196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3604 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_3604  large-conductance mechanosensitive channel-like  100 
 
 		 137 aa  272  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3746  large conductance mechanosensitive channel protein  82.11 
 
 		 140 aa  141  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3672  large conductance mechanosensitive channel protein  81.05 
 
 		 140 aa  139  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3606  large conductance mechanosensitive channel protein  81.05 
 
 		 148 aa  137  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0712  large-conductance mechanosensitive channel  61.05 
 
 		 142 aa  126  8.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0820  large-conductance mechanosensitive channel  58.76 
 
 		 151 aa  115  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.577469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3231  large-conductance mechanosensitive channel  58.24 
 
 		 144 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5504  large-conductance mechanosensitive channel  60.64 
 
 		 142 aa  112  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215904 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3207  large-conductance mechanosensitive channel  57.14 
 
 		 142 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2860  large-conductance mechanosensitive channel  57.14 
 
 		 142 aa  107  6e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.219386 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2963  large conductance mechanosensitive channel protein  61.86 
 
 		 142 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232112  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2455  large-conductance mechanosensitive channel  58.95 
 
 		 141 aa  106  9.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3697  large-conductance mechanosensitive channel  61.05 
 
 		 143 aa  105  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.93238  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2930  large-conductance mechanosensitive channel  56.67 
 
 		 141 aa  102  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3094  large-conductance mechanosensitive channel  60.44 
 
 		 144 aa  98.2  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.350384  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6128  large-conductance mechanosensitive channel  54.26 
 
 		 143 aa  97.4  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.316261  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1951  large-conductance mechanosensitive channel  54.26 
 
 		 143 aa  97.4  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0124  large conductance mechanosensitive channel protein  51.04 
 
 		 140 aa  97.8  5e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.533935  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0134  large conductance mechanosensitive channel protein  52.75 
 
 		 140 aa  97.4  6e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.172297 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1975  large-conductance mechanosensitive channel  53.19 
 
 		 143 aa  97.1  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0443039 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1938  large-conductance mechanosensitive channel  53.19 
 
 		 143 aa  97.1  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1865  large-conductance mechanosensitive channel  53.19 
 
 		 143 aa  97.1  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.568071  hitchhiker  0.00372648 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0848  large-conductance mechanosensitive channel  57.61 
 
 		 137 aa  96.7  9e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.231503  normal  0.69291 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5262  large-conductance mechanosensitive channel  53.19 
 
 		 143 aa  96.3  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0455479  normal  0.24364 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0751  large-conductance mechanosensitive channel  56.38 
 
 		 142 aa  95.9  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0788  large-conductance mechanosensitive channel  56.38 
 
 		 142 aa  95.9  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.112062 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0340  large-conductance mechanosensitive channel  54.44 
 
 		 145 aa  95.1  3e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.137149  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1501  large-conductance mechanosensitive channel  51.06 
 
 		 143 aa  94.4  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.917907  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2079  large-conductance mechanosensitive channel  51.06 
 
 		 143 aa  94.4  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2000  large-conductance mechanosensitive channel  51.06 
 
 		 143 aa  94.4  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3310  large-conductance mechanosensitive channel  51.06 
 
 		 143 aa  94.4  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00104042  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2373  large-conductance mechanosensitive channel  51.06 
 
 		 143 aa  94.4  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140991  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2415  large-conductance mechanosensitive channel  51.06 
 
 		 143 aa  94.4  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258205  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1272  large-conductance mechanosensitive channel  51.06 
 
 		 143 aa  94.4  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.404097  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2428  large conductance mechanosensitive channel protein  54.26 
 
 		 142 aa  94  6e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2521  large-conductance mechanosensitive channel  51.06 
 
 		 199 aa  93.6  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.334793  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1187  large conductance mechanosensitive channel protein  53.19 
 
 		 143 aa  93.6  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0089  large conductance mechanosensitive channel protein  53.61 
 
 		 142 aa  92  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0374  large-conductance mechanosensitive channel  59.7 
 
 		 149 aa  85.9  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.606039  normal  0.0231483 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0992  large-conductance mechanosensitive channel  46.39 
 
 		 140 aa  83.6  8e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.158656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3333  large-conductance mechanosensitive channel  51.61 
 
