More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0673 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0673  translation elongation factor Ts  100 
 
 
292 aa  586  1e-166  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  41.78 
 
 
311 aa  229  6e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2012  elongation factor Ts  41.08 
 
 
288 aa  227  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.895136  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2109  elongation factor Ts  42.01 
 
 
287 aa  224  2e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1942  translation elongation factor Ts  42.91 
 
 
286 aa  222  6e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1317  elongation factor Ts  45.21 
 
 
293 aa  220  3e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0770709  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1343  elongation factor Ts  45.21 
 
 
293 aa  220  3e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00203817  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08140  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  44.37 
 
 
288 aa  216  2.9999999999999998e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.104482  hitchhiker  0.0000000435268 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3267  elongation factor Ts  41.89 
 
 
308 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.285007  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  47.6 
 
 
294 aa  215  5.9999999999999996e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07660  translation elongation factor Ts  41.92 
 
 
299 aa  215  8e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000136741  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1809  elongation factor Ts  39.73 
 
 
288 aa  214  9.999999999999999e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.864602  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0584  elongation factor Ts  41.84 
 
 
307 aa  214  9.999999999999999e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.227112  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  46.05 
 
 
294 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000657358  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2804  elongation factor Ts  41.81 
 
 
312 aa  214  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00290624  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1381  elongation factor Ts  42 
 
 
312 aa  213  1.9999999999999998e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.281717  normal  0.0336463 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2827  elongation factor Ts  41.55 
 
 
308 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161224  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1132  elongation factor Ts  40.68 
 
 
307 aa  212  5.999999999999999e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0347  elongation factor Ts  40.27 
 
 
286 aa  212  7e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4882  translation elongation factor Ts  39.06 
 
 
314 aa  212  7e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0824  elongation factor Ts  43.94 
 
 
292 aa  210  3e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.343857  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2856  elongation factor Ts  41.22 
 
 
308 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0706  translation elongation factor Ts  41.58 
 
 
290 aa  209  4e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000134038  unclonable  0.0000000259641 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1382  elongation factor Ts  40.14 
 
 
307 aa  207  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1841  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  40 
 
 
303 aa  207  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1647  elongation factor Ts  41.61 
 
 
288 aa  207  2e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2437  elongation factor Ts  41.55 
 
 
308 aa  205  8e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.223909  normal  0.179071 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0404  elongation factor Ts  40.54 
 
 
288 aa  204  1e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0113  translation elongation factor Ts  42.32 
 
 
279 aa  204  1e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00747811  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2030  elongation factor Ts  40.82 
 
 
310 aa  204  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  38.54 
 
 
294 aa  204  2e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0008  translation elongation factor Ts  39.45 
 
 
276 aa  203  2e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1671  elongation factor Ts  41.52 
 
 
303 aa  203  2e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000532175  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1953  elongation factor Ts  41.52 
 
 
303 aa  203  4e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.055152  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3677  elongation factor Ts  43.49 
 
 
295 aa  202  7e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0354011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3567  elongation factor Ts  43.49 
 
 
295 aa  202  7e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000987514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3585  elongation factor Ts  43.49 
 
 
295 aa  202  7e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.425648  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3964  elongation factor Ts  43.49 
 
 
295 aa  202  7e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000429522  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3838  elongation factor Ts  43.49 
 
 
295 aa  202  7e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.61449e-62 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  40.61 
 
 
291 aa  202  7e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3649  elongation factor Ts  43.49 
 
 
295 aa  202  7e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3867  elongation factor Ts  43.49 
 
 
295 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000442897  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3873  elongation factor Ts  43.49 
 
 
295 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000877189  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2525  elongation factor Ts  37.71 
 
 
308 aa  201  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2009  elongation factor Ts  38.85 
 
 
288 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.974117  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3924  elongation factor Ts  43.15 
 
 
295 aa  200  3e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1319  elongation factor Ts  43.15 
 
 
295 aa  199  3e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000605396  hitchhiker  4.6093e-17 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1920  translation elongation factor Ts  41.1 
 
