265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3606 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_3606  large conductance mechanosensitive channel protein  100 
 
 		 148 aa  286  6e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3746  large conductance mechanosensitive channel protein  86.43 
 
 		 140 aa  214  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3672  large conductance mechanosensitive channel protein  85.71 
 
 		 140 aa  213  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0712  large-conductance mechanosensitive channel  68.22 
 
 		 142 aa  184  4e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0820  large-conductance mechanosensitive channel  65.19 
 
 		 151 aa  181  4.0000000000000006e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.577469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3231  large-conductance mechanosensitive channel  66.67 
 
 		 144 aa  179  8.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5504  large-conductance mechanosensitive channel  66.67 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215904 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3207  large-conductance mechanosensitive channel  64.34 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2860  large-conductance mechanosensitive channel  63.57 
 
 		 142 aa  172  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.219386 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3697  large-conductance mechanosensitive channel  66.91 
 
 		 143 aa  171  3.9999999999999995e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.93238  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2963  large conductance mechanosensitive channel protein  66.67 
 
 		 142 aa  169  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232112  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0751  large-conductance mechanosensitive channel  64.44 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0788  large-conductance mechanosensitive channel  64.44 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.112062 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3094  large-conductance mechanosensitive channel  63.97 
 
 		 144 aa  163  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.350384  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2455  large-conductance mechanosensitive channel  66.41 
 
 		 141 aa  163  9e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2930  large-conductance mechanosensitive channel  60.94 
 
 		 141 aa  160  4.0000000000000004e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2428  large conductance mechanosensitive channel protein  59.44 
 
 		 142 aa  160  5.0000000000000005e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1187  large conductance mechanosensitive channel protein  63.77 
 
 		 143 aa  160  7e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0848  large-conductance mechanosensitive channel  63.97 
 
 		 137 aa  159  9e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.231503  normal  0.69291 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6128  large-conductance mechanosensitive channel  63.64 
 
 		 143 aa  158  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.316261  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1951  large-conductance mechanosensitive channel  63.64 
 
 		 143 aa  158  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1975  large-conductance mechanosensitive channel  62.88 
 
 		 143 aa  157  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0443039 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1938  large-conductance mechanosensitive channel  62.88 
 
 		 143 aa  157  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1865  large-conductance mechanosensitive channel  62.88 
 
 		 143 aa  157  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.568071  hitchhiker  0.00372648 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0124  large conductance mechanosensitive channel protein  60.45 
 
 		 140 aa  157  5e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.533935  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5262  large-conductance mechanosensitive channel  62.88 
 
 		 143 aa  157  6e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0455479  normal  0.24364 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1501  large-conductance mechanosensitive channel  61.36 
 
 		 143 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.917907  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2079  large-conductance mechanosensitive channel  61.36 
 
 		 143 aa  155  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2000  large-conductance mechanosensitive channel  61.36 
 
 		 143 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3310  large-conductance mechanosensitive channel  61.36 
 
 		 143 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00104042  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2373  large-conductance mechanosensitive channel  61.36 
 
 		 143 aa  155  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140991  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2415  large-conductance mechanosensitive channel  61.36 
 
 		 143 aa  155  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258205  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1272  large-conductance mechanosensitive channel  61.36 
 
 		 143 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.404097  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2521  large-conductance mechanosensitive channel  61.36 
 
 		 199 aa  154  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.334793  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0134  large conductance mechanosensitive channel protein  58.96 
 
 		 140 aa  153  9e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.172297 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0089  large conductance mechanosensitive channel protein  58.46 
 
 		 142 aa  144  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1318  large-conductance mechanosensitive channel  59.56 
 
 		 143 aa  140  7e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.212571  hitchhiker  0.00243459 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3333  large-conductance mechanosensitive channel  57.78 
 
 		 141 aa  140  8e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.662595  hitchhiker  0.000286923 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0929  large-conductance mechanosensitive channel  56.25 
 
 		 140 aa  140  8e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3604  large-conductance mechanosensitive channel-like  81.05 
 
 		 137 aa  139  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0340  large-conductance mechanosensitive channel  55.88 
 
 		 145 aa  139  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.137149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2316  large-conductance mechanosensitive channel  60.45 
 
 		 148 aa  137  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0475958  normal  0.500244 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1871  large-conductance mechanosensitive channel  62.69 
 
 		 148 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0110608  normal  0.0250819 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6045  large conductance mechanosensitive channel protein  59.23 
 
 		 163 aa  136  7.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0318  large-conductance mechanosensitive channel  56.15 
 
 		 138 aa  134  4e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384644  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0334  large-conductance mechanosensitive channel  56.15 
 
 		 138 aa  134  4e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0803754  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3455  large conductance mechanosensitive channel protein  51.91 
 
 		 142 aa  134  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0277457  normal  0.0882552 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0253  large-conductance mechanosensitive channel  57.89 
 
 		 145 aa  134  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0993  large-conductance mechanosensitive channel  55.8 
 
