More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0740 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0740  peptide methionine sulfoxide reductase  100 
 
 		 162 aa  336  7e-92  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.800973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1839  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  63.98 
 
 		 348 aa  226  8e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.94451  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1633  peptide methionine sulfoxide reductase family protein  60.87 
 
 		 346 aa  216  8.999999999999998e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00891353  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1314  peptide methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  62.03 
 
 		 316 aa  214  5e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.147945  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1279  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  60.25 
 
 		 337 aa  212  1.9999999999999998e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0709  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  55.9 
 
 		 317 aa  197  3.9999999999999996e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00161368  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0249  methionine-R-sulfoxide reductase  55.28 
 
 		 309 aa  187  4e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05500  methionine-R-sulfoxide reductase/methionine-S-sulfoxide reductase  57.42 
 
 		 385 aa  187  5e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04460  methionine-R-sulfoxide reductase/methionine-S-sulfoxide reductase  53.55 
 
 		 735 aa  187  5e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.361205  normal  0.714911 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1687  peptide methionine sulfoxide reductase msrA/msrB  56.88 
 
 		 170 aa  186  1e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1085  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  49.69 
 
 		 332 aa  185  2e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2913  methionine sulfoxide reductase A  56.05 
 
 		 157 aa  184  6e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.169156  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2591  methionine sulfoxide reductase A  56.05 
 
 		 157 aa  183  8e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1893  methionine-R-sulfoxide reductase  54.49 
 
 		 405 aa  181  4.0000000000000006e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00784315  unclonable  2.29788e-16 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0906  methionine-R-sulfoxide reductase  56.49 
 
 		 375 aa  181  4.0000000000000006e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1374  trifunctional thioredoxin/methionine sulfoxide reductase A/B protein  55.84 
 
 		 590 aa  180  6e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147038 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0556  peptide methionine sulfoxide reductase  55.56 
 
 		 162 aa  179  1e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0722  peptide methionine sulfoxide reductase msrA/msrB  57.24 
 
 		 309 aa  177  7e-44  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.957852  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1088  trifunctional thioredoxin/methionine sulfoxide reductase A/B protein  52.94 
 
 		 611 aa  175  2e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.541227 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1385  methionine-R-sulfoxide reductase  49.09 
 
 		 359 aa  171  2.9999999999999996e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1045  methionine-R-sulfoxide reductase  52.6 
 
 		 364 aa  171  3.9999999999999995e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1502  peptide methionine sulfoxide reductase  55.63 
 
 		 166 aa  169  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.859689  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0286  methionine sulfoxide reductase A  45.12 
 
 		 165 aa  168  3e-41  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4592  methionine-R-sulfoxide reductase  50.31 
 
 		 368 aa  168  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2088  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  53.95 
 
 		 352 aa  164  5.9999999999999996e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2259  peptide methionine sulfoxide reductase  46.39 
 
 		 177 aa  163  8e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00118582  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf807  peptide methionine sulfoxide reductase A  49.03 
 
 		 156 aa  156  1e-37  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl050  methionine sulfoxide reductase A  47.47 
 
 		 163 aa  154  6e-37  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0592  hypothetical protein  51.95 
 
 		 329 aa  148  2e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000314472  hitchhiker  0.000621287 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1363  peptide methionine sulfoxide reductase-like protein  49.34 
 
 		 338 aa  149  2e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.312066  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3719  peptide methionine sulfoxide reductase  47.44 
 
 		 183 aa  142  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.836534  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3952  peptide methionine sulfoxide reductase  44.23 
 
 		 178 aa  137  7.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106741  normal  0.0202852 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1855  peptide methionine sulfoxide reductase  42.77 
 
 		 219 aa  136  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.600225  hitchhiker  0.000343037 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1866  peptide methionine sulfoxide reductase  40.96 
 
 		 211 aa  133  8e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0773465  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2030  peptide methionine sulfoxide reductase  43.4 
 
 		 181 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0766611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2598  peptide methionine sulfoxide reductase  42.58 
 
 		 180 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1839  peptide methionine sulfoxide reductase  42.77 
 
 		 181 aa  131  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.914253  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000703  methionine sulfoxide reductase  42.77 
 
 		 157 aa  131  5e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4335  peptide methionine sulfoxide reductase  41.4 
 
 		 162 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0190  methionine sulfoxide reductase A  39.38 
 
 		 176 aa  130  9e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06586  methionine sulfoxide reductase A  42.76 
 
 		 160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2814  peptide methionine sulfoxide reductase  43.42 
 
 		 179 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.842092 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3045  peptide methionine sulfoxide reductase  42.76 
 
 		 186 aa  129  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.735862  normal  0.359715 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2923  peptide methionine sulfoxide reductase  40 
 
 		 191 aa  128  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.634887 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0740  methionine sulfoxide reductase A  41.83 
 
 		 165 aa  128  4.0000000000000003e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0698569  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1172  peptide methionine sulfoxide reductase  42.57 
 
 		 175 aa  127  9.000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0382873  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0222  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  40.27 
 
