205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0982 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0982  degV family protein  100 
 
 		 342 aa  711    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09160  degV family protein  44.92 
 
 		 311 aa  244  9.999999999999999e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.356982  normal  0.378413 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16140  hypothetical protein  42.07 
 
 		 308 aa  234  1.0000000000000001e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224707 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1150  degV family protein  42.81 
 
 		 309 aa  229  5e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.444716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09150  hypothetical protein  37.46 
 
 		 309 aa  205  7e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000277277  normal  0.476622 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0030  degV family protein  31.38 
 
 		 291 aa  144  3e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1061  degV family protein  29.9 
 
 		 294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0946944  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1951  degV family protein  31.47 
 
 		 286 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33596  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0869  degV family protein  33.68 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2258  degV family protein  29.72 
 
 		 293 aa  132  6.999999999999999e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0884307  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0211  DegV family protein  32.53 
 
 		 286 aa  132  9e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.187112  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0716  degV family protein  29.97 
 
 		 287 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0030  degV family protein  31.03 
 
 		 291 aa  130  3e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2602  DegV family protein  29.72 
 
 		 286 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00489344  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1056  degV family protein  29.69 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.162419  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0124  hypothetical protein  29.66 
 
 		 286 aa  127  3e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2918  degV family protein  29.37 
 
 		 286 aa  126  5e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1542  degV family protein  29.72 
 
 		 287 aa  126  6e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2677  degV family protein  29.72 
 
 		 286 aa  126  6e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000367338  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2876  degV family protein  29.02 
 
 		 286 aa  125  9e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000561682 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2679  degV family protein  29.02 
 
 		 286 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.776437  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2629  DegV family protein  29.02 
 
 		 286 aa  125  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2872  degV family protein  29.02 
 
 		 286 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.428011  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2359  degV family protein  29.02 
 
 		 286 aa  124  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823292  normal  0.669443 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1556  degV family protein  29.39 
 
 		 292 aa  124  3e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0165981 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10840  degV family protein  29.55 
 
 		 291 aa  122  9e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00470044  unclonable  0.00000000186001 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  29.23 
 
 		 279 aa  121  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2886  degV family protein  28.32 
 
 		 286 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2906  degV family protein  28.32 
 
 		 286 aa  120  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00204393  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1740  degV family protein  30.07 
 
 		 280 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3275  degV family protein  29.9 
 
 		 292 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000632597  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3343  degV family protein  29.21 
 
 		 289 aa  117  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000215363  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2132  degV family protein  29.37 
 
 		 280 aa  117  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2746  degV family protein  29.68 
 
 		 281 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000295116  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2816  degV family protein  26.53 
 
 		 293 aa  114  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126617  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1587  degV family protein  27.53 
 
 		 280 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000247514  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04370  degV family protein  27.87 
 
 		 285 aa  112  6e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1743  degV family protein  28.47 
 
 		 281 aa  112  9e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0123277 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2064  hypothetical protein  27.4 
 
 		 289 aa  110  4.0000000000000004e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0791292  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1121  degV family protein  26.26 
 
 		 294 aa  106  6e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1077  degV family protein  27.84 
 
 		 281 aa  106  7e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.13132  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0606  DegV family protein  26.1 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0915  degV family protein  30.82 
 
 		 285 aa  105  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0196903  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0851  degV family protein  25.33 
 
 		 303 aa  104  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.427219  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2314  degV family protein  26.53 
 
 		 312 aa  103  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00036475  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1032  degV family protein  30 
 
 		 284 aa  102  7e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.185654  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1558  DegV family protein  25.26 
 
 		 295 aa  102  7e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1050  DegV  27.42 
 
 		 311 aa  102  1e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1264  degV family protein  26.83 
 
 		 279 aa  101  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06330  degV family protein  25.52 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.139961 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1078  degV family protein  27.18 
 
 		 310 aa  100  3e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.159069  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1049  DegV  27.15 
 
 		 281 aa  99.8  5e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1047  DegV  26.39 
 
 		 279 aa  100  5e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0296  degV family protein  27.78 
 
 		 283 aa  99  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14660  degV family protein  29.25 
 
 		 282 aa  97.8  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000206082  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0301  degV family protein  27.43 
 
 		 283 aa  97.4  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.173313  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1346  degV family protein  26.83 
 
 		 285 aa  97.8  3e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000423289  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1500  hypothetical protein  24.39 
 
 		 281 aa  97.1  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.886569  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0903  degV family protein  25.09 
 
 		 282 aa  97.1  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.964833  normal  0.127362 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14080  degV family protein  26.21 
 
 		 290 aa  96.7  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000464693  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3733  degV family protein  26.33 
 
 		 280 aa  95.9  8e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1648  degV family protein  26.92 
 
 		 280 aa  95.9  9e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000062676  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1267  degV family protein  27.42 
 
 		 311 aa  95.5  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3096  degV family protein  26.13 
 
 		 287 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  1.30761e-16 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1310  degV family protein  26.06 
 
 		 292 aa  95.9  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1107  degV family protein  28.32 
 
 		 282 aa  95.5  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_903  DegV  29.96 
 
 		 285 aa  94.4  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00149031  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2228  degV family protein  26.13 
 
 		 280 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000426041  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2832  degV family protein  27.53 
 
 		 281 aa  94.4  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2357  degV family protein  26.13 
 
 		 287 aa  94  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000321528  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3318  degV family protein  26.41 
 
 		 282 aa  94  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2272  degV family protein  26.13 
 
 		 287 aa  94  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27553e-41 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2554  degV family protein  29.69 
 
 		 279 aa  94.4  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000605397  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2031  DegV family protein  26.13 
 
 		 280 aa  93.6  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2029  DegV family protein  26.13 
 
 		 280 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367646  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2276  degV family protein  26.13 
 
 		 280 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000585321  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1607  degV family protein  29.91 
 
 		 285 aa  93.2  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1050  hypothetical protein  25.17 
 
 		 283 aa  93.2  6e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2518  degV family protein  27.18 
 
 		 281 aa  92.8  7e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2801  degV family protein  25 
 
 		 284 aa  92.8  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00587122  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1080  hypothetical protein  29.66 
 
 		 293 aa  92  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.670701  normal  0.358327 
 
 
-
 
NC_002936  DET1265  degV family protein  27.59 
 
 		 281 aa  91.3  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1901  hypothetical protein  27.53 
 
 		 281 aa  91.7  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1048  DegV  28.92 
 
 		 280 aa  91.3  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.925497  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1075  degV family protein  25.95 
 
 		 279 aa  91.7  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0973769  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17990  degV family protein  29.05 
 
 		 285 aa  90.9  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.980655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5642  degV family protein  25.78 
 
 		 280 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00000000000040368 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5316  degV family protein  25.78 
 
 		 280 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5304  degV family protein  26.06 
 
 		 280 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5362  degV family protein  26.06 
 
 		 280 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1076  degV family protein  28.22 
 
 		 280 aa  90.1  5e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313955  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1266  degV family protein  26.48 
 
 		 276 aa  89.7  7e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0416  DegV family protein  24.64 
 
 		 288 aa  89.7  7e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1102  degV family protein  28.77 
 
 		 285 aa  89.7  7e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3042  degV family protein  26.22 
 
 		 281 aa  89.7  7e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00021741  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4890  degV family protein  25.7 
 
 		 280 aa  89.4  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4990  degV family protein  24.91 
 
 		 280 aa  89.4  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4875  degV family protein  25.7 
 
 		 280 aa  89  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2246  degV family protein  25.95 
 
 		 282 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152108  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5430  degV family protein  25.7 
 
 		 280 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>