81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3324 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3324  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 268 aa  527  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0275415  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0501  transcriptional regulator, MarR family  71.62 
 
 		 253 aa  300  2e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5015  hypothetical protein  70.82 
 
 		 244 aa  281  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0614805 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0456  transcriptional regulator, MarR family  64.52 
 
 		 251 aa  267  1e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.169685 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0033  hypothetical protein  53.91 
 
 		 241 aa  222  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.629454 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2566  transcriptional regulator, MarR family  47.98 
 
 		 237 aa  200  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.460606  normal  0.11891 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6466  hypothetical protein  50.67 
 
 		 316 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.893622  normal  0.0778626 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2741  hypothetical protein  52.84 
 
 		 232 aa  186  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0457955  normal  0.696635 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1076  hypothetical protein  51.77 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5391  hypothetical protein  38.26 
 
 		 155 aa  93.2  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.470124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2203  hypothetical protein  38.73 
 
 		 150 aa  93.2  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.138665  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5388  hypothetical protein  35.06 
 
 		 172 aa  89.7  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.44132 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36940  predicted transcriptional regulator  38.93 
 
 		 169 aa  88.6  9e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.830889  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1000  hypothetical protein  35.95 
 
 		 169 aa  78.6  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.642132 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5635  hypothetical protein  34.29 
 
 		 193 aa  75.5  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0365755 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2558  transcriptional regulator TrmB  35.97 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0102  hypothetical protein  31.43 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.870138  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4698  hypothetical protein  36 
 
 		 152 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0959  hypothetical protein  53.12 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.498536 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2201  transcriptional regulator, TrmB  31.58 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.648434  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2247  transcriptional regulator, TrmB  31.58 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2190  transcriptional regulator, TrmB  31.58 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235216  normal  0.0245413 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1562  regulatory protein, MarR  25.55 
 
 		 159 aa  55.1  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0088  regulatory protein, MarR  32 
 
 		 158 aa  53.5  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0777  transcriptional regulator, TrmB  33.1 
 
 		 153 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162484  normal  0.537638 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2900  MarR regulatory protein  28.3 
 
 		 160 aa  52.4  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal  0.115809 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6641  integrase catalytic region  31.79 
 
 		 385 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000123291 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6587  integrase catalytic region  31.79 
 
 		 385 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15120  transposase, IS30 family  30.32 
 
 		 385 aa  50.8  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0851499  normal  0.892726 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22920  transposase, IS30 family  30.32 
 
 		 385 aa  50.4  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.200558 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1836  integrase catalytic subunit  44.44 
 
 		 380 aa  49.7  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.100026  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0167  hypothetical protein  26.9 
 
 		 153 aa  48.9  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.287681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0176  hypothetical protein  26.09 
 
 		 153 aa  48.9  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.750866  hitchhiker  0.00561367 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1592  integrase catalytic subunit  30.71 
 
 		 342 aa  48.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00550293  normal  0.214322 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4122  transposase IS1088  30.71 
 
 		 342 aa  48.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.618296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1529  integrase catalytic subunit  30.71 
 
 		 342 aa  48.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.016356  hitchhiker  0.00474191 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4207  transposase IS1088  30.71 
 
 		 342 aa  48.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.302839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4418  transposase IS1088  30.71 
 
 		 342 aa  48.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182446  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4463  transposase IS1088  30.71 
 
 		 342 aa  48.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.985118  normal  0.0492126 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5718  transposase IS1088  30.71 
 
 		 342 aa  48.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5755  transposase IS1088  30.71 
 
 		 342 aa  48.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.335377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2382  integrase catalytic subunit  30.71 
 
 		 342 aa  48.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000024142  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0741  putative transposase IS30  28.48 
 
 		 385 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.18405  normal  0.376382 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2225  integrase catalytic subunit  31.17 
 
 		 370 aa  48.1  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0584  regulatory protein, MarR  28.28 
 
 		 155 aa  47.4  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4255  integrase catalytic region  42.86 
 
 		 465 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000703282 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1692  integrase catalytic subunit  42.86 
 
 		 380 aa  47.4  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.204308  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3232  integrase catalytic subunit  42.86 
 
 		 465 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.495092 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4468  integrase catalytic region  42.86 
 
 		 465 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4426  integrase catalytic region  42.86 
 
 		 465 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4206  integrase catalytic region  42.86 
 
 		 465 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3406  integrase catalytic region  42.86 
 
 		 465 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0893  integrase catalytic region  42.86 
 
 		 465 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4467  integrase catalytic region  43.9 
 
 		 466 aa  47  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4419  Integrase catalytic region  41.27 
 
 		 315 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000000630887  normal  0.64784 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4334  Fis family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 386 aa  46.6  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1266  integrase catalytic subunit  41.27 
 
 		 315 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.705785  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2850  integrase catalytic subunit  41.27 
 
 		 315 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0884338  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3440  integrase catalytic subunit  41.27 
 
 		 315 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4400  integrase catalytic subunit  41.1 
 
 		 315 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0589  putative transcriptional regulator  32.81 
 
 		 175 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.373592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0382  integrase catalytic subunit  33.82 
 
 		 401 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0329218 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0481  integrase catalytic subunit  47.83 
 
 		 401 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.103123 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1754  integrase catalytic region  42.86 
 
 		 386 aa  46.2  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2926  regulatory protein, MarR  29.25 
 
 		 163 aa  45.8  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3959  integrase catalytic subunit  47.54 
 
 		 386 aa  45.4  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5169  regulatory protein ArsR  26.17 
 
 		 152 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.207945  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0969  hypothetical protein  28.83 
 
 		 153 aa  44.7  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.563081  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1238  integrase catalytic subunit  50 
 
 		 386 aa  45.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1433  integrase catalytic subunit  47.54 
 
 		 386 aa  45.4  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3098  putative transcriptional regulatory protein  34.88 
 
 		 186 aa  43.9  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0677665 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4777  ArsR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 185 aa  43.9  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3059  integrase catalytic subunit  28.48 
 
 		 342 aa  43.9  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1249  integrase, catalytic region  30.39 
 
 		 246 aa  42.7  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0925898  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4684  regulatory protein, MarR  25.35 
 
 		 157 aa  42.7  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.261368  normal  0.0600861 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4465  regulatory protein, MarR  33.33 
 
 		 164 aa  42.7  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3419  integrase catalytic region  31.5 
 
 		 386 aa  42.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2885  putative transcriptional regulator  29.08 
 
 		 174 aa  42.4  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1190  integrase  29.14 
 
 		 386 aa  42.4  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.216917  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17010  predicted transcriptional regulator  28.35 
 
 		 175 aa  42.4  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.491454 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1240  integrase catalytic subunit  38.03 
 
 		 317 aa  42  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04127  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>