265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2940 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2940  peptidase M28  100 
 
 		 552 aa  1144    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2040  peptidase M28  51.3 
 
 		 578 aa  541  1e-153  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.194253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1208  peptidase M28  50.19 
 
 		 525 aa  506  9.999999999999999e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382894  decreased coverage  0.00811068 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0906  peptidase M28  47.78 
 
 		 544 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0844  peptidase M28  41.88 
 
 		 539 aa  409  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2848  peptidase M28  29.12 
 
 		 526 aa  192  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549527  normal  0.194902 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3044  peptidase M28  25.43 
 
 		 468 aa  133  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000101958  normal  0.29803 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2654  peptidase M28  26.2 
 
 		 525 aa  131  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.423469 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2962  peptidase M28  24.95 
 
 		 468 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00173052  normal  0.676879 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3142  peptidase M28  24.56 
 
 		 468 aa  125  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000890237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2895  peptidase M28  30.5 
 
 		 481 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0744794  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1054  peptidase M28  24.56 
 
 		 469 aa  121  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.580961  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1286  peptidase M28  24.81 
 
 		 466 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000415736  normal  0.392366 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1150  peptidase M28  23.89 
 
 		 468 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000117786  normal  0.22119 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1362  peptidase M28  23.85 
 
 		 495 aa  118  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.162739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3240  peptidase M28  23.89 
 
 		 468 aa  118  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267852  normal  0.504623 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1049  peptidase M28  23.89 
 
 		 468 aa  118  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1116  peptidase M28  23.89 
 
 		 468 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000079399  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1094  peptidase M28  27.96 
 
 		 468 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000099485  normal  0.0169877 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2728  peptidase M28  23.83 
 
 		 481 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349349  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1190  peptidase M28  23.5 
 
 		 458 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3539  M28D family peptidase  26.1 
 
 		 414 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1189  peptidase M28  22.28 
 
 		 477 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0919  peptidase M28  30.1 
 
 		 467 aa  108  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000320691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3182  peptidase M28  21.7 
 
 		 472 aa  107  7e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.569108  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3197  peptidase M28  25.14 
 
 		 473 aa  101  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.815061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  26.46 
 
 		 497 aa  100  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2554  M28 family peptidase  29.22 
 
 		 469 aa  99  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3661  peptidase M28  23.67 
 
 		 468 aa  96.7  9e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.21215 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6038  peptidase M28  28.73 
 
 		 454 aa  95.9  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1103  peptidase M28  23.6 
 
 		 471 aa  93.6  9e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.608477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4110  peptidase M28  26.1 
 
 		 487 aa  91.7  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0237  peptidase M28  25.36 
 
 		 471 aa  90.5  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.706232 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5666  Endoribonuclease L-PSP  24.19 
 
 		 580 aa  89.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.106128  normal  0.852479 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12058  peptidase, M28D family protein  41.18 
 
 		 472 aa  83.6  0.000000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02736  aminopeptidase  23.96 
 
 		 471 aa  83.2  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.465186  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0075  peptidase M28  28.97 
 
 		 947 aa  81.3  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11414  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0412  peptidase M28  24.9 
 
 		 460 aa  80.5  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0420601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2350  peptidase M28  39.64 
 
 		 457 aa  78.2  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2403  aminopeptidase Y  40.57 
 
 		 512 aa  77  0.0000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18700  predicted aminopeptidase  26.11 
 
 		 678 aa  75.5  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.561115 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6549  peptidase M28  26.62 
 
 		 551 aa  75.1  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.657933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3518  peptidase M28  40.48 
 
 		 463 aa  74.3  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3241  peptidase M28  24.04 
 
 		 436 aa  73.2  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2819  glutamate carboxypeptidase II  47.06 
 
 		 757 aa  72.4  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.140178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0749  Aminopeptidase Y  33.33 
 
 		 512 aa  70.1  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0344  Aminopeptidase Y  37.3 
 
 		 534 aa  69.3  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138174  normal  0.69761 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04018  glutamate carboxypeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03740)  30.12 
 
 		 772 aa  68.6  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.791672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2578  peptidase M28  41.18 
 
 		 563 aa  68.2  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0256321  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5208  aminopeptidase  26.99 
 
 		 466 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274505  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  26.99 
 
