.810212  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1222  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.49 
 
 
201 aa  102  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.550433  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0527  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.32 
 
 
199 aa  102  4e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2096  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.36 
 
 
196 aa  102  4e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1446  hypothetical protein  34.01 
 
 
194 aa  102  4e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2134  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.55 
 
 
195 aa  102  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.856024  hitchhiker  0.000118824 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4202  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.88 
 
 
205 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173502  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1216  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.88 
 
 
205 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.210399  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1993  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.79 
 
 
200 aa  101  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0230385 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0893  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.49 
 
 
200 aa  102  5e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000557116  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0993  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.5 
 
 
197 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.257053  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1245  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.88 
 
 
205 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738267  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1115  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.71 
 
 
197 aa  101  6e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>