More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1813 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_1813  DNA uptake protein  100 
 
 		 173 aa  318  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.390701  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2047  DNA uptake protein  89.47 
 
 		 135 aa  186  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0755007  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2117  DNA uptake protein  88.72 
 
 		 135 aa  185  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000185936  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2014  DNA uptake protein  58.9 
 
 		 148 aa  130  9e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2071  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  50 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0558  Fis family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.340752  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5945  hypothetical protein  43.48 
 
 		 779 aa  58.2  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.961122  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1997  Resolvase RNase H domain protein  49.28 
 
 		 798 aa  58.2  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0478304  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68710  hypothetical protein  43.48 
 
 		 779 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.329631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1707  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.28 
 
 		 798 aa  57.8  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.700604 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1703  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.28 
 
 		 797 aa  57.4  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247477  hitchhiker  0.00353536 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2945  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.38 
 
 		 776 aa  57.4  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1103  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  42.86 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000407291  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2628  Tex-like protein protein-like protein  42.03 
 
 		 801 aa  56.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0703  RNA binding S1  45.71 
 
 		 814 aa  56.6  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.509283  normal  0.104907 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1266  hypothetical protein  39.71 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000976749  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1520  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  48.28 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216127  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4188  RNA binding S1 domain protein  43.48 
 
 		 769 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1508  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  38.1 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1699  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  34.78 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0356  Tex-like protein protein-like protein  44.93 
 
 		 703 aa  55.8  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1122  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  42.59 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.266281  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0962  hypothetical protein  47.83 
 
 		 770 aa  55.5  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.607537  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2512  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  43.4 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4458  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.38 
 
 		 770 aa  55.5  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.135865  normal  0.821812 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2288  RNA binding S1 domain protein  43.48 
 
 		 793 aa  55.5  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000426967  hitchhiker  0.0053186 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1647  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  36.07 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2166  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.83 
 
 		 780 aa  55.5  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.897398  normal  0.40683 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1682  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  36.07 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00173147  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1037  RNA binding S1  43.48 
 
 		 778 aa  55.1  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.255171  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2875  RNA binding S1 domain protein  46.38 
 
 		 791 aa  55.1  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1756  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  44.07 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1762  RNA binding S1 domain protein  44.93 
 
 		 785 aa  54.7  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432806  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3345  RNA-binding S1 domain-containing protein  42.03 
 
 		 706 aa  54.7  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2489  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  37.29 
 
 		 99 aa  54.3  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.632838  normal  0.0131987 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0405  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.28 
 
 		 772 aa  54.7  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2891  hypothetical protein  37.68 
 
 		 789 aa  54.3  0.0000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2746  hypothetical protein  37.68 
 
 		 789 aa  54.3  0.0000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4226  RNA binding S1  44.93 
 
 		 775 aa  54.3  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf783  transcription accessory protein Tex  36.76 
 
 		 717 aa  54.3  0.0000008  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1032  S1 RNA-binding domain-containing protein  44.93 
 
 		 735 aa  54.3  0.0000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.013008  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1706  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.38 
 
 		 803 aa  54.3  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.96157 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2430  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.28 
 
 		 773 aa  54.3  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.388315  normal  0.0422366 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0774  RNA binding protein  49.28 
 
 		 773 aa  54.3  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.394483  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1862  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.93 
 
 		 827 aa  54.3  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3229  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  40.32 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.59864  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0805  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  36.07 
 
 		 250 aa  53.9  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.300188  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3087  putative competence protein ComEA  40.32 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.07347e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2698  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  43.75 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.48092  hitchhiker  0.00000193107 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3100  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  43.75 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0317  RNA binding S1  46.38 
 
 		 772 aa  53.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.499934  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17420  competence protein ComEA-like protein with helix-hairpin-helix repeat region  44.64 
 
 		 279 aa  53.5  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.711078  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3048  hypothetical protein  40.32 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.872404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0735  RNA binding S1 domain protein  44.93 
 
