66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0631 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0631  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
402 aa  797    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0094  major facilitator transporter  48.38 
 
 
406 aa  388  1e-107  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0031083  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4451  major facilitator superfamily MFS_1  29.85 
 
 
402 aa  74.7  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2349  major facilitator transporter  23.83 
 
 
399 aa  68.6  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3520  major facilitator superfamily MFS_1  30.71 
 
 
434 aa  67.8  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0873  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 
417 aa  67  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1823  major facilitator transporter  23.5 
 
 
464 aa  65.9  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000162964  normal  0.991228 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0910  major facilitator superfamily MFS_1  24.63 
 
 
390 aa  65.1  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.447265  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2156  major facilitator transporter  23.02 
 
 
409 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2558  major facilitator transporter  29.25 
 
 
414 aa  63.5  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.653406  hitchhiker  0.0000197888 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2125  major facilitator superfamily MFS_1  28.47 
 
 
425 aa  63.2  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3544  major facilitator superfamily MFS_1  36.52 
 
 
406 aa  62  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1049  hypothetical protein  33.65 
 
 
428 aa  61.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0105777 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0307  major facilitator superfamily MFS_1  22.46 
 
 
414 aa  60.8  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2162  hypothetical protein  23.75 
 
 
393 aa  60.1  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000725543  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0693  major facilitator transporter  27.12 
 
 
409 aa  58.2  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1568  major facilitator transporter  27.12 
 
 
409 aa  58.2  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0249  major facilitator transporter  22.45 
 
 
399 aa  56.6  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.621086  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0062  hypothetical protein  22.14 
 
 
440 aa  56.2  0.0000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07030  arabinose efflux permease family protein  30.09 
 
 
416 aa  55.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0185  hypothetical protein  28.87 
 
 
406 aa  54.7  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0235  major facilitator superfamily MFS_1  26.87 
 
 
424 aa  54.3  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  24.87 
 
 
424 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1814  major facilitator transporter  21.68 
 
 
456 aa  53.5  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.347664  hitchhiker  0.0000156838 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3395  major facilitator superfamily MFS_1  22.82 
 
 
408 aa  53.5  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  22.77 
 
 
424 aa  53.1  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2006  major facilitator transporter  32.65 
 
 
419 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  24.43 
 
 
423 aa  50.1  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  24.43 
 
 
423 aa  50.1  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  25 
 
 
423 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  24.43 
 
 
423 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  24.43 
 
 
423 aa  50.1  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4917  major facilitator transporter  25 
 
 
419 aa  50.1  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1765  major facilitator transporter  27.63 
 
 
376 aa  49.7  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1059  major facilitator superfamily MFS_1  30.71 
 
 
420 aa  49.7  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  25 
 
 
423 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  23.53 
 
 
424 aa  49.3  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  27.04 
 
 
423 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  26.53 
 
 
423 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0556  major facilitator transporter  25.85 
 
 
414 aa  48.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.968297  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2907  major facilitator superfamily MFS_1  25.44 
 
 
411 aa  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  24.38 
 
 
423 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1284  putative 3-phenylpropionic acid transporter  21.9 
 
 
399 aa  47  0.0005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0225  major facilitator transporter  22.16 
 
 
402 aa  47.4  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  5.3522099999999996e-21 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002202  probable 3-phenylpropionic acid transporter  25.55 
 
 
395 aa  47  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1915  major facilitator superfamily permease  23.2 
 
 
389 aa  47  0.0006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.488655  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3320  major facilitator superfamily MFS_1  22.69 
 
 
453 aa  47  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.290278  normal  0.330714 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  25.9 
 
 
423 aa  46.6  0.0008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1442  major facilitator superfamily MFS_1  21.53 
 
 
437 aa  46.2  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  23.08 
 
 
424 aa  46.2  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2155  hypothetical protein  37.74 
 
 
410 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.747203  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  23.81 
 
 
429 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1999  major facilitator family transporter  37.74 
 
 
410 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0838123  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2019  major facilitator family transporter  37.74 
 
 
410 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0263  major facilitator superfamily MFS_1  24.41 
 
 
367 aa  45.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.680002  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2694  putative 3-phenylpropionic acid transporter  24 
 
 
396 aa  44.7  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0321  major facilitator transporter  33.33 
 
 
402 aa  44.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  23.62 
 
 
408 aa  44.7  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3004  major facilitator transporter  22.48 
 
 
423 aa  44.3  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1139  major facilitator transporter  23.95 
 
 
395 aa  44.3  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000165449  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1571  major facilitator transporter  28.78 
 
 
407 aa  44.3  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1343  putative transport protein  27.4 
 
 
374 aa  43.9  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  22.31 
 
 
470 aa  43.9  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2632  major facilitator transporter  26.55 
 
 
402 aa  43.9  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6190  major facilitator transporter  20.12 
 
 
398 aa  43.5  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2646  galactoside permease  23.68 
 
 
415 aa  43.5  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>