 		 311 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.763171  hitchhiker  3.90951e-21 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0665  methionine sulfoxide reductase A  41.18 
 
 		 165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.215107  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  42.21 
 
 		 334 aa  125  3e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00174271  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1135  peptide methionine sulfoxide reductase  41.51 
 
 		 179 aa  124  5e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1949  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  38.06 
 
 		 351 aa  124  5e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00200432  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0714  peptide methionine sulfoxide reductase  43.79 
 
 		 277 aa  124  6e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168728  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1674  peptide methionine sulfoxide reductase  42.95 
 
 		 180 aa  124  7e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4142  methionine sulfoxide reductase A  40.67 
 
 		 186 aa  124  7e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330473  normal  0.0121487 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0128  methionine sulfoxide reductase A  39.33 
 
 		 179 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00332442  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6406  methionine sulfoxide reductase A  40.94 
 
 		 168 aa  123  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0595375  normal  0.568144 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2948  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  40.13 
 
 		 322 aa  123  9e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2741  methionine sulfoxide reductase A  42.77 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2684  methionine sulfoxide reductase A  42.77 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1497  peptide methionine sulfoxide reductase  40.25 
 
 		 191 aa  122  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3784  methionine sulfoxide reductase A  40.26 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5202  peptide methionine sulfoxide reductase  39.62 
 
 		 180 aa  122  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3429  peptide methionine sulfoxide reductase  39.22 
 
 		 262 aa  122  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.737343  normal  0.0264207 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1749  peptide methionine sulfoxide reductase  36.48 
 
 		 182 aa  122  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4325  methionine sulfoxide reductase A  38.12 
 
 		 166 aa  122  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0725  peptide methionine sulfoxide reductase  43.14 
 
 		 186 aa  122  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.253534 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3367  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/MsrB  36.65 
 
 		 456 aa  122  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3364  methionine sulfoxide reductase A  39.33 
 
 		 186 aa  121  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5903  protein-methionine-S-oxide reductase  43.23 
 
 		 199 aa  121  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.478627 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2804  methionine sulfoxide reductase A  37.97 
 
 		 171 aa  121  4e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.961947  normal  0.595065 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  40.26 
 
 		 184 aa  121  4e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0974  peptide methionine sulfoxide reductase  41.46 
 
 		 214 aa  121  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2967  methionine sulfoxide reductase A  37.97 
 
 		 170 aa  121  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2638  methionine sulfoxide reductase A  41.61 
 
 		 173 aa  121  5e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00490815  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1362  methionine sulfoxide reductase A  39.22 
 
 		 165 aa  121  5e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.526795  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1960  peptide methionine sulfoxide reductase  41.83 
 
 		 186 aa  120  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.723901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2571  peptide methionine sulfoxide reductase  41.83 
 
 		 186 aa  120  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10562  peptide methionine sulfoxide reductase (Eurofung)  38.18 
 
 		 213 aa  120  7e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.53989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2595  peptide methionine sulfoxide reductase  43.23 
 
 		 186 aa  120  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0918  peptide methionine sulfoxide reductase  43.04 
 
 		 220 aa  120  7e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.121013 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2782  methionine sulfoxide reductase A  37.33 
 
 		 169 aa  120  8e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902177  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09051  peptide methionine sulfoxide reductase  39.73 
 
 		 242 aa  120  9e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5572  methionine sulfoxide reductase A  37.97 
 
 		 168 aa  120  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.974641  normal  0.0628347 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2934  methionine-S-oxide reductase  40.67 
 
 		 182 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4424  peptide methionine sulfoxide reductase  40.12 
 
 		 223 aa  119  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00185603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0163  peptide methionine sulfoxide reductase  39.29 
 
 		 238 aa  120  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1591  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  38.96 
 
 		 305 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001695  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  39.16 
 
 		 212 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0163  methionine sulfoxide reductase A  38 
 
 		 172 aa  120  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.22349  normal  0.399743 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0652  peptide methionine sulfoxide reductase  40.54 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0153224  normal  0.157322 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0271  peptide methionine sulfoxide reductase  36.94 
 
 		 201 aa  119  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.453594  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0655  peptide methionine sulfoxide reductase  43.14 
 
 		 287 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0461756  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0897  methionine-S-sulfoxide reductase  43.14 
 
 		 287 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0812  methionine sulfoxide reductase A  38.67 
 
 		 180 aa  119  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1058  peptide methionine sulfoxide reductase  43.14 
 
 		 293 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2491  peptide methionine sulfoxide reductase  43.14 
 
 		 185 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137451  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2243  peptide methionine sulfoxide reductase  37.58 
 
 		 173 aa  118  3e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.252579 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2540  peptide methionine sulfoxide reductase  39.75 
 
 		 220 aa  119  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2491  peptide methionine sulfoxide reductase  42.58 
 
 		 186 aa  118  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.697588  normal  0.995502 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2619  peptide methionine sulfoxide reductase  42.58 
 
 		 186 aa  118  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.79029  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>