More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3189 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4290  LysR family transcriptional regulator  99.7 
 
 		 328 aa  659    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.376477 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3189  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 328 aa  660    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4971  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 328 aa  660    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0570046  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2931  LysR family transcriptional regulator  81.46 
 
 		 352 aa  487  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1865  LysR family transcriptional regulator  47 
 
 		 313 aa  279  5e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000631239 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1371  LysR family transcriptional regulator  46.78 
 
 		 313 aa  277  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1332  LysR family transcriptional regulator  46.78 
 
 		 313 aa  277  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0601876  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1428  LysR family transcriptional regulator  46.28 
 
 		 313 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.986267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1450  LysR family transcriptional regulator  46.28 
 
 		 313 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135059  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0968  LysR family transcriptional regulator  46.28 
 
 		 313 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1864  LysR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 331 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.708451  normal  0.0358907 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4595  LysR family transcriptional regulator  46.28 
 
 		 313 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.489457  normal  0.672145 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4797  transcriptional regulator, LysR family  45.58 
 
 		 331 aa  267  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0282773  hitchhiker  0.00000720419 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1347  LysR family transcriptional regulator  43.73 
 
 		 312 aa  267  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.336134 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1679  LysR family transcriptional regulator  44.75 
 
 		 313 aa  266  5e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0936  transcriptional regulator  44.75 
 
 		 313 aa  265  8e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.434313  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1701  LysR family transcriptional regulator  44.75 
 
 		 313 aa  265  8e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.672113  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1855  transcriptional regulator  44.75 
 
 		 313 aa  265  8e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0412  LysR family transcriptional regulator  44.75 
 
 		 313 aa  265  8e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0750  LysR family transcriptional regulator  44.75 
 
 		 313 aa  265  8e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.63163  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1469  LysR family transcriptional regulator  44.75 
 
 		 313 aa  265  8e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2780  transcriptional regulator, LysR family  43.92 
 
 		 312 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.916486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2624  transcriptional regulator  44.93 
 
 		 313 aa  264  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0210848  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1581  LysR family transcriptional regulator  44.75 
 
 		 312 aa  261  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.457037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5074  LysR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 332 aa  255  7e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.119711  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0596  LysR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 336 aa  255  9e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1839  LysR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 336 aa  255  9e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0872  LysR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 336 aa  255  9e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1112  LysR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 336 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.358465  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2329  LysR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 354 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1646  LysR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 354 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1025  LysR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 336 aa  249  4e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.951762  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10730  transcriptional regulator, LysR family  43.89 
 
 		 311 aa  244  9.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04020  Transcriptional regulator, LysR family  42.66 
 
 		 323 aa  241  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.010464  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1262  LysR family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 315 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.902208 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4461  LysR family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 315 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3740  LysR family transcriptional regulator  42.12 
 
 		 315 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.163769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4214  LysR family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 315 aa  238  8e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.383155 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0237  putative transcriptional regulator  42.43 
 
 		 355 aa  238  8e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1210  putative transcriptional regulator  42.91 
 
 		 317 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4584  LysR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 315 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.143082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4285  LysR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 315 aa  237  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.300927 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0937  LysR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 322 aa  236  4e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4325  LysR family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 315 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13510  LysR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 317 aa  236  4e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4041  LysR family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 315 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.325017  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1681  LysR family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 315 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0446962  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6200  LysR family transcriptional regulator  43.87 
 
 		 316 aa  235  7e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0503075 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5833  LysR family transcriptional regulator  43.87 
 
 		 316 aa  235  7e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6676  LysR family transcriptional regulator  43.87 
 
 		 316 aa  235  8e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.454387  normal  0.341133 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3196  LysR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 315 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2420  LysR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 334 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0259227 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1113  LysR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 318 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.293194 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0865  LysR family transcriptional regulator  40.53 
 
 		 315 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01980  LysR family transcriptional regulator  43 
 
 		 312 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.445097 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4343  LysR family transcriptional regulator  43.38 
 
 		 327 aa  232  6e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6527  LysR family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 313 aa  232  6e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3964  LysR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 322 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0669221  normal  0.168256 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52930  transcriptional regulator  43 
 
 		 314 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.30988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5836  LysR family transcriptional regulator  43.38 
 
 		 329 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5024  LysR family transcriptional regulator  43.38 
 
 		 329 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.205227  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4426  LysR family transcriptional regulator  39.88 
 
 		 322 aa  230  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.715776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4638  transcriptional regulator  43 
 
 		 314 aa  230  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5996  LysR family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 313 aa  229  4e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178343  normal  0.48899 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3585  LysR family transcriptional regulator  43.34 
 
 		 312 aa  229  4e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0364205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5752  LysR family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 313 aa  229  4e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.515576 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5327  LysR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 317 aa  228  8e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0620404 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1216  transcriptional regulator, LysR family  40.73 
 
 		 315 aa  228  9e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1044  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  40.73 
 
 		 332 aa  227  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.865685  normal  0.351691 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3043  LysR family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 327 aa  227  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.696334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3828  LysR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 322 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.224143  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1142  LysR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 323 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1196  LysR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 323 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.191376  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0435  LysR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 323 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.231747  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1394  LysR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 430 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.52025  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0157  LysR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 323 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.820068  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1404  LysR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 323 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1489  LysR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 323 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0008  transcriptional regulator  41.39 
 
 		 431 aa  225  7e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.636727  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4540  LysR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 322 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29008  normal  0.0118827 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3493  LysR family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 310 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.911238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1305  LysR family transcriptional regulator  40.53 
 
 		 322 aa  223  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.565063 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2278  LysR family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 310 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2317  LysR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 315 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.618902  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5764  LysR family transcriptional regulator  40.53 
 
 		 322 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4120  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 323 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2866  LysR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 310 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.50633 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2435  LysR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 310 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27400  LysR family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 323 aa  215  7e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2804  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 308 aa  209  4e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1894  LysR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 324 aa  209  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6627  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 308 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.974267  normal  0.184966 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2979  transcriptional regulator, LysR family  36.22 
 
 		 306 aa  188  9e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.438714  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0953  transcriptional regulator, LysR family  33 
 
 		 300 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1132  LysR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0177356 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0833  transcriptional regulator, LysR family  33 
 
 		 300 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5787  transcriptional regulator, LysR family  36.36 
 
 		 308 aa  182  7e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3657  LysR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 342 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0145  transcriptional regulator  36.27 
 
 		 351 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0342  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 351 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>