More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0221 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0221  HhH-GPD family protein  100 
 
 
335 aa  651    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230318  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4471  HhH-GPD family protein  59.03 
 
 
296 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2875  HhH-GPD:Iron-sulfur cluster loop  57.65 
 
 
291 aa  293  2e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.738957  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4995  HhH-GPD family protein  56.58 
 
 
291 aa  293  3e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0246379  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3414  HhH-GPD family protein  56.99 
 
 
287 aa  291  1e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35330  A/G-specific DNA glycosylase  56.14 
 
 
293 aa  281  1e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12933  normal  0.479068 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8366  HhH-GPD family protein  55.4 
 
 
310 aa  280  4e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0599  HhH-GPD family protein  57.04 
 
 
307 aa  278  1e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.404846  normal  0.0463679 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3282  HhH-GPD family protein  60.44 
 
 
303 aa  275  8e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.36301  hitchhiker  0.0043845 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9146  A/G-specific DNA glycosylase-like protein  54.39 
 
 
291 aa  275  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0467  HhH-GPD family protein  57.2 
 
 
288 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.31103  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5346  HhH-GPD family protein  54.61 
 
 
290 aa  267  2e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0357  HhH-GPD family protein  56.25 
 
 
303 aa  265  1e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347637  normal  0.0136889 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1102  HhH-GPD family protein  51.44 
 
 
300 aa  262  4.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0563  HhH-GPD family protein  55 
 
 
315 aa  260  2e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00630244 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13622  adenine glycosylase mutY  52.65 
 
 
304 aa  259  7e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.23263e-43  normal  0.044333 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5132  HhH-GPD family protein  53.9 
 
 
288 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4746  HhH-GPD  53.9 
 
 
288 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4274  HhH-GPD family protein  54.84 
 
 
299 aa  257  2e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.162627 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4832  HhH-GPD family protein  53.9 
 
 
288 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.578699 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4708  HhH-GPD family protein  52.69 
 
 
299 aa  253  3e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.109375  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1438  HhH-GPD family protein  53.52 
 
 
291 aa  253  3e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.41653 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0595  HhH-GPD family protein  53.36 
 
 
303 aa  253  4.0000000000000004e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.251234  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0343  HhH-GPD family protein  51.29 
 
 
329 aa  252  5.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0394  HhH-GPD family protein  53.08 
 
 
581 aa  252  7e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0860  HhH-GPD family protein  56.07 
 
 
285 aa  251  9.000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.553101 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01570  A/G-specific adenine glycosylase  51.23 
 
 
313 aa  251  1e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4260  HhH-GPD  54.61 
 
 
320 aa  250  3e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.931254  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0642  HhH-GPD family protein  52.4 
 
 
300 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13060  A/G-specific DNA glycosylase  51.81 
 
 
285 aa  238  9e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0610842  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24580  A/G-specific DNA glycosylase  53.33 
 
 
311 aa  238  1e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0963  HhH-GPD family protein  47.44 
 
 
300 aa  235  9e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.313927  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06850  A/G-specific DNA glycosylase  53.09 
 
 
313 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0490  HhH-GPD family protein  48.94 
 
 
311 aa  233  3e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.270588  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0177  HhH-GPD family protein  49.13 
 
 
347 aa  228  1e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0967  A/G-specific DNA glycosylase  42.32 
 
 
328 aa  227  2e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0341  HhH-GPD family protein  47.73 
 
 
308 aa  219  3e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1171  putative A/G-specific adenine glycosylase  41.38 
 
 
331 aa  216  5e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0418958 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2917  HhH-GPD family protein  43.61 
 
 
317 aa  187  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3189  HhH-GPD family protein  41.94 
 
 
318 aa  186  4e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0320  A/G-specific adenine glycosylase  43.16 
 
 
369 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0480  A/G-specific adenine glycosylase  46.23 
 
 
368 aa  171  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4400  HhH-GPD family protein  43.24 
 
 
323 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0590  A/G-specific adenine glycosylase  44.6 
 
 
353 aa  170  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.123434  decreased coverage  0.000793491 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  44.6 
 
