More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1737 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1737  ABC-1 domain protein  100 
 
 
454 aa  892    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.169861  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1051  ABC-1 domain protein  33.9 
 
 
462 aa  213  7e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.193182  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0938  hypothetical protein  37.83 
 
 
543 aa  203  5e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0169298  normal  0.687676 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07600  predicted unusual protein kinase  35.28 
 
 
448 aa  201  3e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364742  normal  0.439478 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5541  hypothetical protein  33.79 
 
 
473 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0141158 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3788  hypothetical protein  35.71 
 
 
574 aa  196  8.000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.75918  normal  0.724918 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4382  ABC-1 domain-containing protein  33.58 
 
 
448 aa  192  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3825  ABC-1 domain protein  36.26 
 
 
481 aa  189  7e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.197309  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2048  ABC-1 domain protein  35.52 
 
 
470 aa  188  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8354  ABC1 family protein  33.83 
 
 
445 aa  186  8e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114223  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4228  ABC-1 domain protein  34.45 
 
 
440 aa  184  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1769  hypothetical protein  34.14 
 
 
451 aa  184  3e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.967615 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2961  ABC transporter-like protein  33.33 
 
 
437 aa  183  7e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3445  ABC-1 domain protein  32.97 
 
 
450 aa  181  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6206  ABC-1 domain protein  35.98 
 
 
454 aa  178  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0934  ABC-1 domain protein  32.64 
 
 
436 aa  177  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.365672  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1592  ABC-1 domain protein  31.44 
 
 
443 aa  176  5e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.74344  normal  0.15774 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13218  ATP-binding protein ABC transporter  31.87 
 
 
447 aa  173  5.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.514714 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4117  hypothetical protein  32.51 
 
 
499 aa  171  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278989  normal  0.434139 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3736  hypothetical protein  33.58 
 
 
448 aa  170  4e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0607529  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3754  ABC-1 domain protein  33.85 
 
 
447 aa  170  6e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3738  ABC-1 domain protein  32.81 
 
 
455 aa  169  9e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0582734  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3492  ABC-1 domain protein  31.3 
 
 
438 aa  169  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.174728  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0883  hypothetical protein  33.99 
 
 
455 aa  166  5.9999999999999996e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.294077 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1481  hypothetical protein  32.12 
 
 
452 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.853586  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5542  hypothetical protein  32.94 
 
 
476 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0149427 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1076  hypothetical protein  31.21 
 
 
453 aa  163  7e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329046  normal  0.448714 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3042  ABC-1 domain protein  30.05 
 
 
438 aa  161  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.166576  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1810  hypothetical protein  29.86 
 
 
445 aa  161  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539827  normal  0.0402185 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4658  hypothetical protein  29.63 
 
 
445 aa  161  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.571674  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1465  hypothetical protein  29.88 
 
 
445 aa  160  6e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2053  hypothetical protein  32.27 
 
 
461 aa  159  7e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000184896 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1411  hypothetical protein  29.88 
 
 
445 aa  159  8e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.644627  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1429  hypothetical protein  29.88 
 
 
445 aa  159  8e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0964  hypothetical protein  33.42 
 
 
445 aa  153  5.9999999999999996e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0852448  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0328  ABC-1 domain protein  29.67 
 
 
454 aa  152  8.999999999999999e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.170682 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3896  ABC-1 domain protein  32.93 
 
 
477 aa  151  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2193  Abc1 protein  34.42 
 
 
452 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116003  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00990  ubiquinone biosynthesis-related protein, putative  30.73 
 
 
629 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0509253  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1153  hypothetical protein  32.98 
 
 
470 aa  144  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2757  hypothetical protein  30.91 
 
 
456 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3247  ABC-1 domain protein  34.58 
 
 
558 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474003  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2816  hypothetical protein  27 
 
 
434 aa  139  7.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2984  ABC-1 domain protein  30.65 
 
 
456 aa  139  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2880  ABC-1 domain protein  30.91 
 
 
456 aa  139  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00208044  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3146  hypothetical protein  30.91 
 
 
455 aa  138  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0767  hypothetical protein  31.01 
 
 
432 aa  138  2e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275646  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0211  ABC-1 domain protein  29.95 
 
