193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4640 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4640  hypothetical protein  100 
 
 		 280 aa  538  9.999999999999999e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.376604  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3008  hydrolase  58.13 
 
 		 319 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0906767 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1050  alpha/beta hydrolase fold  49.19 
 
 		 322 aa  112  5e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.173196  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25920  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  43.65 
 
 		 351 aa  94  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.84065  normal  0.959468 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0343  alpha/beta fold family hydrolase  36.97 
 
 		 372 aa  87.4  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2678  alpha/beta hydrolase fold protein  43.14 
 
 		 333 aa  76.6  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.906981 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0778  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.588108  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  29.03 
 
 		 373 aa  53.9  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2532  hypothetical protein  39.78 
 
 		 299 aa  53.1  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.236123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2120  alpha/beta hydrolase fold protein  27.86 
 
 		 437 aa  53.1  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5333  protein of unknown function DUF309  32.5 
 
 		 494 aa  53.1  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0481251 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0923  alpha/beta hydrolase fold protein  34.51 
 
 		 296 aa  52.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0950  alpha/beta hydrolase fold protein  34.51 
 
 		 296 aa  52.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4088  alpha/beta hydrolase fold protein  38.24 
 
 		 309 aa  52.8  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.90454  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  29.17 
 
 		 261 aa  52.4  0.000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4126  alpha/beta hydrolase fold  35.48 
 
 		 393 aa  52.4  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000164833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3105  alpha/beta hydrolase fold  27.64 
 
 		 291 aa  52.4  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0672  alpha/beta hydrolase superfamily protein  39.29 
 
 		 344 aa  52  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0529058  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5612  alpha/beta hydrolase fold  30.22 
 
 		 311 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00676484  hitchhiker  0.00203627 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0675  alpha/beta hydrolase fold  26.61 
 
 		 290 aa  51.6  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0467323 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2869  alpha/beta hydrolase fold protein  29.29 
 
 		 291 aa  52  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.415646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2122  alpha/beta hydrolase fold  31.9 
 
 		 249 aa  52  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.237751 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3567  3-oxoadipate enol-lactonase  31.31 
 
 		 264 aa  51.2  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0409722 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  31.31 
 
 		 284 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1308  alpha/beta fold family hydrolase  35.65 
 
 		 275 aa  50.4  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.100773  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0493  alpha/beta hydrolase fold  30.83 
 
 		 290 aa  50.8  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.5355  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2024  alpha/beta hydrolase fold  35.04 
 
 		 329 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.44574 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  33.64 
 
 		 268 aa  50.4  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0626  Alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 308 aa  49.7  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.434824 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1023  alpha/beta family hydrolase  30.58 
 
 		 287 aa  49.7  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  36.05 
 
 		 307 aa  50.1  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2264  alpha/beta hydrolase fold protein  33.08 
 
 		 290 aa  49.7  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426899  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1295  short chain dehydrogenase  32.61 
 
 		 602 aa  49.7  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.101432  normal  0.699766 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4195  alpha/beta hydrolase fold protein  39.19 
 
 		 308 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3926  alpha/beta hydrolase fold protein  33.65 
 
 		 322 aa  49.7  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.838043  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  28.26 
 
 		 287 aa  48.9  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  35.79 
 
 		 275 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  29.17 
 
 		 350 aa  48.9  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  34.38 
 
 		 253 aa  48.1  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1380  3-oxoadipate enol-lactonase  30.48 
 
 		 263 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.595814 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  33.9 
 
 		 287 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2496  alpha/beta hydrolase fold protein  43.24 
 
 		 277 aa  48.5  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0558  alpha/beta hydrolase fold  39.76 
 
 		 338 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2705  alpha/beta hydrolase fold  33.77 
 
 		 305 aa  48.9  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1698  magnesium chelatase accessory protein  37.5 
 
 		 295 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28396  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3531  alpha/beta hydrolase fold protein  30.7 
 
 		 329 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.290128  normal  0.539158 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4343  3-oxoadipate enol-lactonase  30.48 
 
 		 263 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149189  normal  0.0581646 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3102  Alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 		 312 aa  47.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.6937 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1988  alpha/beta hydrolase superfamily protein  40.74 
 
 		 321 aa  47.4  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.150126 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  32.14 
 
 		 264 aa  47.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7077  3-oxoadipate enol-lactonase  31.9 
 