 
375 aa  169  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  45.02 
 
 
368 aa  169  7e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  45.02 
 
 
368 aa  169  7e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  45.02 
 
 
368 aa  169  7e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  44.55 
 
 
368 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  44.55 
 
 
368 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  44.55 
 
 
368 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  44.55 
 
 
368 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04530  A/G-specific adenine glycosylase  45.83 
 
 
362 aa  167  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  45.07 
 
 
368 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2695  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.04 
 
 
361 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.375064 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  45.07 
 
 
368 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  45.07 
 
 
368 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  45.07 
 
 
368 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  44.6 
 
 
370 aa  165  8e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00282  A/G-specific adenine glycosylase  41.4 
 
 
355 aa  165  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.274494  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0401  A/G-specific adenine glycosylase protein  44.86 
 
 
362 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5884  A/G-specific adenine glycosylase  43.52 
 
 
355 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2531  HhH-GPD family protein  41 
 
 
308 aa  161  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0428971  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2876  HhH-GPD family protein  44.89 
 
 
272 aa  162  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0048727  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2945  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.2 
 
 
348 aa  161  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0078  A/G-specific adenine glycosylase  38.37 
 
 
383 aa  160  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.99857  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3407  adenine DNA glycosylase  43.33 
 
 
368 aa  161  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0148197  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4339  A/G-specific adenine glycosylase  43.93 
 
 
353 aa  161  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00948332  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0283  A/G-specific adenine glycosylase  45.29 
 
 
382 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3176  A/G-specific adenine glycosylase  42.23 
 
 
354 aa  160  4e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  39.44 
 
 
363 aa  159  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1092  A/G-specific adenine glycosylase  43.12 
 
 
388 aa  159  7e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  39.66 
 
 
360 aa  158  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0882  adenine DNA glycosylase  41.78 
 
 
368 aa  158  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0320  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.65 
 
 
355 aa  158  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0253407  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0256  A/G-specific adenine glycosylase  45.12 
 
 
382 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1974  A/G-specific adenine glycosylase  35.54 
 
 
339 aa  156  4e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0076  A/G-specific adenine glycosylase  40.65 
 
 
354 aa  156  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.80443  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2715  A/G-specific adenine glycosylase  45.07 
 
 
381 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.197522 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4922  A/G-specific adenine glycosylase  42.59 
 
 
355 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000208141 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0755  A/G-specific adenine glycosylase  40.28 
 
 
350 aa  156  5.0000000000000005e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0037  HhH-GPD family protein  40 
 
 
309 aa  155  8e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2857  A/G-specific adenine glycosylase  45.07 
 
 
368 aa  155  9e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1054  A/G-specific adenine glycosylase  42.92 
 
 
370 aa  154  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0960  hypothetical protein  37.33 
 
 
355 aa  155  1e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4259  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.03 
 
 
355 aa  154  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000489397 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1600  A/G-specific adenine glycosylase  46.95 
 
 
359 aa  155  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.05241 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2490  A/G-specific adenine glycosylase  41.78 
 
 
368 aa  154  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.646812  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0306  A/G-specific adenine glycosylase  41.74 
 
 
355 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0286  A/G-specific adenine glycosylase  41.67 
 
 
355 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160369 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4901  A/G-specific adenine glycosylase MutY  42.51 
 
 
355 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0322  A/G-specific adenine glycosylase  42.52 
 
 
352 aa  154  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000137419  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1325  A/G-specific adenine glycosylase  41.71 
 
 
363 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00655288  hitchhiker  0.00812067 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0930  hypothetical protein  37.05 
 
 
355 aa  153  4e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0748  A/G-specific adenine glycosylase  46.4 
 
 
383 aa  153  4e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247553  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0820  adenine DNA glycosylase  40.74 
 
 
419 aa  152  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.746728  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1607  A/G-specific adenine glycosylase  35.12 
 
 
339 aa  152  5.9999999999999996e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1792  A/G-specific adenine glycosylase  35.12 
 
 
339 aa  152  5.9999999999999996e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0591785  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1123  A/G-specific adenine glycosylase  38.16 
 
 
368 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000383287  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0311  A/G-specific adenine glycosylase  41.67 
 
 
355 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354771  normal  0.798997 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>