 		 773 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10240  competence protein ComEA-like protein with helix-hairpin-helix repeat region  44.23 
 
 		 243 aa  53.9  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.773806  hitchhiker  0.000000381007 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3421  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.38 
 
 		 788 aa  53.9  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.507063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0813  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.48 
 
 		 771 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.179863  normal  0.675147 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7512  transcriptional accessory protein  44.93 
 
 		 771 aa  53.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.348288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1222  RNA-binding S1 domain-containing protein  42.47 
 
 		 784 aa  52.8  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.923017  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0767  competence protein ComE, putative  40.3 
 
 		 116 aa  53.1  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1091  putative tex protein  46.38 
 
 		 774 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1329  transcription accessory protein, TEX  46.38 
 
 		 774 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.279069  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2212  putative tex protein  46.38 
 
 		 774 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2174  putative tex protein  46.38 
 
 		 774 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2339  transcription accessory protein, TEX  45.71 
 
 		 821 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.367712  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2248  transcription accessory protein, TEX  45.71 
 
 		 775 aa  53.1  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.673592  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0217  RNA binding S1  46.38 
 
 		 864 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.200236 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0259  RNA binding S1  41.43 
 
 		 782 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2537  RNA binding S1  42.03 
 
 		 803 aa  53.1  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417013 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0077  putative tex protein  46.38 
 
 		 774 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.170927  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0870  RNA binding S1 domain protein  45.45 
 
 		 756 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.611113 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08480  transcriptional accessory protein  47.83 
 
 		 775 aa  53.1  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.205113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6672  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.93 
 
 		 901 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.514873  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1493  transcription accessory protein  38.16 
 
 		 767 aa  52.8  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2803  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  49.02 
 
 		 277 aa  52.8  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00510  RNA binding S1 domain protein  42.62 
 
 		 722 aa  53.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000209068  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2245  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.28 
 
 		 798 aa  53.1  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.659597  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1521  late competence protein required for DNA binding and uptake  35.48 
 
 		 231 aa  53.1  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1838  RNA-binding S1 domain-containing protein  40.91 
 
 		 788 aa  53.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.225923  normal  0.149327 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2410  RNA binding S1 domain protein  43.48 
 
 		 795 aa  53.1  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.367587  normal  0.911918 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1942  RNA-binding S1 domain-containing protein  42.03 
 
 		 778 aa  53.1  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0410513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1819  putative tex protein  46.38 
 
 		 774 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00795  S1 RNA binding domain protein  43.48 
 
 		 786 aa  52.4  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0660252  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3374  RNA-binding S1 domain-containing protein  42.03 
 
 		 786 aa  52.4  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4447  comE operon protein 1  36.21 
 
 		 198 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00373204  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1709  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.29 
 
 		 813 aa  52.8  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0127  hypothetical protein  40.91 
 
 		 840 aa  52.4  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.294313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0790  comE operon protein 1  36.21 
 
 		 198 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0708257  hitchhiker  0.000000131461 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1657  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  48.08 
 
 		 226 aa  52.4  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.11522  hitchhiker  0.000932836 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2316  RNA-binding domain-containing protein  45.31 
 
 		 740 aa  52.8  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004039  DNA uptake protein  39.34 
 
 		 97 aa  52.8  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000258752  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1736  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.29 
 
 		 774 aa  52.4  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.605663  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0962  DNA uptake protein or related DNA-binding protein  32.79 
 
 		 109 aa  52.4  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1484  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  46.43 
 
 		 194 aa  52  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0354  RNA binding S1 domain protein  40.98 
 
 		 718 aa  52  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0257  RNA binding S1  39.13 
 
 		 772 aa  52  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1561  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  29.69 
 
 		 105 aa  52  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.230085  hitchhiker  0.0000735026 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2991  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.29 
 
 		 772 aa  52  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.940851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3820  RNA-binding S1 domain-containing protein  38.96 
 
 		 776 aa  52  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0995  RNA-binding S1 domain-containing protein  42.86 
 
 		 723 aa  52  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.5301 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>