More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0850 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0850  RNA methyltransferase, TrmA family  100 
 
 		 407 aa  840    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0855  RNA methyltransferase  51.77 
 
 		 493 aa  462  1e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_16911  predicted protein  46.54 
 
 		 378 aa  344  2e-93  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00141  tRNA methyltransferase (Eurofung)  38.91 
 
 		 575 aa  286  7e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.6437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51919  tRNA(m5U54)methyltransferase  35.19 
 
 		 560 aa  266  5.999999999999999e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00837808  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03280  tRNA methyltransferase, putative  35.12 
 
 		 613 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1295  RNA methyltransferase, TrmA family  35.94 
 
 		 436 aa  230  4e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0311  RNA methyltransferase  30.55 
 
 		 458 aa  220  3e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2225  tRNA (uracil-5-) -methyltransferase  31.91 
 
 		 419 aa  218  1e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0301  RNA methyltransferase  30.24 
 
 		 458 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0305  RNA methyltransferase  30.24 
 
 		 458 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0517475  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0241  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  32.81 
 
 		 455 aa  213  2.9999999999999995e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468571  normal  0.547918 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0407  RNA methyltransferase, TrmA family  30.02 
 
 		 458 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0337  RNA methyltransferase, TrmA family  31.86 
 
 		 459 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.95395  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0363  RNA methyltransferase  29.96 
 
 		 460 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0365  RNA methyltransferase, TrmA family  30.02 
 
 		 458 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1751  RNA methyltransferase  30.18 
 
 		 453 aa  213  5.999999999999999e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216476  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50774  RNA methyltransferase tRNA(m5U54)methyltransferase  33.63 
 
 		 542 aa  212  7e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.2179 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0381  RNA methyltransferase, TrmA family  30.02 
 
 		 454 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.432112  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2737  RNA methyltransferase  32.11 
 
 		 476 aa  212  1e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4938  RNA methyltransferase, TrmA family  30.02 
 
 		 454 aa  212  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0464028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0170  RNA methyltransferase, TrmA family  34.59 
 
 		 405 aa  211  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2909  RNA methyltransferase, TrmA family  31.91 
 
 		 488 aa  211  2e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.501194  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0318  RNA methyltransferase  29.8 
 
 		 458 aa  210  4e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.875741  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0333  RNA methyltransferase  29.8 
 
 		 458 aa  210  4e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0313  RNA methyltransferase  29.8 
 
 		 458 aa  210  5e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2704  RNA methyltransferase, TrmA family  32.83 
 
 		 397 aa  209  6e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000380281  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1783  RNA methyltransferase  33.56 
 
 		 446 aa  206  4e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4802  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  30.27 
 
 		 485 aa  206  6e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.810738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2332  RNA methyltransferase, TrmA family  31.2 
 
 		 478 aa  205  1e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.45026 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2557  RNA methyltransferase, TrmA family  31.59 
 
 		 466 aa  204  3e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1849  RNA methyltransferase, TrmA family  33.56 
 
 		 437 aa  203  4e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0159  RNA methyltransferase  29.78 
 
 		 468 aa  203  5e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1197  RNA methyltransferase  30.36 
 
 		 454 aa  202  8e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000142692  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2868  RNA methyltransferase, TrmA family  29.19 
 
 		 460 aa  200  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00253017  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4122  RNA methyltransferase, TrmA family  31.28 
 
 		 461 aa  199  5e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.840048 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4083  RNA methyltransferase, TrmA family  31.28 
 
 		 461 aa  199  5e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2144  RNA methyltransferase  32.21 
 
 		 439 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.090086  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2126  23S rRNA methyltransferase  30.97 
 
 		 476 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.965938  normal  0.654469 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3654  TrmA family RNA methyltransferase  30.51 
 
 		 455 aa  198  2.0000000000000003e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.412422  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1493  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  29.31 
 
 		 450 aa  197  3e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00115343  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1452  RNA methyltransferase  32.75 
 
 		 495 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2518  RNA methyltransferase, TrmA family  30.47 
 
 		 482 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.391256  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2200  RNA methyltransferase, TrmA family  31.47 
 
 		 414 aa  195  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0690  RNA methyltransferase, TrmA family  28.99 
 
 		 449 aa  194  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3305  RNA methyltransferase, TrmA family  29.73 
 
 		 460 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0357  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  29.36 
 
 		 455 aa  194  3e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3634  23S rRNA methyltransferase/RumA  31.17 
 
 		 460 aa  193  4e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0391  RNA methyltransferase, TrmA family  31.33 
 