 
453 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399636  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2802  hypothetical protein  30.65 
 
 
453 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.193583  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0409  hypothetical protein  33.1 
 
 
458 aa  137  4e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1325  hypothetical protein  34.93 
 
 
619 aa  137  5e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.128955  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18521  hypothetical protein  35.32 
 
 
616 aa  136  9e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0520951  normal  0.0416558 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21981  hypothetical protein  34.56 
 
 
619 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.544475  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2205  hypothetical protein  32.98 
 
 
552 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2578  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.17 
 
 
559 aa  133  5e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152488  normal  0.0679255 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1172  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.35 
 
 
558 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1337  2-octaprenylphenol hydroxylase  35.82 
 
 
549 aa  129  8.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3257  ABC-1 domain protein  32.54 
 
 
456 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.883492 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1477  hypothetical protein  28.47 
 
 
433 aa  129  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.533702  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0940  hypothetical protein  31.31 
 
 
433 aa  128  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1519  hypothetical protein  31.27 
 
 
483 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1965  ABC-1 domain protein  30.67 
 
 
564 aa  127  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564803  normal  0.247852 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_2246  predicted protein  34.69 
 
 
299 aa  128  3e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0990218  normal  0.121296 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19231  hypothetical protein  35.84 
 
 
618 aa  127  3e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.494256  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_19041  hypothetical protein  32.24 
 
 
618 aa  127  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1656  hypothetical protein  31.1 
 
 
485 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_19051  hypothetical protein  34.13 
 
 
618 aa  127  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0295  ABC-1 domain protein  31.25 
 
 
558 aa  127  6e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3948  ABC-1 domain protein  29.01 
 
 
454 aa  127  6e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234521  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13150  predicted protein  34.02 
 
 
517 aa  127  6e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.561954  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06572  molecular chaperone (ABC1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04380)  32.12 
 
 
767 aa  125  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.103291  normal  0.0776112 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0578  hypothetical protein  34.92 
 
 
560 aa  125  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2782  ABC-1 domain protein  37.83 
 
 
613 aa  125  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95149  normal  0.892849 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0987  protein kinase  24.04 
 
 
438 aa  124  4e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.290468  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1612  ABC-1 domain protein  33.21 
 
 
557 aa  124  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.504596  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1648  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.43 
 
 
559 aa  124  5e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0889  hypothetical protein  23.68 
 
 
440 aa  124  5e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4898  ABC1 family protein  31.3 
 
 
558 aa  123  6e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1130  hypothetical protein  29.32 
 
 
446 aa  123  6e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0211  putative kinase  27.27 
 
 
555 aa  123  7e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4322  hypothetical protein  27.56 
 
 
466 aa  123  7e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245057  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02271  putative kinase  27.81 
 
 
555 aa  123  7e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4216  hypothetical protein  27.63 
 
 
469 aa  123  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.332762  normal  0.739533 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1806  putative protein kinase:ABC1 family  33.48 
 
 
618 aa  123  9e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.396979  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0243  hypothetical protein  35.54 
 
 
565 aa  122  9e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.469557  normal  0.547936 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1536  ABC-1 domain protein  36.69 
 
 
556 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4049  hypothetical protein  31.15 
 
 
556 aa  122  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.240057  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2693  protein kinase  30.3 
 
 
619 aa  121  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0438  ABC-1 domain protein  29.07 
 
 
473 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0837  hypothetical protein  31.66 
 
 
432 aa  121  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02291  putative kinase  27.5 
 
 
555 aa  120  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4721  hypothetical protein  30.77 
 
 
562 aa  120  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2406  hypothetical protein  31.48 
 
 
468 aa  120  4.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1005  hypothetical protein  29.34 
 
 
564 aa  120  6e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0249187 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0647  hypothetical protein  34.1 
 
 
565 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000186884  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0631  hypothetical protein  34.17 
 
 
558 aa  119  7.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.206757 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0457  ABC-1 domain protein  29.02 
 
 
475 aa  119  9e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1043  hypothetical protein  31.62 
 
 
559 aa  119  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.135473  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1170  hypothetical protein  31.19 
 
 
457 aa  119  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3311  ABC-1 domain protein  29.75 
 
 
433 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>