More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2117 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2117  DNA uptake protein  100 
 
 
135 aa  254  3e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000185936  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2047  DNA uptake protein  97.04 
 
 
135 aa  199  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0755007  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1813  DNA uptake protein  88.72 
 
 
173 aa  185  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.390701  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2014  DNA uptake protein  62.16 
 
 
148 aa  124  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2489  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  42.37 
 
 
99 aa  60.1  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.632838  normal  0.0131987 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1266  hypothetical protein  41.18 
 
 
184 aa  57.4  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000976749  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1521  late competence protein required for DNA binding and uptake  32.99 
 
 
231 aa  56.6  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0126  ComE operon protein (competence protein)  30.36 
 
 
111 aa  55.8  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2071  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  50 
 
 
190 aa  55.5  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2512  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  43.55 
 
 
213 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1103  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  40.98 
 
 
187 aa  55.1  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000407291  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17420  competence protein ComEA-like protein with helix-hairpin-helix repeat region  47.37 
 
 
279 aa  54.7  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.711078  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1508  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  39.66 
 
 
127 aa  54.7  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1699  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  36.23 
 
 
181 aa  54.7  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1122  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  40.74 
 
 
235 aa  53.9  0.0000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.266281  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1230  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  29.25 
 
 
296 aa  53.5  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.890666  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10240  competence protein ComEA-like protein with helix-hairpin-helix repeat region  46.15 
 
 
243 aa  53.1  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.773806  hitchhiker  0.000000381007 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1008  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  36.84 
 
 
114 aa  52.8  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000463906  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0558  Fis family transcriptional regulator  44.62 
 
 
99 aa  53.5  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.340752  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1878  DNA uptake protein and related DNA-binding proteins-like  38.24 
 
 
192 aa  52.8  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.137152  hitchhiker  0.0012387 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1997  Resolvase RNase H domain protein  44.93 
 
 
798 aa  52.8  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0478304  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1704  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  35.59 
 
 
227 aa  52.4  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1771  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  36.36 
 
 
99 aa  52.8  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.219727  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1668  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  40.32 
 
 
206 aa  52.4  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1520  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  46.55 
 
 
107 aa  52.4  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216127  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1493  transcription accessory protein  40 
 
 
767 aa  52.8  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07770  competence protein ComEA-like protein with helix-hairpin-helix repeat region  38.46 
 
 
255 aa  52.4  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.734048 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0962  DNA uptake protein or related DNA-binding protein  37.04 
 
 
109 aa  52.8  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1707  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.93 
 
 
798 aa  52.4  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.700604 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2245  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.16 
 
 
798 aa  52.4  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.659597  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1484  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  50 
 
 
194 aa  51.6  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1682  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  33.33 
 
 
225 aa  52  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00173147  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1647  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  33.33 
 
 
225 aa  52  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3017  hypothetical protein  35 
 
 
184 aa  51.6  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf783  transcription accessory protein Tex  34.33 
 
 
717 aa  51.6  0.000004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1561  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  32.26 
 
 
105 aa  51.6  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.230085  hitchhiker  0.0000735026 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2537  RNA binding S1  39.19 
 
 
803 aa  51.6  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417013 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4226  RNA binding S1  40.79 
 
 
775 aa  51.2  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1548  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  41.94 
 
 
89 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.157658  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0170  RNA-binding S1 domain-containing protein  41.94 
 
 
791 aa  50.8  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1756  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  42.62 
 
 
181 aa  50.8  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3743  hypothetical protein  41.94 
 
 
791 aa  50.8  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3198  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  34.43 
 
 
102 aa  50.8  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3982  hypothetical protein  41.94 
 
 
791 aa  50.8  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1243  DNA uptake protein-related DNA-binding protein  40.98 
 
 
103 aa  50.8  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000104956 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0767  competence protein ComE, putative  47.06 
 
 
116 aa  50.4  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0922  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  36.84 
 
 
99 aa  50.4  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.425592 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1066  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  36.84 
 
 
99 aa  50.4  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2698  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  41.54 
 
