More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aazo_4580 on replicon NC_014248
Organism: 'Nostoc azollae' 0708



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_4580  ribonuclease III  100 
 
 
227 aa  466  9.999999999999999e-131  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3081  ribonuclease III  80.3 
 
 
228 aa  339  2.9999999999999998e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.569411  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2144  RNAse III  50.43 
 
 
233 aa  212  3.9999999999999995e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3959  Ribonuclease III  51.1 
 
 
228 aa  206  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3303  Ribonuclease III  47.37 
 
 
225 aa  201  9e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2813  ribonuclease III  47.37 
 
 
225 aa  201  9e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  0.303497 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  44.34 
 
 
235 aa  167  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  42.15 
 
 
259 aa  159  5e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  40.45 
 
 
246 aa  158  6e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  42.47 
 
 
246 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  42.73 
 
 
246 aa  155  6e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  40.72 
 
 
246 aa  154  8e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  38.53 
 
 
240 aa  150  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0380  ribonuclease III  39.09 
 
 
234 aa  150  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.492905  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1295  ribonuclease III  43.42 
 
 
245 aa  148  6e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0290325  hitchhiker  3.99354e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3948  ribonuclease III  43.42 
 
 
245 aa  148  6e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.399561  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  39.45 
 
 
232 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0946  Ribonuclease III  40.18 
 
 
238 aa  146  3e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.652577  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3672  ribonuclease III  42.54 
 
 
245 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.405617  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3700  ribonuclease III  42.98 
 
 
245 aa  145  5e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3590  ribonuclease III  42.98 
 
 
245 aa  145  5e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3987  ribonuclease III  42.98 
 
 
245 aa  145  5e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.484862  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3863  ribonuclease III  42.98 
 
 
245 aa  145  5e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2755e-51 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  42.27 
 
 
230 aa  145  5e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3891  ribonuclease III  42.98 
 
 
245 aa  145  6e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3897  ribonuclease III  42.98 
 
 
245 aa  145  6e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000342133  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3608  ribonuclease III  42.98 
 
 
245 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2501  ribonuclease III  42.54 
 
 
245 aa  144  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00121317  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  39.44 
 
 
235 aa  143  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1347  ribonuclease III  42.23 
 
 
241 aa  142  6e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.461222  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0908  ribonuclease III  38.99 
 
 
248 aa  141  7e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640181  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1025  ribonuclease III  39.91 
 
 
237 aa  141  8e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00427221  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3203  ribonuclease III  41.63 
 
 
232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000725651  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_897  ribonuclease III  38.53 
 
 
248 aa  139  3e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000334707  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1272  ribonuclease III  38.57 
 
 
229 aa  139  3e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.812547  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0799  ribonuclease III  39.56 
 
 
245 aa  138  7.999999999999999e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.807465  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1159  ribonuclease III  36.4 
 
 
233 aa  137  1e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000332232  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1060  ribonuclease III  42.53 
 
 
232 aa  137  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2378e-17 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  40.29 
 
 
240 aa  137  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  39.37 
 
 
236 aa  137  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  37.9 
 
 
236 aa  136  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4602  ribonuclease III  40 
 
 
237 aa  136  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1292  ribonuclease III  38.64 
 
 
243 aa  135  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1317  ribonuclease III  38.64 
 
 
243 aa  135  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2039  ribonuclease III  38.64 
 
 
225 aa  135  5e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.875758  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11290  RNAse III  38.14 
 
 
234 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3813  Ribonuclease III  39.23 
 
 
262 aa  134  9e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119761  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0723  ribonuclease III  37.1 
 
 
236 aa  133  1.9999999999999998e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  37.9 
 
 
242 aa  133  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1945  Ribonuclease III  37.1 
 
 
228 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210553  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1027  ribonuclease III  35.94 
 
 
246 aa  132  3.9999999999999996e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000153417  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002497  ribonuclease III  38.36 
 
 
225 aa  132  3.9999999999999996e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.186598  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1388  ribonuclease III  37.05 
 
 
243 aa  132  5e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.625723  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1639  ribonuclease III  38.71 
 
 
228 aa  132  6e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277384  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03536  ribonuclease III  37.9 
 
 
225 aa  131  9e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1400  ribonuclease III  38.18 
 
 
226 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2024  ribonuclease III  38.99 
 
 
226 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1121  Ribonuclease III  38.18 
 
 
226 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2029  ribonuclease III  36.41 
 
 
222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0184754  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2525  ribonuclease III  37.79 
 
 
223 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0485221  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3545  ribonuclease III  38.05 
 
 
282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895887  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2243  RNAse III  36.07 
 
 
226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00670311 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1433  ribonuclease III  38.36 
 
 
229 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00353608  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02998  ribonuclease III  38.36 
 
 
228 aa  129  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4288  ribonuclease III  38.36 
 
 
229 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  37.79 
 
 
221 aa  129  3e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4374  ribonuclease III  37.9 
 
 
229 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1807  ribonuclease III  35.94 
 
 
224 aa  126  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2990  ribonuclease III  36.53 
 
 
250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.535803  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  38.89 
 
 
233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  36.49 
 
 
245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1626  ribonuclease III  35.94 
 
 
225 aa  126  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.140221  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0570  ribonuclease III  35.35 
 
 
232 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0862  ribonuclease III  38.25 
 
 
231 aa  125  4.0000000000000003e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2429  ribonuclease III  37.56 
 
 
242 aa  125  5e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2847  ribonuclease III  37.89 
 
 
245 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0152776  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2661  ribonuclease III  38.1 
 
 
260 aa  125  5e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2743  ribonuclease III  37.89 
 
 
245 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00278248  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2959  ribonuclease III  37.89 
 
 
245 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0879861  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2824  ribonuclease III  37.89 
 
 
245 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2784  ribonuclease III  37.89 
 
 
245 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1995  ribonuclease III  35.48 
 
 
225 aa  125  5e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4122  ribonuclease III  38.6 
 
 
266 aa  125  7e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2293  ribonuclease III  37.09 
 
 
240 aa  125  7e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.051216  hitchhiker  0.000715248 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1714  ribonuclease III  38.01 
 
 
240 aa  124  8.000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1609  ribonuclease III  37.74 
 
 
252 aa  125  8.000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.425776  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1666  ribonuclease III  38.05 
 
 
241 aa  125  8.000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.397284  normal  0.0114969 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  38.76 
 
 
236 aa  125  8.000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0640  ribonuclease III  36.41 
 
 
228 aa  124  8.000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.394276  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4217  ribonuclease III  36.67 
 
 
229 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.186649  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1708  ribonuclease III  37.9 
 
 
229 aa  124  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0152797  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01717  ribonuclease III  35.45 
 
 
226 aa  124  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.622323  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13780  ribonuclease III  37.32 
 
 
229 aa  124  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1073  ribonuclease III  37.62 
 
 
229 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1037  ribonuclease III  35.94 
 
 
225 aa  124  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00165891  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3951  ribonuclease III  36.67 
 
 
229 aa  123  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1054  ribonuclease III  36.41 
 
 
225 aa  123  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0953416  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0920  ribonuclease III  37.74 
 
 
234 aa  123  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1631  ribonuclease III  37.5 
 
 
226 aa  123  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00732498  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1240  ribonuclease III  37.79 
 
 
227 aa  124  2e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>