More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0493 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0493  ABC transporter related  100 
 
 		 537 aa  1038    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6901  ABC transporter, ATP-binding protein  53.89 
 
 		 545 aa  497  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19010  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  53.96 
 
 		 555 aa  496  1e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0660652 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1055  ABC transporter related  53.89 
 
 		 542 aa  488  1e-137  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242614  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2215  ABC transporter related  53.52 
 
 		 545 aa  476  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.242507  normal  0.0157835 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2670  ABC transporter related  53.26 
 
 		 537 aa  464  1e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.205252  normal  0.299253 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0806  ABC transporter related  51.85 
 
 		 569 aa  454  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4909  ABC transporter related  51.29 
 
 		 551 aa  455  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00241613 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4164  ABC transporter related protein  55.93 
 
 		 544 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.226942  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0452  ABC transporter related  52.33 
 
 		 544 aa  447  1.0000000000000001e-124  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.15449  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0923  ABC transporter related  51.22 
 
 		 553 aa  436  1e-121  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15950  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  48.99 
 
 		 550 aa  430  1e-119  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5841  ABC transporter-related protein  50.92 
 
 		 548 aa  421  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.334221  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3420  ABC transporter related protein  51.11 
 
 		 554 aa  417  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.859354  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0995  ABC transporter related  49.91 
 
 		 550 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5678  ABC transporter related  49.91 
 
 		 553 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5299  ABC transporter related  49.91 
 
 		 553 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.121259  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5388  ABC transporter related  49.91 
 
 		 553 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.378232 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0507  ABC transporter related protein  50.93 
 
 		 549 aa  408  1.0000000000000001e-112  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0053  ABC transporter related protein  52.44 
 
 		 548 aa  394  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00894848 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5697  ABC transporter related protein  43.15 
 
 		 543 aa  310  5e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.425489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0453  ABC transporter related protein  34.26 
 
 		 552 aa  244  3e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  32.72 
 
 		 644 aa  238  3e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  33.03 
 
 		 659 aa  237  5.0000000000000005e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  30.19 
 
 		 634 aa  237  5.0000000000000005e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  32.72 
 
 		 640 aa  236  7e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  32.72 
 
 		 662 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  32.72 
 
 		 658 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  32.72 
 
 		 658 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  32.12 
 
 		 658 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  32.72 
 
 		 658 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  32.72 
 
 		 658 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  32.67 
 
 		 659 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  32.54 
 
 		 644 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  33.45 
 
 		 641 aa  229  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  32.62 
 
 		 644 aa  229  1e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  31.25 
 
 		 636 aa  228  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  32.72 
 
 		 672 aa  228  3e-58  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4972  ABC transporter related  29.76 
 
 		 544 aa  227  5.0000000000000005e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5225  ABC transporter related  30.29 
 
 		 517 aa  226  7e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2910  ABC transporter related  35.76 
 
 		 537 aa  226  9e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.53858 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  28.65 
 
 		 643 aa  224  2e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3350  ABC transporter related  32.53 
 
 		 547 aa  225  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  29.1 
 
 		 634 aa  224  3e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5125  ABC transporter, ATP-binding protein  29.71 
 
 		 517 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.525386  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5391  ABC transporter ATP-binding protein uup  29.9 
 
 		 517 aa  223  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.975111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  31.86 
 
 		 575 aa  222  9.999999999999999e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5524  ABC transporter, ATP-binding protein  29.71 
 
 		 517 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  32.45 
 
 		 581 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5564  ABC transporter, ATP-binding protein  29.71 
 
 		 530 aa  221  3e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5556  ABC transporter, ATP-binding protein  29.71 
 
 		 517 aa  221  3e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5281  ABC transporter ATP-binding protein  29.71 
 
 		 517 aa  221  3e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5678  ABC transporter ATP-binding protein  29.71 
 
 		 517 aa  221  3e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5614  ABC transporter ATP-binding protein uup  29.71 
 
