More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6549 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6549  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 128 aa  249  8.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.135068  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9141  putative transcriptional regulator, MerR family  67.57 
 
 		 124 aa  141  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0162  MerR family transcriptional regulator  57.89 
 
 		 119 aa  132  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0117  transcriptional regulator, MerR family  58.04 
 
 		 138 aa  131  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2262  MerR family transcriptional regulator  57.38 
 
 		 150 aa  131  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.142473  normal  0.0766241 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0947  transcriptional regulator, MerR family  57.69 
 
 		 137 aa  116  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0129  MerR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 127 aa  79  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.684226 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5050  putative transcriptional regulator, MerR family  38.71 
 
 		 131 aa  77  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.999579  normal  0.135086 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5312  transcriptional regulator, MerR family  41.44 
 
 		 117 aa  76.6  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4290  transcriptional regulator, MerR family  38.46 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.66586 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4970  MerR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 122 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3524  MerR family transcriptional regulator  38 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4856  MerR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5281  MerR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4871  MerR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5264  transcriptional regulator, MerR family  32.74 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4283  MerR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 113 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.85164  normal  0.1781 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5339  transcriptional regulator, MerR family  32.74 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4426  putative transcriptional regulator, MerR family  35.65 
 
 		 135 aa  68.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911048 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5294  transcriptional regulator, MerR family  32.74 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2773  MerR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5663  transcriptional regulator, MerR family  32.52 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6606  MerR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0486  MerR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 113 aa  67  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.277411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5026  MerR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5407  MerR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2357  MerR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4735  transcriptional regulator, MerR family  39.81 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2558  MerR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0137  MerR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24080  transcriptional regulator, MerR family  35.66 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3828  MerR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 122 aa  64.3  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1885  MerR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 113 aa  63.9  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.375979 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3434  MerR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 128 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.87421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7238  putative transcriptional regulator, MerR family  36.89 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6346  MerR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5255  MerR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 128 aa  62  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107337  normal  0.171715 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6110  MerR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 128 aa  62  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.772914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4100  MerR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 127 aa  62  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1930  MerR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127523  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2182  transcriptional regulator, MerR family  36.52 
 
 		 123 aa  62  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.0034846  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6523  MerR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0471751  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6757  MerR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288009  normal  0.0279244 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6614  MerR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0203  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  32.08 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3841  MerR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 123 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2165  MerR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 343 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0525  putative transcriptional regulator, MerR family  32.09 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0178502 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  37.27 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0626  transcriptional regulator  32.73 
 
 		 115 aa  60.1  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  36.36 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2655  zinc-responsive transcriptional regulator  37.25 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2298  MerR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 343 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2962  transcriptional regulator  31.73 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0438  transcriptional regulator, MerR family  34.82 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2821  MerR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.353313 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4304  MerR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.614703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2848  MerR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4827  MerR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3192  MerR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.375407 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2343  MerR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5012  MerR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 289 aa  57.4  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.147011  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3790  MerR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0361759  normal  0.548118 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0303  transcriptional regulator, MerR family  31.13 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00540997  normal  0.988288 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4066  MerR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0140  putative transcriptional regulator, MerR family  36.13 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0752186 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3704  MerR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 116 aa  57  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2868  MerR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 129 aa  57  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000311414  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1667  regulatory protein, MerR  37.93 
 
 		 136 aa  57  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2841  transcriptional regulator, MerR family  33.94 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.429169  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4703  MerR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.279975  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0427  MerR family transcriptional regulator  22.69 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0950  MerR family transcriptional regulator  45 
 
 		 63 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.823957  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3033  MerR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0661406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2107  regulatory protein, MerR:Albicidin resistance  32.06 
 
 		 342 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.814054  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0980  MerR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 648 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  35.85 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3329  zinc-responsive transcriptional regulator  34.31 
 
 		 144 aa  57  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.886267 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2026  putative transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.108228 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2189  transcriptional regulator, MerR family  35.92 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0218623 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2588  MerR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0158199 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1484  MerR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.944176  normal  0.368372 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3285  transcriptional regulator, MerR family  32.43 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.200558  normal  0.212235 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0034  MerR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4137  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1504  regulatory protein, MerR  36.63 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4286  transcriptional regulator, MerR family  36.45 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2655  MerR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3486  transcriptional regulator, MerR family  37.4 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1062  regulatory protein, MerR  40 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4396  transcriptional regulator, MerR family  36.45 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.742321  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2451  transcriptional regulator, MerR family  43.55 
 
 		 339 aa  55.5  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4949  putative transcriptional regulator, MerR family  33.96 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0118636  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0226  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0029  transcriptional regulator, MerR family  30 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 342 aa  55.1  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>