More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1325 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1325  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 464 aa  889    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.828592  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0934  amino acid permease-associated region  62.31 
 
 		 388 aa  399  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1487  amino acid transporter  31.69 
 
 		 452 aa  189  5.999999999999999e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.838437  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1651  amino acid permease  32.92 
 
 		 468 aa  187  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1106  amino acid permease  32.92 
 
 		 469 aa  187  5e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2591  amino acid permease-associated region  32.39 
 
 		 454 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.196035 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1020  amino acid permease  33.17 
 
 		 470 aa  186  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2325  amino acid permease  32.92 
 
 		 469 aa  186  9e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0591  amino acid permease  32.92 
 
 		 469 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1844  amino acid permease  32.92 
 
 		 469 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.742156  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0877  amino acid permease  32.92 
 
 		 469 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45240  putative amino acid permease  33 
 
 		 455 aa  184  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.139697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4289  amino acid permease-associated region  31.84 
 
 		 468 aa  177  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.355644 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3200  amino acid permease-associated region  30.4 
 
 		 468 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1685  amino acid transporter  29.93 
 
 		 468 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.179988  normal  0.632247 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4045  amino acid permease-associated region  30.17 
 
 		 468 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4321  amino acid permease-associated region  30.17 
 
 		 468 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3736  amino acid permease-associated region  30.05 
 
 		 468 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.445667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3841  putative amino acid permease  33.25 
 
 		 455 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4210  amino acid permease-associated region  30.9 
 
 		 467 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.281547 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2010  amino acid permease-associated region  30.37 
 
 		 468 aa  160  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.782382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0763  amino acid permease-associated region  30.72 
 
 		 475 aa  154  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.46184  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  29.02 
 
 		 447 aa  105  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12343  cationic amino acid transport integral membrane protein rocE  26.71 
 
 		 471 aa  99  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  27.69 
 
 		 476 aa  98.2  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1920  amino acid permease-associated region  28.35 
 
 		 466 aa  95.1  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000169214  normal  0.866406 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2442  amino acid permease-associated region  26.53 
 
 		 441 aa  92.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  24.41 
 
 		 439 aa  92.4  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  26.19 
 
 		 486 aa  90.5  5e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2628  amino acid permease-associated region  24.82 
 
 		 453 aa  88.6  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0615557  normal  0.778378 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  27.42 
 
 		 476 aa  87.8  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2802  amino acid permease family protein  27.33 
 
 		 443 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2530  amino acid permease-associated region  25.61 
 
 		 449 aa  85.1  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.480015  normal  0.105308 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1043  amino acid permease-associated region  25.43 
 
 		 494 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490599 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1474  amino acid transporter  28.15 
 
 		 445 aa  85.5  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.221068  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3215  amino acid permease-associated region  24.01 
 
 		 455 aa  84  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52961  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3333  amino acid transporter  25.97 
 
 		 480 aa  83.6  0.000000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.326771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  26.59 
 
 		 491 aa  82.4  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3528  amino acid permease-associated region  26.57 
 
 		 446 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.802107 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  25.77 
 
 		 486 aa  81.6  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4371  amino acid permease-associated region  26.57 
 
 		 446 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670873  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0907  amino acid transporter  26.28 
 
 		 486 aa  82.4  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.555245  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3995  amino acid permease-associated region  26.57 
 
 		 446 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140691  normal  0.543798 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2033  amino acid permease-associated region  24.4 
 
 		 459 aa  81.3  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7480  amino acid permease-associated region  25.74 
 
 		 454 aa  81.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1760  amino acid permease-associated region  24.68 
 
 		 456 aa  81.3  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3458  amino acid permease-associated region  24.55 
 
 		 443 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0492  amino acid permease-associated region  24.55 
 
 		 443 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6579  amino acid permease-associated region  26.29 
 
 		 462 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0989749  decreased coverage  0.00384925 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4081  amino acid permease  26.97 
 
 		 443 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  27.56 
 
 		 473 aa  81.3  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5732  amino acid permease-associated region  26.29 
 
 		 462 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6096  amino acid permease-associated region  26.29 
 
 		 462 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0321  amino acid permease family protein  25.25 
 
 		 460 aa  80.1  0.00000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0838341  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3634  amino acid permease-associated region  24.32 
 
 		 443 aa  80.1  0.00000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0535  amino acid permease-associated region  25.61 
 
 		 443 aa  79.7  0.00000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35860  amino acid permease  25.47 
 
 		 434 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332281  decreased coverage  9.326859999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0624  hypothetical protein  29.16 
 
 		 411 aa  79.7  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3983  amino acid permease-associated region  25.86 
 
 		 450 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0385  amino acid permease-associated region  23.29 
 
 		 453 aa  79.3  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000859435  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  26.85 
 
 		 476 aa  79  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0587  amino acid permease-associated region  25.56 
 
 		 443 aa  79  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  22.71 
 
 		 471 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4031  amino acid permease-associated region  26.48 
 
 		 475 aa  78.2  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.300075 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0530  amino acid permease-associated region  25.62 
 
 		 443 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1639  amino acid permease-associated region  25.52 
 
 		 446 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00236467  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  25.71 
 
 		 455 aa  77.8  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  26.9 
 
 		 440 aa  77.4  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4517  amino acid permease-associated region  28.82 
 
 		 502 aa  77.4  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.844231  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  25.14 
 
 		 436 aa  77.4  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0272  amino acid permease-associated region  26.59 
 
 		 478 aa  77  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.656438  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1229  amino acid ABC transporter permease  25.33 
 
 		 450 aa  76.6  0.0000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.674288 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  26.1 
 
 		 467 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  23.43 
 
 		 471 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7548  amino acid transporter  24.8 
 
 		 463 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.219639 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  26.1 
 
 		 467 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  23.43 
 
 		 471 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5364  amino acid permease-associated region  25.05 
 
 		 481 aa  76.3  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3809  amino acid permease-associated region  25.12 
 
 		 443 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  23.96 
 
 		 471 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  23.43 
 
 		 471 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1258  amino acid permease-associated region  25.33 
 
 		 450 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.101609  normal  0.957729 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2069  amino acid permease-associated region  25.06 
 
 		 456 aa  76.3  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  26.33 
 
 		 467 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1930  amino acid permease-associated region  25.11 
 
 		 463 aa  75.5  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372004  hitchhiker  0.00366235 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31730  gamma-aminobutyrate permease-like transporter  27.46 
 
 		 476 aa  75.9  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38130  putative amino acid permease  26.4 
 
 		 456 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291045 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  26.33 
 
 		 467 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  26.33 
 
 		 467 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4189  amino acid permease-associated region  25.46 
 
 		 450 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1274  amino acid permease-associated region  25.78 
 
 		 458 aa  74.7  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2350  amino acid permease-associated region  25.13 
 
 		 461 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  26.1 
 
 		 467 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1845  amino acid permease-associated region  23.7 
 
 		 505 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.19393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2500  amino acid permease-associated region  26.27 
 
 		 521 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0303184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2522  amino acid permease-associated region  25.94 
 
 		 461 aa  74.7  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1505  amino acid permease  25.13 
 
 		 461 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0509  amino acid permease-associated region  25.12 
 
 		 443 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1826  amino acid permease  25.07 
 
 		 461 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1734  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 506 aa  73.9  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>