 		 149 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.125438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0880  large-conductance mechanosensitive channel  56.06 
 
 		 155 aa  130  3.9999999999999996e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0911634  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0712  large-conductance mechanosensitive channel  55.15 
 
 		 142 aa  130  6.999999999999999e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0410  large-conductance mechanosensitive channel  54.2 
 
 		 137 aa  130  7.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4693  large-conductance mechanosensitive channel  53.68 
 
 		 138 aa  130  7.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0992  large-conductance mechanosensitive channel  53.08 
 
 		 140 aa  130  9e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.158656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0381  large-conductance mechanosensitive channel  49.65 
 
 		 143 aa  128  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000132352  hitchhiker  0.000000656046 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2607  large conductance mechanosensitive channel protein  53.85 
 
 		 142 aa  128  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  0.681771 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0374  large-conductance mechanosensitive channel  52.08 
 
 		 149 aa  128  3e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.606039  normal  0.0231483 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0622  large conductance mechanosensitive channel protein  57.36 
 
 		 144 aa  127  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0166  large-conductance mechanosensitive channel  56.39 
 
 		 142 aa  127  5.0000000000000004e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.3696  normal  0.313526 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2579  large conductance mechanosensitive channel protein  52.31 
 
 		 141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2802  large conductance mechanosensitive channel protein  52.31 
 
 		 141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.21352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0055  large conductance mechanosensitive channel protein  53.73 
 
 		 140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.153997 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1538  large conductance mechanosensitive channel protein  52.99 
 
 		 143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.580363  normal  0.302083 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1928  large-conductance mechanosensitive channel  50 
 
 		 139 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.425698 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1030  large conductance mechanosensitive channel protein  54.69 
 
 		 139 aa  124  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.184236  normal  0.070135 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2379  large-conductance mechanosensitive channel  51.85 
 
 		 146 aa  124  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.567154 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3208  large conductance mechanosensitive channel protein  50.36 
 
 		 141 aa  123  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0654251  normal  0.948556 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0724  large-conductance mechanosensitive channel  51.85 
 
 		 146 aa  122  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2630  large conductance mechanosensitive channel protein  51.13 
 
 		 138 aa  122  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.425108  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2641  large-conductance mechanosensitive channel  50.36 
 
 		 143 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276841 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2962  large-conductance mechanosensitive channel  47.1 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0437  large-conductance mechanosensitive channel  49.24 
 
 		 133 aa  122  2e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000628379  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0225  large-conductance mechanosensitive channel  56.06 
 
 		 145 aa  121  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2443  large-conductance mechanosensitive channel  51.49 
 
 		 146 aa  121  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.954561  normal  0.582665 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1381  large conductance mechanosensitive channel protein  46.67 
 
 		 132 aa  119  1.9999999999999998e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2603  large-conductance mechanosensitive channel  51.49 
 
 		 143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.240683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3652  large-conductance mechanosensitive channel  47.29 
 
 		 134 aa  117  6e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.326365 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2794  large-conductance mechanosensitive channel  54.55 
 
 		 143 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0647  large conductance mechanosensitive channel protein  50.38 
 
 		 139 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2265  large conductance mechanosensitive channel protein  46.62 
 
 		 145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1961  mechanosensitive channel  52.55 
 
 		 141 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.171648 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2261  large-conductance mechanosensitive channel  48.51 
 
 		 139 aa  114  5e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41090  large-conductance mechanosensitive channel  47.45 
 
 		 136 aa  113  8.999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.629414  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2522  large-conductance mechanosensitive channel  55.65 
 
 		 145 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000515588  normal  0.121482 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0457  large-conductance mechanosensitive channel  45.45 
 
 		 163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3845  large-conductance mechanosensitive channel  48.84 
 
 		 136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3971  large-conductance mechanosensitive channel  48.84 
 
 		 136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3789  large-conductance mechanosensitive channel  48.84 
 
 		 136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0292  large-conductance mechanosensitive channel  45.45 
 
 		 138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0480  large-conductance mechanosensitive channel  48.84 
 
 		 136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0386  large conductance mechanosensitive channel protein  52.31 
 
 		 143 aa  111  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.242536 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3722  large-conductance mechanosensitive channel  46.67 
 
 		 137 aa  110  5e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.459106  hitchhiker  0.00604869 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03141  large-conductance mechanosensitive channel  46.27 
 
 		 136 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0423  large conductance mechanosensitive channel protein  46.27 
 
 		 136 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4639  large-conductance mechanosensitive channel  48.46 
 
 		 139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4641  large conductance mechanosensitive channel protein  49.23 
 
 		 148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03092  hypothetical protein  46.27 
 
 		 136 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3774  large-conductance mechanosensitive channel  46.27 
 
 		 136 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0382022  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3586  large-conductance mechanosensitive channel  46.27 
 
 		 136 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.515412  normal  0.131611 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0423  large-conductance mechanosensitive channel  46.27 
 
 		 136 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.465174  hitchhiker  0.0000168159 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>