 		 457 aa  193  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2558  RNA methyltransferase, TrmA family  29.89 
 
 		 480 aa  192  6e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2261  RNA methyltransferase  28.86 
 
 		 457 aa  192  7e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000592232  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0782  RNA methyltransferase, TrmA family  31.97 
 
 		 456 aa  192  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.14607  normal  0.115427 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0348  RNA methyltransferase  29.14 
 
 		 455 aa  192  1e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.359971  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4832  RNA methyltransferase, TrmA family  29.82 
 
 		 459 aa  192  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000374128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0703  RNA methyltransferase, TrmA family  28.03 
 
 		 448 aa  191  1e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0542  RNA methyltransferase  29.89 
 
 		 459 aa  191  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.016081  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03000  RNA methyltransferase, TrmA family  32.45 
 
 		 453 aa  191  2.9999999999999997e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0406  RNA methyltransferase  29.98 
 
 		 459 aa  190  4e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2158  RNA methyltransferase, TrmA family  33.94 
 
 		 438 aa  189  8e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0414  RNA methyltransferase  29.45 
 
 		 459 aa  189  9e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.340399  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0426  RNA methyltransferase  29.45 
 
 		 459 aa  189  9e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0412  RNA methyltransferase  29.1 
 
 		 458 aa  188  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0404  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase  29.45 
 
 		 459 aa  189  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.039244  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0400  RNA methyltransferase  29.45 
 
 		 459 aa  189  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.955809  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0472  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  29.45 
 
 		 459 aa  189  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0542  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  29.67 
 
 		 459 aa  189  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000351254  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0491  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  29.45 
 
 		 459 aa  189  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116806  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0467  RNA methyltransferase, TrmA family  28.73 
 
 		 454 aa  187  4e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1252  RNA methyltransferase  29.75 
 
 		 440 aa  186  7e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0113803  normal  0.599775 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2028  23S rRNA methyltransferase/RumA  28.32 
 
 		 477 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0232  RNA methyltransferase, TrmA family  29.37 
 
 		 419 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000193721  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2060  RNA methyltransferase  29.35 
 
 		 468 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.23059 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1235  RNA methyltransferase, TrmA family  29.31 
 
 		 462 aa  184  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0005  TrmA family RNA methyltransferase  30.24 
 
 		 468 aa  184  3e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1438  RNA methyltransferase  28.98 
 
 		 459 aa  183  4.0000000000000006e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2801  RNA methyltransferase  29.14 
 
 		 470 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0428  RNA methyltransferase, TrmA family  29.31 
 
 		 460 aa  182  7e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1722  RNA methyltransferase  27.31 
 
 		 439 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1583  RNA methyltransferase, TrmA family  30.07 
 
 		 446 aa  182  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000730131  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1032  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  30 
 
 		 443 aa  181  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0127983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1551  RNA methyltransferase  30.95 
 
 		 434 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000011157  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2194  RNA methyltransferase  30.89 
 
 		 407 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1383  RNA methyltransferase, TrmA family  30.56 
 
 		 479 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2157  RNA methyltransferase, TrmA family  31.59 
 
 		 471 aa  179  7e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.615925  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1308  RNA methyltransferase, TrmA family  28.51 
 
 		 467 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1835  23S rRNA methyltransferase/RumA  34.09 
 
 		 440 aa  178  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0118794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1649  RNA methyltransferase  26.86 
 
 		 439 aa  177  3e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2518  RNA methyltransferase  28.91 
 
 		 479 aa  177  4e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1095  RNA methyltransferase  28.66 
 
 		 465 aa  176  7e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.31205 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0702  tRNA methyltransferase, TrmA family  28.03 
 
 		 453 aa  176  7e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.307327  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1216  RNA methyltransferase  28.64 
 
 		 452 aa  176  8e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2369  RNA methyltransferase  28.79 
 
 		 489 aa  176  9e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1321200000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1286  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  26.83 
 
 		 442 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0270354  unclonable  0.00000000011365 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3354  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  27.75 
 
 		 443 aa  173  5e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0093271  hitchhiker  0.000473524 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1628  RNA methyltransferase, TrmA family  27.97 
 
 		 415 aa  173  5.999999999999999e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000158934  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2283  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  31.98 
 
 		 407 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.343326  normal  0.393981 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1985  RNA methyltransferase  27.46 
 
 		 453 aa  172  9e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1951  RNA methyltransferase  27.46 
 
 		 453 aa  172  9e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.602794  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24220  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  31.92 
 
 		 399 aa  172  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.553679  normal  0.147194 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1435  RNA methyltransferase  27.29 
 
 		 456 aa  172  1e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>