More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0101 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0101  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 285 aa  556  1e-157  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2073  transcriptional regulator, LysR family  52.99 
 
 		 285 aa  267  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.348015 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1556  transcriptional regulator, LysR family  45.42 
 
 		 286 aa  233  3e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8423  Transcriptional regulator-like protein  34.51 
 
 		 297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1888  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 297 aa  101  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.282153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5022  transcriptional regulator, LysR family  32.88 
 
 		 299 aa  99  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.851594  normal  0.174295 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3895  LysR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 292 aa  93.2  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.958573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3205  LysR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 314 aa  92.4  8e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4411  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 291 aa  91.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0509478  normal  0.98744 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0474  LysR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 293 aa  89.4  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316429  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3948  LysR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 291 aa  88.2  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.19042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68920  LysR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 304 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0664  LysR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 295 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0825274 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6822  LysR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 299 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4630  LysR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 295 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.133598  hitchhiker  0.000277503 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5031  transcriptional regulator, LysR family  27.89 
 
 		 289 aa  86.7  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1225  LysR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 306 aa  85.9  6e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8824  transcriptional regulator, LysR family  26.53 
 
 		 316 aa  85.5  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00799583 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2265  transcriptional regulator, LysR family  30.85 
 
 		 321 aa  85.1  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5299  LysR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 290 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0530813 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1930  LysR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 306 aa  84.7  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4518  LysR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 302 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0307  LysR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 298 aa  82.8  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3379  LysR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 290 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311743  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1156  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 306 aa  82.8  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4988  LysR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 290 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4290  LysR family transcriptional regulator  41.32 
 
 		 328 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.376477 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4971  LysR family transcriptional regulator  41.32 
 
 		 328 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0570046  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3189  LysR family transcriptional regulator  41.32 
 
 		 328 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7124  transcriptional regulator, LysR family  27.21 
 
 		 288 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.281926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1012  LysR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 305 aa  79.3  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0144903  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2571  transcriptional regulator, LysR family  28.16 
 
 		 303 aa  79  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000871152  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1442  transcriptional regulator, LysR family  29.1 
 
 		 306 aa  78.2  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.200576 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44500  Transcriptinal regulator, LysR family  28.82 
 
 		 301 aa  78.2  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.581761  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2064  transcriptional regulator, LysR family  28.62 
 
 		 306 aa  78.6  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.053811  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4677  LysR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 343 aa  78.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0483253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0331  transcriptional regulator, LysR family  28.62 
 
 		 306 aa  78.6  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.172645  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01564  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.58 
 
 		 297 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2048  transcriptional regulator, LysR family  30.58 
 
 		 297 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2741  LysR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 303 aa  77.8  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.293546  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1669  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 297 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2231  LysR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 298 aa  77.4  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.392595  normal  0.0608782 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1680  LysR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 293 aa  77.8  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.21592  normal  0.237518 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2035  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 297 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0742  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 300 aa  77.8  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.787719  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01554  hypothetical protein  30.58 
 
 		 297 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1802  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 297 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2305  transcriptional regulator, LysR family  30.58 
 
 		 297 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.112257 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3091  transcriptional regulator, LysR family  30.56 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.339744  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2390  LysR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1605  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45170  Transcriptional regulator, LysR family  30.38 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0335  LysR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 291 aa  77.4  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.854024  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30850  LysR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2897  transcriptional regulator, LysR family  31.32 
 
 		 298 aa  76.3  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00606116  hitchhiker  0.00007682 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1183  LysR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 297 aa  76.3  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3552  LysR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 297 aa  76.3  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.964874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4923  LysR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 299 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0544  transcriptional regulator, LysR family  32.99 
 
 		 295 aa  75.9  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3249  LysR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 297 aa  75.9  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.332208  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1781  transcriptional regulator, LysR family  30.58 
 
 		 297 aa  75.9  0.0000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3510  transcriptional regulator, LysR family  30.23 
 
 		 304 aa  75.5  0.0000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3223  LysR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 315 aa  75.5  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.042632  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2724  ben operon transcriptional regulator BenM  30.37 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 323 aa  75.1  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0216  ben operon transcriptional regulator BenM  30.37 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4207  LysR substrate-binding protein  28.17 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0075  LysR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1361  ben operon transcriptional regulator BenM  30.37 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1557  ben operon transcriptional regulator BenM  30.37 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5901  transcriptional regulator, LysR family  30.39 
 
 		 279 aa  74.7  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0417  LysR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784631  normal  0.373184 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2453  LysR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452417  normal  0.317953 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0286  LysR substrate binding domain protein  32.35 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.492247 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2120  LysR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 319 aa  74.3  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.526762  normal  0.085988 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1891  transcriptional regulator, LysR family  30.1 
 
 		 314 aa  74.3  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0242  LysR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 312 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3720  LysR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.101076  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2580  ben operon transcriptional regulator BenM  30.37 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4797  transcriptional regulator, LysR family  36.42 
 
 		 331 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0282773  hitchhiker  0.00000720419 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4648  LysR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3529  LysR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.741174 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0294  LysR substrate binding domain-containing protein  32.35 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5906  putative transcriptional regulator-LysR family  30.69 
 
 		 284 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0462787  normal  0.148596 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5656  LysR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 305 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601684 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6254  LysR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 320 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0474  transcriptional regulator CatR  29.91 
 
 		 306 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0300  LysR substrate binding domain protein  32.35 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0279  LysR substrate binding domain-containing protein  32.35 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3076  LysR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00201  predicted DNA-binding transcriptional regulator  32.94 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0488817  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0821  transcriptional regulator, LysR family  29.43 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0540741  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0219  transcriptional regulator, LysR family  32.94 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0947098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00206  hypothetical protein  32.94 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0410723  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2282  LysR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 302 aa  73.6  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0266423 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0212  LysR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00206756  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0212  LysR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223071  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3457  LysR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.451664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3007  LysR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 306 aa  73.6  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2019  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.250763 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>