 		 466 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5215  peptidase M28  36.59 
 
 		 450 aa  67.4  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.05114  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0792  Aminopeptidase S  40 
 
 		 502 aa  67.4  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0806  peptidase M28  29.95 
 
 		 563 aa  67.4  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.661029 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2100  hypothetical protein  38.98 
 
 		 542 aa  66.2  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.544432 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1367  Glutamate carboxypeptidase II  38 
 
 		 751 aa  65.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0341097  normal  0.079347 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1604  peptidase M28  25.68 
 
 		 291 aa  65.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.548091 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01630  aminopeptidase Y  30.69 
 
 		 509 aa  65.5  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.777606  normal  0.140751 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  38.71 
 
 		 547 aa  65.9  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0415  peptidase M28  23.69 
 
 		 440 aa  65.9  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  26.11 
 
 		 346 aa  65.5  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1408  aminopeptidase Y  41.38 
 
 		 518 aa  65.5  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1367  aminopeptidase Y  41.38 
 
 		 519 aa  64.7  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.227193  hitchhiker  0.000286251 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2092  Glutamate carboxypeptidase II  28.95 
 
 		 727 aa  64.3  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135334  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5056  aminopeptidase  26.09 
 
 		 466 aa  63.9  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418047  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0141  peptidase M28  35.29 
 
 		 524 aa  64.3  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.481582 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5537  putative aminopeptidase  26.09 
 
 		 466 aa  63.9  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2466  glutamate carboxypeptidase II  33.65 
 
 		 725 aa  63.9  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0461903  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3876  peptidase M28  24.89 
 
 		 466 aa  63.9  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  25.55 
 
 		 465 aa  63.9  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5040  aminopeptidase  26.55 
 
 		 466 aa  63.5  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5450  putative aminopeptidase  26.55 
 
 		 466 aa  63.9  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1093  peptidase M28  26.79 
 
 		 454 aa  63.5  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4009  Glutamate carboxypeptidase II  29.44 
 
 		 743 aa  63.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  decreased coverage  0.0030346 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3997  peptidase M28  22.09 
 
 		 456 aa  63.2  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664765  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0927  Aminopeptidase Y  44.87 
 
 		 548 aa  62.8  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464767  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33956  membrane protein involved in vacuolar protein sorting  41.3 
 
 		 800 aa  63.5  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5488  aminopeptidase, putative  26.09 
 
 		 466 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4953  Aminopeptidase Y  30.08 
 
 		 312 aa  62.4  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000539028  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0653  peptidase M28  22.83 
 
 		 438 aa  62.8  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.602384  normal  0.117412 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1852  leucine aminopeptidase, putative  28.9 
 
 		 408 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0188761  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0543  aminopeptidase Y  51.47 
 
 		 501 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.207964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0553  aminopeptidase Y  51.47 
 
 		 501 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0565  aminopeptidase Y  51.47 
 
 		 501 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.234277 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1182  Aminopeptidase Y  36.8 
 
 		 481 aa  61.6  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  25.75 
 
 		 309 aa  62  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04925  glutamate carboxypeptidase Tre2, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10650)  25 
 
 		 884 aa  61.2  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0450501  normal  0.0918847 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2907  peptidase M28  22.9 
 
 		 463 aa  61.6  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2823  glutamate carboxypeptidase II  40.4 
 
 		 712 aa  61.2  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.261678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0518  Glutamate carboxypeptidase II  36.9 
 
 		 734 aa  61.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.925044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0754  Aminopeptidase S  47.89 
 
 		 512 aa  61.2  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5481  putative aminopeptidase  25.31 
 
 		 466 aa  61.2  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02920  protein-vacuolar targeting-related protein, putative  37.38 
 
 		 911 aa  61.2  0.00000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3786  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  42.31 
 
 		 1131 aa  60.8  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.550121  normal  0.857915 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  27.54 
 
 		 529 aa  60.5  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  28.96 
 
 		 1103 aa  60.5  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  40.38 
 
 		 550 aa  60.5  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3109  protease-associated PA domain protein  30.43 
 
 		 698 aa  60.1  0.00000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000536812  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5470  putative aminopeptidase  25.22 
 
 		 466 aa  60.1  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.155221 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  31.48 
 
 		 323 aa  60.1  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>