More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3221 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3221  cytidylate kinase  100 
 
 
227 aa  447  1e-125  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529092  normal  0.197926 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  46.76 
 
 
224 aa  199  3e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  42.27 
 
 
218 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0453  cytidylate kinase  48.18 
 
 
224 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  44.75 
 
 
225 aa  187  9e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  43.11 
 
 
232 aa  186  3e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  42.59 
 
 
214 aa  185  6e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  44.04 
 
 
225 aa  184  8e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  45.09 
 
 
226 aa  184  9e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  44.5 
 
 
225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  45.07 
 
 
225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  44.04 
 
 
225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  44.04 
 
 
225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2816  cytidylate kinase  47.71 
 
 
244 aa  183  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0539109  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  45.07 
 
 
225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  44.04 
 
 
225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  44.95 
 
 
225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  44.04 
 
 
225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6626  cytidylate kinase  43.18 
 
 
228 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.422792 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1234  cytidylate kinase  49.12 
 
 
255 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  44.04 
 
 
225 aa  181  7e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  44.09 
 
 
233 aa  181  7e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0891  cytidylate kinase  44.5 
 
 
230 aa  181  9.000000000000001e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00236441  decreased coverage  0.00000000000000152921 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0934  cytidylate kinase  42.66 
 
 
213 aa  178  4.999999999999999e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3643  cytidylate kinase  45.5 
 
 
229 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000551434  normal  0.674927 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1346  cytidylate kinase  40.47 
 
 
219 aa  178  7e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0048747  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0993  cytidylate kinase  42.92 
 
 
233 aa  177  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  44.09 
 
 
232 aa  177  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  45.58 
 
 
229 aa  177  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1749  cytidylate kinase  44.14 
 
 
229 aa  176  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00238031  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1884  cytidylate kinase  42.79 
 
 
235 aa  176  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000963447  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3257  cytidylate kinase  41.59 
 
 
233 aa  175  6e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0255416  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1465  cytidylate kinase  43.18 
 
 
240 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00293534  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2124  cytidylate kinase  42.48 
 
 
229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109139  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1293  cytidylate kinase  41.74 
 
 
224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00871161  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1026  cytidylate kinase  44.75 
 
 
226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000434199  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2467  cytidylate kinase  41.01 
 
 
225 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000550284  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0544  cytidylate kinase  39.17 
 
 
220 aa  172  5e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.773366  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.59 
 
 
511 aa  171  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1362  cytidylate kinase  45.05 
 
 
228 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0105821  normal  0.0198977 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1752  cytidylate kinase  43.38 
 
 
227 aa  171  9e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000925539  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1771  cytidylate kinase  44.75 
 
 
228 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00506628  normal  0.0452484 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2380  cytidylate kinase  48.1 
 
 
243 aa  171  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.042532  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.59 
 
 
511 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3943  cytidylate kinase  44.75 
 
 
225 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.302806  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1853  cytidylate kinase  44.09 
 
 
221 aa  170  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0179513  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1045  cytidylate kinase  42.59 
 
 
215 aa  169  3e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.117203  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1409  cytidylate kinase  41.67 
 
 
224 aa  169  3e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0393534  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2299  cytidylate kinase  44.29 
 
 
230 aa  169  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000399193  unclonable  0.0000000000955893 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  42.33 
 
 
221 aa  169  4e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2450  cytidylate kinase  40.64 
 
 
227 aa  169  5e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000180887  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.67 
 
 
534 aa  168  6e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1860  cytidylate kinase  41.26 
 
 
220 aa  168  6e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.10096  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2100  cytidylate kinase  41.94 
 
 
229 aa  168  7e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.578851 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1190  cytidylate kinase  42.4 
 
 
225 aa  167  8e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.988165  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1378  cytidylate kinase  44.75 
 
 
228 aa  167  9e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.925348  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0977  cytidylate kinase  41.98 
 
 
237 aa  167  1e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000004631  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0725  cytidylate kinase  41.82 
 
 
514 aa  166  2e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0311607  normal  0.0975143 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2310  cytidylate kinase  44.09 
 
 
230 aa  167  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000698578  hitchhiker  0.000000443143 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1291  cytidylate kinase  44.05 
 
 
228 aa  166  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2340  cytidylate kinase  43.81 
 
 
229 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000158492  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4073  cytidylate kinase  44.59 
 
 
229 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293328  normal  0.11895 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1165  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.93 
 
 
516 aa  165  4e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.841072  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1506  cytidylate kinase  42.52 
 
 
229 aa  166  4e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000236579  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.19 
 
 
528 aa  165  4e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1008  cytidylate kinase  39.17 
 
 
219 aa  165  5e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1534  cytidylate kinase  39.37 
 
 
219 aa  165  6.9999999999999995e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1565  cytidylate kinase  39.37 
 
 
219 aa  165  6.9999999999999995e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.464485  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2164  cytidylate kinase  41.47 
 
 
232 aa  164  6.9999999999999995e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00199731  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2605  cytidylate kinase  42.6 
 
 
233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1966  cytidylate kinase  44.34 
 
 
229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20401  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.47 
 
 
516 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.523642  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2370  cytidylate kinase  43.12 
 
 
230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4053  cytidylate kinase  44 
 
 
237 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.737669  normal  0.51193 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2043  cytidylate kinase  41.92 
 
 
230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000246913  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1180  cytidylate kinase  41.4 
 
 
232 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.848672  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0865  cytidylate kinase  42.36 
 
 
232 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.054851  normal  0.903587 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  45.07 
 
 
222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1923  cytidylate kinase  42.92 
 
 
230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000722421  unclonable  0.0000000000403388 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1976  cytidylate kinase  42.92 
 
 
230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000166074  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0578  cytidylate kinase  34.07 
 
 
222 aa  162  3e-39  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  42.01 
 
 
539 aa  162  3e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09660  cytidylate kinase  41.67 
 
 
223 aa  162  3e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2055  cytidylate kinase  42.92 
 
 
230 aa  162  3e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000628627  unclonable  0.0000241467 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1385  cytidylate kinase  41.47 
 
 
227 aa  162  4.0000000000000004e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2403  cytidylate kinase  42.47 
 
 
230 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1729  cytidylate kinase  43.06 
 
 
223 aa  162  5.0000000000000005e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2756  cytidylate kinase  39.46 
 
 
230 aa  162  5.0000000000000005e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2072  cytidylate kinase  41.23 
 
 
230 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000270816  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23320  cytidylate kinase  43.87 
 
 
229 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000301501  normal  0.0247908 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2309  cytidylate kinase  43.12 
 
 
237 aa  161  6e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.6369 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2856  cytidylate kinase  42.99 
 
 
227 aa  161  6e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000021992  hitchhiker  0.0000000124191 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11727  cytidylate kinase  42.54 
 
 
230 aa  161  7e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.551451 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0963  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  44.19 
 
 
699 aa  161  8.000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1333  cytidylate kinase  43.38 
 
 
252 aa  161  9e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.671241 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  43.19 
 
 
227 aa  161  9e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2397  cytidylate kinase  40.61 
 
 
230 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000169082  unclonable  0.00000986897 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2069  cytidylate kinase  40.61 
 
 
230 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000019021  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3494  cytidylate kinase  45.05 
 
 
228 aa  160  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121252  normal  0.220697 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2280  cytidylate kinase  40.61 
 
 
230 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000793863  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>