 		 269 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1941  alpha/beta hydrolase fold  26.72 
 
 		 291 aa  47.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0494053  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3723  alpha/beta hydrolase fold  41.98 
 
 		 281 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0906881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0537  dihydrolipoamide acetyltransferase, putative  36.11 
 
 		 292 aa  47.4  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.169084  normal  0.40861 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2762  alpha/beta hydrolase fold protein  28.93 
 
 		 280 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18201  alpha/beta fold family hydrolase  30.95 
 
 		 304 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.392562  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1546  alpha/beta hydrolase fold  32.08 
 
 		 285 aa  47  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  hitchhiker  0.0047604 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1359  short chain dehydrogenase  32.61 
 
 		 602 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1090  hydrolase, alpha/beta fold family  36.71 
 
 		 275 aa  47  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0322  alpha/beta hydrolase fold  34.52 
 
 		 349 aa  47  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13192  non-heme haloperoxidase hpx  46.15 
 
 		 299 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.305997 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1701  alpha/beta hydrolase fold protein  32.14 
 
 		 303 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1726  alpha/beta hydrolase fold protein  32.14 
 
 		 303 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0723  alpha/beta hydrolase fold protein  37.5 
 
 		 270 aa  46.6  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3801  alpha/beta hydrolase fold  28.89 
 
 		 351 aa  46.6  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2582  alpha/beta fold family hydrolase  34.52 
 
 		 288 aa  46.2  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4434  3-oxoadipate enol-lactonase  30 
 
 		 263 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.600688  normal  0.0168889 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1274  3-oxoadipate enol-lactonase  32.35 
 
 		 263 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  38.89 
 
 		 308 aa  45.8  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0829  alpha/beta hydrolase fold  27.19 
 
 		 290 aa  45.8  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.41609  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1020  3-oxoadipate enol-lactonase  31 
 
 		 263 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.062909 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5939  3-oxoadipate enol-lactonase  31.62 
 
 		 275 aa  45.8  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.178478 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1799  Alpha/beta hydrolase fold  31 
 
 		 275 aa  45.8  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0068  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  33.33 
 
 		 297 aa  45.8  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5099  alpha/beta hydrolase fold protein  36.22 
 
 		 277 aa  45.8  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.54881 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 269 aa  45.8  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3469  alpha/beta hydrolase fold protein  32.46 
 
 		 304 aa  45.8  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210979  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0704  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 		 276 aa  45.8  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.166516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3621  alpha/beta hydrolase fold protein  27.59 
 
 		 335 aa  45.8  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4676  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  23.81 
 
 		 331 aa  45.4  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.318593  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3092  alpha/beta hydrolase fold protein  31.78 
 
 		 309 aa  45.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150861 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2256  alpha/beta hydrolase fold protein  34.72 
 
 		 297 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2307  alpha/beta hydrolase fold protein  34.72 
 
 		 297 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.960741 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1808  short chain dehydrogenase  35.29 
 
 		 596 aa  45.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67175  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0997  alpha/beta hydrolase fold  40.96 
 
 		 218 aa  45.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4523  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  35.63 
 
 		 271 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104364  normal  0.231171 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2178  alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 		 288 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.100362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2255  alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 		 288 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.170585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1673  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 		 296 aa  45.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.478799  normal  0.0522844 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2387  alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 		 288 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0869571  normal  0.603358 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1567  chloride peroxidase  39.06 
 
 		 274 aa  45.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5307  alpha/beta hydrolase fold  34.41 
 
 		 295 aa  45.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224347 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3694  ab hydrolase, alpha/beta hydrolase fold protein  39.74 
 
 		 285 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.110664 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4026  alpha/beta hydrolase fold protein  36.99 
 
 		 298 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2400  alpha/beta hydrolase fold  29.81 
 
 		 288 aa  45.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4044  alpha/beta hydrolase fold  32.97 
 
 		 310 aa  45.4  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  35.8 
 
 		 307 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4437  alpha/beta hydrolase fold  32.97 
 
 		 310 aa  45.4  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.684387  hitchhiker  0.00120619 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0269  alpha/beta fold family hydrolase  27.62 
 
 		 265 aa  44.3  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.699859  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0132  putative hydrolase  30.58 
 
 		 311 aa  44.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.282626  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>