More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6217 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_6217  flavin reductase domain protein FMN-binding  100 
 
 
158 aa  310  4.999999999999999e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1498  putative flavin-dependent reductase  45.27 
 
 
174 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0096  flavin reductase domain-containing protein  43.71 
 
 
167 aa  111  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2404  flavin reductase-like, FMN-binding  43.26 
 
 
197 aa  108  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0203545 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4939  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  47.66 
 
 
178 aa  102  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.372031  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3669  flavin reductase domain-containing protein  43.84 
 
 
207 aa  103  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1607  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  41.61 
 
 
168 aa  100  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26130  conserved protein of DIM6/NTAB family  36.24 
 
 
179 aa  96.7  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.861848  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8271  flavin reductase domain-containing protein  41.6 
 
 
168 aa  95.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4448  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.45 
 
 
165 aa  95.1  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32170  Flavin reductase domain protein  37.01 
 
 
313 aa  93.2  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  41.72 
 
 
408 aa  92.8  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4057  flavin reductase-like, FMN-binding  39.86 
 
 
172 aa  92.4  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2773  flavin reductase domain-containing protein  35.76 
 
 
204 aa  90.5  8e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827464  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4106  flavin reductase domain-containing protein  38.96 
 
 
170 aa  90.1  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3504  flavin reductase domain-containing protein  38.16 
 
 
309 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0504926  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1371  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  40.62 
 
 
169 aa  90.1  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.361303  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2124  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  39.35 
 
 
184 aa  89  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5585  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.3 
 
 
311 aa  89  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.144422  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5504  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.91 
 
 
330 aa  89.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  decreased coverage  0.000482944 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4324  flavin reductase domain-containing protein  37.75 
 
 
327 aa  89.4  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.160185 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6306  flavin reductase domain-containing protein  37.66 
 
 
175 aa  89.4  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.357776 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2289  flavin reductase domain-containing protein  41.41 
 
 
323 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0610739 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4363  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  42.67 
 
 
174 aa  88.6  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6121  flavin reductase domain-containing protein  38.51 
 
 
311 aa  89  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.272267  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3189  flavin reductase domain-containing protein  35.14 
 
 
304 aa  88.6  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6548  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.78 
 
 
311 aa  88.6  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43019  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6010  flavin reductase domain-containing protein  37.66 
 
 
175 aa  88.2  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5977  flavin reductase domain-containing protein  38.52 
 
 
226 aa  87.4  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  0.320583 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0311  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  42.97 
 
 
158 aa  87  8e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2478  flavin reductase domain-containing protein  38.28 
 
 
302 aa  87.4  8e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375829  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6253  flavin reductase domain-containing protein  37.04 
 
 
311 aa  86.3  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103541  normal  0.25638 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0470  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.84 
 
 
170 aa  85.9  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1916  flavin reductase domain-containing protein  42.55 
 
 
166 aa  85.5  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.751349 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5034  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.05 
 
 
171 aa  85.9  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3697  hypothetical protein  37.33 
 
 
168 aa  85.5  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416114  normal  0.561141 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0140  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.72 
 
 
169 aa  86.3  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.829164  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5488  flavin reductase-like, FMN-binding  37.01 
 
 
175 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.968149  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6774  flavin reductase domain-containing protein  37.01 
 
 
175 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6362  flavin reductase domain-containing protein  37.01 
 
 
175 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7180  flavin reductase-like, FMN-binding  36.36 
 
 
175 aa  85.5  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.050322 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6044  flavin reductase domain-containing protein  37.84 
 
 
226 aa  85.5  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3055  flavin reductase domain-containing protein  30.07 
 
 
169 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5938  flavin reductase domain-containing protein  37.84 
 
 
226 aa  85.5  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0245052 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1979  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  38.85 
 
 
166 aa  84.7  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2215  nitrilotriacetate monooxygenase  39.53 
 
 
318 aa  84.7  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130283  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  33.54 
 
 
170 aa  84  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2755  flavin reductase domain protein  34.87 
 
 
177 aa  84  8e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0570474 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2697  flavin reductase domain-containing protein  30.07 
 
 
193 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.235681 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2866  flavin reductase domain-containing protein  34.01 
 
 
175 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.567161  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1781  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.49 
 