 
135 aa  50.1  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.48092  hitchhiker  0.00000193107 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3100  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  41.54 
 
 
135 aa  50.1  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1175  DNA uptake protein related DNA-binding protein  35.71 
 
 
246 aa  50.4  0.000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000209814  hitchhiker  0.00000760392 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3915  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  45.61 
 
 
269 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.261792  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1797  ComEA-related protein  35.29 
 
 
189 aa  49.7  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00425429  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3912  RNA binding S1 domain protein  40.32 
 
 
777 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4104  Tex-like protein protein-like protein  40.32 
 
 
777 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5945  hypothetical protein  38.81 
 
 
779 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.961122  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1612  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  32.86 
 
 
122 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1623  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  32.86 
 
 
122 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2731  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  32.86 
 
 
122 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0259304 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2156  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  52.08 
 
 
90 aa  49.7  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.367346  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1741  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  34.48 
 
 
184 aa  50.1  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0277947  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68710  hypothetical protein  38.81 
 
 
779 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.329631  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1589  DNA uptake protein related DNA-binding protein  32.14 
 
 
211 aa  50.1  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.821877  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4458  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.48 
 
 
770 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.135865  normal  0.821812 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3421  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.48 
 
 
788 aa  49.7  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.507063  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1942  RNA-binding S1 domain-containing protein  40.58 
 
 
778 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0410513  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1646  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  32.86 
 
 
122 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.330475  normal  0.397521 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0584  RNA binding S1 domain protein  43.55 
 
 
769 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.717148 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1657  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  48.08 
 
 
226 aa  49.7  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.11522  hitchhiker  0.000932836 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2945  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.9 
 
 
776 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1813  DNA-binding protein, putative  31.17 
 
 
121 aa  49.7  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2628  Tex-like protein protein-like protein  37.68 
 
 
801 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168465  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3267  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  43.86 
 
 
271 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00676892  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1862  RNA-binding S1 domain-containing protein  40.58 
 
 
827 aa  49.3  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2875  RNA binding S1 domain protein  39.73 
 
 
791 aa  48.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0962  hypothetical protein  45.71 
 
 
770 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.607537  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3820  RNA-binding S1 domain-containing protein  37.68 
 
 
776 aa  49.3  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3053  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  35 
 
 
200 aa  49.3  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0703  RNA binding S1  40 
 
 
814 aa  48.9  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.509283  normal  0.104907 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2288  hypothetical protein  42.03 
 
 
773 aa  48.9  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2476  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  31.15 
 
 
121 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2544  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  31.15 
 
 
121 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.644466  normal  0.0231779 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3374  RNA-binding S1 domain-containing protein  38.16 
 
 
786 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0462  ComE operon protein 1  30 
 
 
83 aa  48.5  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0127  hypothetical protein  41.67 
 
 
840 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.294313  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4857  phospholipase D/transphosphatidylase  36.07 
 
 
528 aa  48.5  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404738  hitchhiker  0.00000312959 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0354  RNA binding S1 domain protein  36.67 
 
 
718 aa  48.9  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4627  RNA-binding S1 domain-containing protein  40.32 
 
 
777 aa  48.5  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2642  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  31.15 
 
 
121 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.377933 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2451  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  39.66 
 
 
204 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0119288  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2288  RNA binding S1 domain protein  39.13 
 
 
793 aa  48.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000426967  hitchhiker  0.0053186 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4447  comE operon protein 1  35.71 
 
 
198 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00373204  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4188  RNA binding S1 domain protein  42.62 
 
 
769 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0570  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  42.31 
 
 
224 aa  48.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000494468  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0790  comE operon protein 1  35.71 
 
 
198 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0708257  hitchhiker  0.000000131461 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1691  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  44.64 
 
 
222 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.176877  unclonable  0.000000000719685 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3093  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  30.65 
 
 
107 aa  48.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000182901 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3469  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  42.86 
 
 
280 aa  48.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.389617  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3304  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  36.54 
 
 
214 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0506678  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1222  RNA-binding S1 domain-containing protein  38.16 
 
 
784 aa  48.1  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.923017  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>