More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1361 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1361  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 		 363 aa  690    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.264141  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02310  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  36.93 
 
 		 379 aa  140  3.9999999999999997e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165714  normal  0.900052 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5974  FAD linked oxidase domain protein  33.43 
 
 		 411 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3390  FAD linked oxidase domain protein  35.62 
 
 		 454 aa  126  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2832  FAD linked oxidase-like protein  39.18 
 
 		 424 aa  122  9e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3046  FAD linked oxidase domain protein  44.71 
 
 		 409 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0338046  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2952  FAD linked oxidase domain protein  44.71 
 
 		 409 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0264776  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2920  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.28 
 
 		 404 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.411687 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4800  FAD linked oxidase domain protein  43.78 
 
 		 395 aa  119  9e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291197  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2866  FAD linked oxidase-like  42.66 
 
 		 409 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451792  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25811  putative glycolate oxidase subunit GlcE  33.46 
 
 		 460 aa  117  5e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0352  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.03 
 
 		 437 aa  115  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.93914  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0681  FAD linked oxidase domain protein  36.97 
 
 		 399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.28978 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1981  FAD linked oxidase domain protein  36.72 
 
 		 440 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.101076  normal  0.0330309 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1954  FAD linked oxidase domain protein  36.72 
 
 		 440 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4556  FAD linked oxidase-like  38.86 
 
 		 431 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0187  putative glycolate oxidase subunit GlcE  30.38 
 
 		 399 aa  113  6e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1462  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.38 
 
 		 457 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1137  FAD linked oxidase domain-containing protein  48 
 
 		 407 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1916  FAD linked oxidase domain protein  37.37 
 
 		 443 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000270596  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1718  glycolate oxidase subunit GlcE  40.12 
 
 		 425 aa  108  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2787  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  33.18 
 
 		 476 aa  106  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2054  FAD linked oxidase-like  32.81 
 
 		 444 aa  106  7e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.273345  normal  0.646851 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3429  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.57 
 
 		 887 aa  105  9e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0215799  decreased coverage  0.000769346 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0157  putative glycolate oxidase subunit GlcE  38.97 
 
 		 383 aa  105  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.596412  normal  0.0817623 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0161  FAD linked oxidase domain protein  44.62 
 
 		 421 aa  104  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  31.86 
 
 		 466 aa  103  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1530  FAD linked oxidase domain protein  37.26 
 
 		 426 aa  103  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.843901  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2415  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  34.65 
 
 		 469 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.576548  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2602  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  34.65 
 
 		 469 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1193  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  34.65 
 
 		 469 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2439  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.2 
 
 		 464 aa  102  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268315 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0332  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  34.65 
 
 		 469 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3295  putative glycolate oxidase subunit  34.65 
 
 		 469 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3341  D-lactate dehydrogenase (acceptor: cytochrome)  34.65 
 
 		 469 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3329  putative glycolate oxidase subunit  34.65 
 
 		 469 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3317  FAD linked oxidase domain protein  38.25 
 
 		 453 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1292  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  35.64 
 
 		 469 aa  101  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5002  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.23 
 
 		 450 aa  100  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.27379 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4100  FAD linked oxidase domain protein  38.56 
 
 		 441 aa  99.4  8e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2924  FAD linked oxidase-like protein  32.72 
 
 		 495 aa  99.8  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.469068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3159  FAD linked oxidase domain protein  35.16 
 
 		 454 aa  99.4  9e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2900  FAD linked oxidase domain protein  29.41 
 
 		 472 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2651  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.55 
 
 		 469 aa  98.6  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0846115 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2259  FAD linked oxidase-like protein  40 
 
 		 437 aa  99  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0329994 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2494  FAD linked oxidase domain protein  29.8 
 
 		 472 aa  99  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0705  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.82 
 
 		 457 aa  97.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3821  FAD linked oxidase-like  35.26 
 
 		 469 aa  98.2  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0721  FAD linked oxidase domain protein  32.81 
 
 		 471 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.33027 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0625  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.21 
 
 		 469 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0735  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.08 
 
 		 469 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2513  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.29 
 
 		 485 aa  97.4  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0703  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.08 
 