 		 517 aa  221  3e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3951  ABC transporter-related protein  29.52 
 
 		 517 aa  221  3e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14070  ABC transporter related  31.45 
 
 		 640 aa  220  5e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0328486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5108  ABC transporter, ATP-binding protein  29.52 
 
 		 517 aa  220  6e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  30.13 
 
 		 636 aa  220  6e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0877  ABC transporter, ATP-binding protein  30.04 
 
 		 636 aa  219  1e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0902951  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1642  ABC transporter related  35.63 
 
 		 632 aa  218  2.9999999999999998e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  30.65 
 
 		 533 aa  217  4e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0493  ABC transporter related  29.36 
 
 		 630 aa  216  7e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4514  ABC transporter-related protein  37.93 
 
 		 535 aa  216  7e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577215  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  31.63 
 
 		 620 aa  216  8e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0628  ABC transporter related  33.59 
 
 		 567 aa  216  9e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0261051  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0077  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein LolD  30.56 
 
 		 644 aa  215  1.9999999999999998e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0439155  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  28.34 
 
 		 639 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2545  ABC transporter-related protein  33.4 
 
 		 641 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00131859  decreased coverage  1.5432e-19 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3740  ABC transporter related  31.17 
 
 		 667 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.345281  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11540  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  33.52 
 
 		 532 aa  215  1.9999999999999998e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00577413  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0473  ABC transporter related  32.82 
 
 		 648 aa  214  2.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  31.3 
 
 		 564 aa  213  7.999999999999999e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01001  ABC transporter, ATP binding component  28.14 
 
 		 540 aa  213  7.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0619  ABC transporter ATP-binding protein uup  29.02 
 
 		 646 aa  213  9e-54  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.828103  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0571  ABC transporter, ATP-binding protein  29.14 
 
 		 645 aa  211  2e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.940937  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0415  ABC transporter ATPase  30.43 
 
 		 533 aa  211  2e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.238248  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0093  ABC transporter ATP-binding protein  27.84 
 
 		 536 aa  211  3e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.785822  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1799  ABC transporter related protein  30.56 
 
 		 638 aa  211  3e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  32.77 
 
 		 690 aa  210  5e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2802  ABC transporter related protein  34.1 
 
 		 532 aa  210  5e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15491  normal  0.0601311 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  31.75 
 
 		 668 aa  210  5e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1158  ABC transporter ATPase  29.76 
 
 		 635 aa  209  9e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0136  ABC transporter ATPase  28.91 
 
 		 518 aa  209  1e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1880  ABC transporter ATPase  33.72 
 
 		 532 aa  208  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.548476  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1961  ABC transporter-like protein  34.61 
 
 		 532 aa  208  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.346167 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2121  ABC transporter related  27.55 
 
 		 642 aa  208  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000290627  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  31.88 
 
 		 709 aa  208  2e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0136  ABC transporter, ATP-binding protein  29.23 
 
 		 518 aa  208  2e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.997167  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  32.1 
 
 		 632 aa  208  2e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2072  ABC transporter related protein  33.78 
 
 		 533 aa  208  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0996  ABC transporter related  30.22 
 
 		 536 aa  208  2e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.99181  normal  0.725541 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2084  ABC transporter related  27.55 
 
 		 642 aa  208  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00913447  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5296  putative macrolide efflux pump  29.17 
 
 		 544 aa  207  3e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1721  ABC transporter-related protein  33.65 
 
 		 548 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1792  ABC transporter related  33.52 
 
 		 548 aa  207  4e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2360  ABC transporter related  33.52 
 
 		 642 aa  207  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257541  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  32.39 
 
 		 767 aa  207  5e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  29.14 
 
 		 645 aa  207  5e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  30.94 
 
 		 649 aa  207  5e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01041  ABC transporter, ATP binding component  27.66 
 
 		 541 aa  206  9e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.15596  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>