 
303 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1869799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0425  elongation factor Ts  38.51 
 
 
288 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.141964  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  39.58 
 
 
291 aa  199  5e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2060  elongation factor Ts  37.16 
 
 
313 aa  199  6e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4516  elongation factor Ts  41.52 
 
 
300 aa  199  6e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1587  elongation factor Ts  40.67 
 
 
309 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.612941  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1777  elongation factor Ts  40.6 
 
 
308 aa  198  9e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12260  translation elongation factor Ts  41.24 
 
 
288 aa  198  9e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000728312  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1959  elongation factor Ts  41.41 
 
 
308 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2478  elongation factor Ts  43.15 
 
 
295 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000742116  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  38.89 
 
 
292 aa  197  1.0000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2352  elongation factor Ts  38.98 
 
 
288 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000872397  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1695  elongation factor Ts  39.86 
 
 
307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  39.32 
 
 
310 aa  196  4.0000000000000005e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000300093  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  40.55 
 
 
285 aa  196  5.000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1858  elongation factor Ts  39.19 
 
 
307 aa  195  6e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0307388 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2305  elongation factor Ts  39.93 
 
 
291 aa  196  6e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427266  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  38.28 
 
 
294 aa  195  7e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1104  translation elongation factor Ts  41.78 
 
 
286 aa  195  9e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000532403  unclonable  0.00000000000000104314 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1584  elongation factor Ts  39.73 
 
 
308 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0461  elongation factor Ts  38.85 
 
 
307 aa  194  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3348  elongation factor Ts  40.4 
 
 
301 aa  194  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.955126 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1261  elongation factor Ts  35.99 
 
 
354 aa  194  1e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00427037  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  40.88 
 
 
296 aa  195  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1315  elongation factor Ts  35.57 
 
 
357 aa  193  3e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.730709  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0786  elongation factor Ts  43.12 
 
 
290 aa  193  3e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0548  elongation factor Ts  34.99 
 
 
357 aa  193  3e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1196  elongation factor Ts  35.57 
 
 
357 aa  193  3e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2045  elongation factor Ts  36.08 
 
 
312 aa  193  3e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00216112  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3164  elongation factor Ts  40.21 
 
 
285 aa  192  5e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.347737  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0685  elongation factor Ts  38.14 
 
 
291 aa  192  5e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000446628  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  37.98 
 
 
292 aa  192  6e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1284  elongation factor Ts  38.6 
 
 
294 aa  192  7e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149192  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2177  elongation factor Ts  41.58 
 
 
298 aa  192  8e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00688857  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0550  elongation factor Ts  36.04 
 
 
348 aa  190  2e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00242368  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1118  elongation factor Ts  39.46 
 
 
305 aa  189  2.9999999999999997e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.681588  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1161  elongation factor Ts  39.46 
 
 
305 aa  189  2.9999999999999997e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.352257  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1693  elongation factor Ts  39.06 
 
 
310 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.576382 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0407  translation elongation factor Ts  35.29 
 
 
355 aa  189  5.999999999999999e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2377  translation elongation factor Ts  39.1 
 
 
267 aa  189  7e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3449  elongation factor Ts  41.47 
 
 
308 aa  188  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.190771  normal  0.488523 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1198  elongation factor Ts  41.3 
 
 
291 aa  187  3e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.14285  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1743  elongation factor Ts  41.58 
 
 
299 aa  186  4e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1529  elongation factor Ts  40.21 
 
 
291 aa  186  4e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000439027  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2034  elongation factor Ts  40.8 
 
 
306 aa  186  4e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0653103 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0976  elongation factor Ts  38.83 
 
 
292 aa  186  5e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00120791  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0839  elongation factor Ts  34.81 
 
 
352 aa  185  7e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0656173  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  40.48 
 
 
293 aa  185  9e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1678  elongation factor Ts  36.99 
 
 
292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  38.19 
 
 
293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  38.83 
 
 
289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3195  translation elongation factor Ts  37.95 
 
 
308 aa  183  3e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  37.46 
 
 
292 aa  183  3e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>