 		 141 aa  82.8  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.662595  hitchhiker  0.000286923 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1318  large-conductance mechanosensitive channel  50 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.212571  hitchhiker  0.00243459 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0880  large-conductance mechanosensitive channel  47.87 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0911634  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2316  large-conductance mechanosensitive channel  52.08 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0475958  normal  0.500244 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0381  large-conductance mechanosensitive channel  48.39 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000132352  hitchhiker  0.000000656046 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0622  large conductance mechanosensitive channel protein  48.48 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6045  large conductance mechanosensitive channel protein  53.26 
 
 		 163 aa  81.6  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1871  large-conductance mechanosensitive channel  54.17 
 
 		 148 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0110608  normal  0.0250819 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3455  large conductance mechanosensitive channel protein  42.55 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0277457  normal  0.0882552 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0055  large conductance mechanosensitive channel protein  45.26 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.153997 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0929  large-conductance mechanosensitive channel  51.04 
 
 		 140 aa  79  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0253  large-conductance mechanosensitive channel  50.51 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0993  large-conductance mechanosensitive channel  47.92 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.125438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0410  large-conductance mechanosensitive channel  42.86 
 
 		 137 aa  77.4  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0318  large-conductance mechanosensitive channel  42.86 
 
 		 138 aa  77  0.00000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384644  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4693  large-conductance mechanosensitive channel  42.86 
 
 		 138 aa  77  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0334  large-conductance mechanosensitive channel  41.76 
 
 		 138 aa  76.3  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0803754  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0724  large-conductance mechanosensitive channel  44.33 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2379  large-conductance mechanosensitive channel  44.33 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.567154 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2630  large conductance mechanosensitive channel protein  44.79 
 
 		 138 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.425108  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2962  large-conductance mechanosensitive channel  40.21 
 
 		 159 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1928  large-conductance mechanosensitive channel  43.48 
 
 		 139 aa  73.6  0.0000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.425698 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0457  large-conductance mechanosensitive channel  41.05 
 
 		 163 aa  72.4  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0166  large-conductance mechanosensitive channel  45 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.3696  normal  0.313526 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2443  large-conductance mechanosensitive channel  42.27 
 
 		 146 aa  72  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.954561  normal  0.582665 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0712  large-conductance mechanosensitive channel  46.81 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1030  large conductance mechanosensitive channel protein  42.55 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.184236  normal  0.070135 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3208  large conductance mechanosensitive channel protein  41.94 
 
 		 141 aa  70.5  0.000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0654251  normal  0.948556 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0225  large-conductance mechanosensitive channel  50.51 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1538  large conductance mechanosensitive channel protein  42.71 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.580363  normal  0.302083 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2641  large-conductance mechanosensitive channel  40.62 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276841 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2607  large conductance mechanosensitive channel protein  39.58 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  0.681771 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2265  large conductance mechanosensitive channel protein  40.62 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0437  large-conductance mechanosensitive channel  38.3 
 
 		 133 aa  66.2  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000628379  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2802  large conductance mechanosensitive channel protein  39.58 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.21352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61050  large-conductance mechanosensitive channel  40.22 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41090  large-conductance mechanosensitive channel  39.13 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.629414  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2579  large conductance mechanosensitive channel protein  39.58 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03141  large-conductance mechanosensitive channel  39.13 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0423  large conductance mechanosensitive channel protein  39.13 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0423  large-conductance mechanosensitive channel  39.13 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.465174  hitchhiker  0.0000168159 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3586  large-conductance mechanosensitive channel  39.13 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.515412  normal  0.131611 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4613  large-conductance mechanosensitive channel  39.13 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000924287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5255  large-conductance mechanosensitive channel  40.22 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.861371  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03092  hypothetical protein  39.13 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3484  large-conductance mechanosensitive channel  39.13 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.175922  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3774  large-conductance mechanosensitive channel  39.13 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0382022  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4639  large-conductance mechanosensitive channel  39.13 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4641  large conductance mechanosensitive channel protein  40.22 
 
 		 148 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3652  large-conductance mechanosensitive channel  39.56 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.326365 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3677  large-conductance mechanosensitive channel  39.13 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3722  large-conductance mechanosensitive channel  39.78 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.459106  hitchhiker  0.00604869 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4645  large-conductance mechanosensitive channel  37.63 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4507  large-conductance mechanosensitive channel  37.63 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4276  large-conductance mechanosensitive channel  38.71 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.348387  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2794  large-conductance mechanosensitive channel  42.31 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0647  large conductance mechanosensitive channel protein  37.89 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0317  large conductance mechanosensitive channel protein  48.28 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209684  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1381  large conductance mechanosensitive channel protein  34.41 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4887  large-conductance mechanosensitive channel  39.13 
 
 		 154 aa  62  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>