283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0597 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0597  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
281 aa  548  1e-155  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.537366  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0487  alpha/beta hydrolase fold  26.05 
 
 
240 aa  108  1e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2481  alpha/beta hydrolase fold protein  33.2 
 
 
275 aa  89.7  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1247  alpha/beta hydrolase fold protein  32.11 
 
 
314 aa  77  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00163 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0636  putative hydrolase, alpha/beta fold family  26.63 
 
 
247 aa  69.7  0.00000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.208223  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1207  Alpha/beta hydrolase fold  25.85 
 
 
245 aa  65.1  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  26.85 
 
 
456 aa  63.5  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 
315 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4919  alpha/beta hydrolase fold protein  29.55 
 
 
284 aa  60.1  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.582438  normal  0.155895 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  26.88 
 
 
277 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3515  alpha/beta hydrolase fold  21.37 
 
 
279 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  29.52 
 
 
333 aa  57.4  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  28.41 
 
 
462 aa  57  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  25.79 
 
 
286 aa  57  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1065  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 
275 aa  56.6  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.289777  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5996  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)  26.09 
 
 
260 aa  56.6  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1048  alpha/beta hydrolase fold protein  25.75 
 
 
239 aa  56.6  0.0000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1786  cyclic nucleotide-binding protein  28.68 
 
 
462 aa  55.8  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00355982 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2839  alpha/beta hydrolase fold protein  22.89 
 
 
267 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.39297 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  25.94 
 
 
287 aa  54.3  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  24.31 
 
 
281 aa  54.3  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0930  alpha/beta hydrolase fold  23.19 
 
 
353 aa  54.3  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.262711  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0810  alpha/beta hydrolase fold  20.95 
 
 
264 aa  54.7  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0122335  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  29.18 
 
 
282 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  29.15 
 
 
262 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0795  alpha/beta hydrolase fold protein  27.89 
 
 
267 aa  53.5  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.814605  normal  0.361628 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3669  alpha/beta hydrolase fold  31.85 
 
 
306 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1955  Alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 
339 aa  53.1  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0521356  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4726  alpha/beta hydrolase fold  21.59 
 
 
279 aa  53.1  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  23.69 
 
 
341 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  26.59 
 
 
284 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1565  alpha/beta hydrolase fold  29.47 
 
 
363 aa  53.1  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  24.91 
 
 
284 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0887  hypothetical protein  20.67 
 
 
239 aa  52.8  0.000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0817  hypothetical protein  20.67 
 
 
239 aa  52.8  0.000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.467529  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4562  alpha/beta hydrolase fold protein  35.58 
 
 
260 aa  52.8  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1214  hypothetical protein  20.67 
 
 
239 aa  52.8  0.000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  20.3 
 
 
277 aa  52.8  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3756  alpha/beta hydrolase fold  25.31 
 
 
504 aa  52.4  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740741  normal  0.0321393 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  26.94 
 
 
282 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  26.35 
 
 
299 aa  52.4  0.000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  27.69 
 
 
257 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4774  alpha/beta fold family hydrolase  21.76 
 
 
279 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4636  alpha/beta hydrolase fold protein  21.76 
 
 
279 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  27.69 
 
 
257 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5136  alpha/beta fold family hydrolase  21.76 
 
 
279 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1970  alpha/beta hydrolase fold  23.08 
 
 
311 aa  51.6  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000319634  normal  0.0578642 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3857  hydrolase, alpha/beta fold family  21.29 
 
 
257 aa  52  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  26.98 
 
 
309 aa  52  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  27.69 
 
 
257 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5015  hydrolase, alpha/beta fold family  21.76 
 
 
279 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  23.51 
 
 
258 aa  52  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2266  alpha/beta hydrolase fold protein  28.25 
 
 
274 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.620512 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5043  alpha/beta fold family hydrolase  21.97 
 
 
279 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4614  alpha/beta hydrolase fold protein  21.76 
 
 
279 aa  51.2  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  25.5 
 
 
340 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1030  alpha/beta hydrolase fold  26.98 
 
 
280 aa  51.2  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.999949  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  24.59 
 
 
284 aa  50.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3284  alpha/beta hydrolase fold protein  23.29 
 
 
267 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  25.71 
 
 
277 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5048  hydrolase, alpha/beta fold family  21.97 
 
 
279 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  25.71 
 
 
292 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  27.67 
 
 
272 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0847  alpha/beta hydrolase fold protein  30.97 
 
 
404 aa  50.8  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.135304  normal  0.159023 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  24.71 
 
 
277 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  25.53 
 
 
562 aa  50.4  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0675  alpha/beta hydrolase fold  30.66 
 
 
290 aa  50.4  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0467323 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5036  hydrolase, alpha/beta fold family  21.59 
 
 
279 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3690  alpha/beta hydrolase fold  29.73 
 
 
298 aa  50.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.557915  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  28.16 
 
 
283 aa  50.1  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0309  alpha/beta hydrolase fold  32.99 
 
 
262 aa  50.1  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  25.87 
 
 
314 aa  49.7  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4574  alpha/beta fold family hydrolase  34.38 
 
 
266 aa  49.7  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0198  hydrolase, alpha/beta fold family  21.21 
 
 
279 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  27.68 
 
 
287 aa  49.3  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  27 
 
 
288 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.39 
 
 
367 aa  49.3  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0831  alpha/beta hydrolase fold  34.71 
 
 
269 aa  49.3  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.37854  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  30.28 
 
 
350 aa  48.9  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3791  alpha/beta hydrolase fold  27.02 
 
 
287 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9504  alpha/beta hydrolase protein  26.52 
 
 
272 aa  48.9  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.932687  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3469  alpha/beta hydrolase fold protein  34.56 
 
 
304 aa  48.9  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210979  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3787  alpha/beta hydrolase fold  27.02 
 
 
287 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3860  alpha/beta hydrolase fold  27.02 
 
 
287 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03993  putative bioH protein  34.29 
 
 
269 aa  48.5  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.39714  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  27.05 
 
 
295 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1579  putative hydrolase  35.71 
 
 
294 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.144323  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  24.72 
 
 
264 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004031  2-succinyl-6-hydroxy-2, 4-cyclohexadiene-1-carboxylate synthase  34.58 
 
 
275 aa  48.9  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04046  alpha/beta hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03890)  41 
 
 
491 aa  47.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.778204 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0981  alpha/beta hydrolase fold protein  22.31 
 
 
254 aa  48.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.659236 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  24.46 
 
 
298 aa  47.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  24.75 
 
 
281 aa  47.4  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  26.44 
 
 
329 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2677  Alpha/beta hydrolase  33 
 
 
315 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2352  alpha/beta hydrolase  27.31 
 
 
314 aa  47.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.517024  normal  0.362082 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  27.16 
 
 
267 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  23.47 
 
 
301 aa  47.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3779  cyclic nucleotide-binding protein  26.59 
 
 
453 aa  48.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0440455  normal  0.0476196 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  25.17 
 
 
340 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>