54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3903 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3903  hypothetical protein  100 
 
 
210 aa  437  9.999999999999999e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00027123  normal  0.0133719 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3531  hypothetical protein  32 
 
 
209 aa  96.3  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0110536  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0569  cytidylate kinase  27.23 
 
 
204 aa  89.7  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1957  membrane protein-like protein  30.14 
 
 
473 aa  85.1  7e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.217761  hitchhiker  0.00755155 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3706  hypothetical protein  28.02 
 
 
204 aa  84  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0901  putative cytidylate kinase, putative  27.41 
 
 
214 aa  84.3  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00118892  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0106  cytidylate kinase  30.5 
 
 
201 aa  80.9  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2114  hypothetical protein  26.88 
 
 
202 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000150815  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1705  hypothetical protein  27.67 
 
 
209 aa  76.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.298807 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20820  predicted membrane protein  27.17 
 
 
428 aa  76.3  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.716498  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3455  hypothetical protein  29.38 
 
 
231 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4038  hypothetical protein  25.12 
 
 
210 aa  69.7  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2809  transport-associated protein  25.49 
 
 
273 aa  68.6  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00612028  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0288  hypothetical protein  25.13 
 
 
252 aa  67  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.511661  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0922  hypothetical protein  26.96 
 
 
209 aa  66.6  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.791137 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0658  putative cytidylate kinase  25.13 
 
 
207 aa  65.5  0.0000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0365  hypothetical protein  26.43 
 
 
242 aa  65.1  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0656462  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3716  hypothetical protein  24.62 
 
 
238 aa  63.9  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3811  hypothetical protein  24.1 
 
 
238 aa  63.2  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0517  hypothetical protein  27.01 
 
 
231 aa  62.8  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2312  transport-associated  24.75 
 
 
271 aa  62.8  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000102264  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1486  hypothetical protein  24.61 
 
 
234 aa  62  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0009  hypothetical protein  28.42 
 
 
273 aa  61.2  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0357  hypothetical protein  24.61 
 
 
234 aa  60.8  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000646753 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1911  transport-associated protein  24.26 
 
 
271 aa  60.5  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.551319 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0377  hypothetical protein  24.08 
 
 
234 aa  59.7  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0672  hypothetical protein  26.29 
 
 
236 aa  59.3  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0471907  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3885  hypothetical protein  28.9 
 
 
219 aa  58.9  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1653  hypothetical protein  25 
 
 
229 aa  58.5  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000117481  normal  0.338305 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1652  hypothetical protein  27.57 
 
 
229 aa  58.5  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000202399  normal  0.336802 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0168  putative hypoxanthine phosphoribosyl transferase with additional GAF motif  21.9 
 
 
310 aa  57.8  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1925  transport-associated domain-containing protein  25.14 
 
 
273 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.237586  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1325  transport-associated protein  24.76 
 
 
275 aa  56.2  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0768925  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2391  hypothetical protein  23.83 
 
 
240 aa  56.2  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2646  hypothetical protein  28.06 
 
 
229 aa  56.2  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1979  transport-associated protein  25 
 
 
273 aa  55.8  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000154767  normal  0.0601452 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3022  hypothetical protein  26.06 
 
 
276 aa  55.1  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0661  transport-associated  24.5 
 
 
275 aa  53.9  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2837  hypothetical protein  26.98 
 
 
236 aa  51.6  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000106697  hitchhiker  2.88656e-20 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2332  hypothetical protein  21.47 
 
 
245 aa  50.1  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38203  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1793  hypothetical protein  23.56 
 
 
236 aa  50.4  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000475363  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1485  hypothetical protein  24.74 
 
 
234 aa  49.3  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.520074  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1336  hypothetical protein  23.24 
 
 
259 aa  48.5  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0118  cytidylate kinase  29.73 
 
 
180 aa  45.4  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000087822  hitchhiker  0.0000442728 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1735  cytidylate kinase  38.89 
 
 
231 aa  43.5  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610181  decreased coverage  0.000087686 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2069  cytidylate kinase  37.04 
 
 
230 aa  42.4  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000019021  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2065  cytidylate kinase  37.04 
 
 
230 aa  42.4  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000105966  unclonable  0.00000000000213103 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1976  cytidylate kinase  37.04 
 
 
230 aa  42.4  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000166074  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1923  cytidylate kinase  37.04 
 
 
230 aa  42.4  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000722421  unclonable  0.0000000000403388 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2280  cytidylate kinase  37.04 
 
 
230 aa  42.4  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000793863  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2403  cytidylate kinase  37.04 
 
 
230 aa  42.4  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2397  cytidylate kinase  37.04 
 
 
230 aa  42.4  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000169082  unclonable  0.00000986897 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2043  cytidylate kinase  37.04 
 
 
230 aa  42  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000246913  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2055  cytidylate kinase  37.04 
 
 
230 aa  42.4  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000628627  unclonable  0.0000241467 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>