 
170 aa  82.4  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000326211 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3185  flavin reductase domain-containing protein  33.55 
 
 
182 aa  82.4  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2523  flavin reductase-like, FMN-binding  37.5 
 
 
346 aa  82.4  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0068  flavin reductase domain-containing protein  39.07 
 
 
186 aa  81.6  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0087  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.07 
 
 
186 aa  82  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0092  flavin reductase domain-containing protein  38.82 
 
 
172 aa  82.4  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4101  flavin reductase domain-containing protein  37.41 
 
 
184 aa  81.3  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3318  flavin reductase-like, FMN-binding  37.66 
 
 
170 aa  81.3  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000349305  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0221  flavin reductase domain-containing protein  37.75 
 
 
393 aa  81.3  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3647  oxidoreductase, putative  35.76 
 
 
161 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0722443  normal  0.161696 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1408  flavin reductase domain-containing protein  36.18 
 
 
173 aa  80.9  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.913162  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2261  flavin reductase domain-containing protein  37.98 
 
 
161 aa  80.9  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6495  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.18 
 
 
168 aa  80.9  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0350  flavin reductase domain-containing protein  34.81 
 
 
169 aa  80.5  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.500094 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3842  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32.45 
 
 
190 aa  80.1  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11968  oxidoreductase  36 
 
 
171 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0356349  normal  0.857674 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3262  flavin reductase-like, FMN-binding  33.76 
 
 
161 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0281543 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1841  flavin reductase-like, FMN-binding  37.5 
 
 
161 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1331  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  36.73 
 
 
157 aa  79.7  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0131046  normal  0.0375915 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2083  flavin reductase domain-containing protein  34.67 
 
 
161 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7215  flavin reductase domain-containing protein  38.41 
 
 
212 aa  80.1  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3234  flavin reductase-like, FMN-binding  37.31 
 
 
161 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2256  flavin reductase domain-containing protein  37.21 
 
 
161 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550172  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3141  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.44 
 
 
165 aa  79.7  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3643  oxidoreductase, putative  34.81 
 
 
161 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0302568  normal  0.0898299 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2582  flavin reductase-like, FMN-binding  34.44 
 
 
162 aa  78.6  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.643746  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0126  flavin reductase-like, FMN-binding  37.16 
 
 
186 aa  78.6  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8752  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.29 
 
 
162 aa  78.6  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.125188 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2261  flavin reductase domain-containing protein  33.12 
 
 
161 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6116  flavin reductase domain-containing protein  36.43 
 
 
320 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.362693  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2088  flavin reductase domain-containing protein  34.81 
 
 
161 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000731585  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2119  flavin reductase domain-containing protein  33.56 
 
 
322 aa  77.8  0.00000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2266  flavin reductase domain-containing protein  34.81 
 
 
161 aa  77.8  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1858  GntR family transcriptional regulator  32.45 
 
 
393 aa  77.8  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5008  flavin reductase domain-containing protein  39.33 
 
 
173 aa  77.8  0.00000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.442904  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0737  putative flavin reductase-like protein  34.44 
 
 
169 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0127  flavin reductase domain-containing protein  38 
 
 
173 aa  77  0.00000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3523  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32.67 
 
 
191 aa  77.4  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30752  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1520  flavin reductase domain-containing protein  36.24 
 
 
164 aa  77.4  0.00000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.377691 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5501  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.9 
 
 
311 aa  77  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2672  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  36.57 
 
 
161 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6086  flavoprotein oxidoreductase  35.56 
 
 
306 aa  77  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4569  flavin reductase domain-containing protein  30.61 
 
 
168 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.168404 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2919  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  41.18 
 
 
178 aa  77  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.15426  normal  0.385823 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0378  flavin reductase domain-containing protein  36.18 
 
 
168 aa  75.9  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.557848  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3468  flavin reductase-like, FMN-binding  33.33 
 
 
174 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.235276  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7368  flavin reductase-like, FMN-binding  28.39 
 
 
169 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.256607 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3440  flavin reductase domain-containing protein  35.82 
 
 
161 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.540454  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5120  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.31 
 
 
163 aa  76.3  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3091  flavin reductase domain-containing protein  28.1 
 
 
169 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>