 		 469 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.403494 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0651  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.21 
 
 		 469 aa  97.8  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0251  FAD linked oxidase-like  35.08 
 
 		 452 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3977  putative FAD-binding oxidase  33.16 
 
 		 471 aa  97.1  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2367  FAD linked oxidase domain protein  34.39 
 
 		 440 aa  96.7  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5351  FAD linked oxidase domain protein  32.7 
 
 		 437 aa  95.9  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0177  FAD/FMN-containing dehydrogenase  31.13 
 
 		 460 aa  95.9  9e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0777  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  44.25 
 
 		 482 aa  95.5  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0795  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.59 
 
 		 457 aa  95.9  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.442237  normal  0.447341 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2120  putative D-lactate dehydrogenase (cytochrome), FAD/FMN-containing oxidoreductase  32.27 
 
 		 457 aa  94.7  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.312623  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0052  FAD linked oxidase domain protein  33.65 
 
 		 474 aa  95.1  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4735  FAD linked oxidase-like  33.33 
 
 		 413 aa  94.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.581716 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3362  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.74 
 
 		 427 aa  93.6  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.628382 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1811  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.74 
 
 		 460 aa  93.2  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.398266  normal  0.215495 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2534  FAD linked oxidase domain protein  33.77 
 
 		 436 aa  92.8  7e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2664  putative D-lactate dehydrogenase (cytochrome) oxidoreductase protein  31.48 
 
 		 472 aa  92.8  8e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  0.501651 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3774  putative oxidoreductase  41.74 
 
 		 499 aa  92.8  9e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0098375 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2688  glycolate oxidase FAD binding subunit  40.26 
 
 		 374 aa  92  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.87323  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1428  FAD linked oxidase domain protein  30.22 
 
 		 362 aa  92  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1663  glycolate oxidase, subunit GlcE  32.95 
 
 		 412 aa  90.9  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1477  FAD linked oxidase-like  28.45 
 
 		 474 aa  90.5  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0640821  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0069  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.08 
 
 		 473 aa  90.1  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.881498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1828  FAD linked oxidase-like  31.69 
 
 		 416 aa  90.1  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.850639  normal  0.41646 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0064  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.45 
 
 		 474 aa  89.7  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_55040  d-lactate dehydrogenase  33.15 
 
 		 506 aa  89.7  7e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1529  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.33 
 
 		 876 aa  89.4  8e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.212638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0268  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  36.84 
 
 		 462 aa  89.4  8e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.843143 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2215  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.33 
 
 		 461 aa  89.4  8e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00498684  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0025  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.31 
 
 		 470 aa  89.4  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43762  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4136  FAD linked oxidase-like  31.15 
 
 		 413 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.711925 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08317  D-lactate dehydrogenase (cytochrome), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17520)  27.71 
 
 		 560 aa  88.6  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.900406 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2187  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.06 
 
 		 459 aa  88.2  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0337  D-lactate dehydrogenase (acceptor: cytochrome)  37.09 
 
 		 497 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0061  FAD linked oxidase domain protein  30.26 
 
 		 474 aa  88.2  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3272  FAD linked oxidase domain protein  37.8 
 
 		 411 aa  88.2  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0416233  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0095  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.69 
 
 		 474 aa  88.2  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0202  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.84 
 
 		 473 aa  88.2  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.243944 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0111  FAD linked oxidase-like  30.13 
 
 		 473 aa  88.2  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0040  Fis family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 474 aa  87.4  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.19101 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0959  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  37.09 
 
 		 477 aa  87.8  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1873  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  37.09 
 
 		 497 aa  87.8  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0419  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  37.09 
 
 		 497 aa  87.8  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1787  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  37.09 
 
 		 497 aa  87.8  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1377  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  37.09 
 
 		 497 aa  87.8  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0281382  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0224  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  37.09 
 
 		 497 aa  87.8  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00834249  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0495  FAD linked oxidase domain protein  34.41 
 
 		 399 aa  87  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.220938 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5949  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.86 
 
 		 472 aa  87  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00822967 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0483  FAD linked oxidase-like  34.66 
 
 		 468 aa  86.7  6e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.44731  normal  0.101905 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>