More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3210 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3210  adenylosuccinate lyase  100 
 
 		 452 aa  926    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.127423  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0280  adenylosuccinate lyase  47.07 
 
 		 454 aa  415  1e-114  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3997  adenylosuccinate lyase  45.72 
 
 		 454 aa  405  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00709346  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4188  adenylosuccinate lyase  45.72 
 
 		 454 aa  402  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0215  adenylosuccinate lyase  45.05 
 
 		 454 aa  401  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.314002  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0170  adenylosuccinate lyase  45.27 
 
 		 454 aa  394  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00265741  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0005  adenylosuccinate lyase  46.26 
 
 		 454 aa  387  1e-106  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1393  adenylosuccinate lyase  45.86 
 
 		 455 aa  383  1e-105  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00268576  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1582  adenylosuccinate lyase  46.09 
 
 		 455 aa  382  1e-105  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21250  adenylosuccinate lyase  43.65 
 
 		 452 aa  371  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0991556  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18830  adenylosuccinate lyase  44.14 
 
 		 477 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0801563 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1630  adenylosuccinate lyase  43.92 
 
 		 477 aa  365  1e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4374  adenylosuccinate lyase  39.25 
 
 		 451 aa  351  1e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.25048e-22 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4837  fumarate lyase  44.24 
 
 		 450 aa  342  1e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.616525  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1483  fumarate lyase  41.03 
 
 		 450 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.151746  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4598  fumarate lyase  42.09 
 
 		 458 aa  334  2e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.604906  normal  0.691601 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0014  fumarate lyase  41.29 
 
 		 450 aa  333  3e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000353189  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3811  fumarate lyase  39.33 
 
 		 449 aa  330  2e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.647921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4818  fumarate lyase  43.4 
 
 		 451 aa  330  4e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.327057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2418  fumarate lyase  38.65 
 
 		 448 aa  327  3e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.259458 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04011  conserved hypothetical protein  39.33 
 
 		 476 aa  327  4.0000000000000003e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.981247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1439  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  40.23 
 
 		 460 aa  325  9e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535279 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4557  fumarate lyase  38.67 
 
 		 449 aa  325  1e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0757  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  41.99 
 
 		 457 aa  323  4e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.3705  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3487  fumarate lyase  37.42 
 
 		 450 aa  311  2e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3622  fumarate lyase  37.53 
 
 		 456 aa  310  4e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0741551  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2958  adenylosuccinate lyase  40.18 
 
 		 471 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121926  hitchhiker  0.00625137 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1072  adenylosuccinate lyase  39.91 
 
 		 455 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5054  fumarate lyase  37.99 
 
 		 456 aa  300  3e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0605282  normal  0.269052 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4409  fumarate lyase  37.08 
 
 		 446 aa  296  7e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1631  adenylosuccinate lyase  37.74 
 
 		 483 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2745  fumarate lyase  36.4 
 
 		 473 aa  289  5.0000000000000004e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.632463  normal  0.0578708 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18850  adenylosuccinate lyase  37.5 
 
 		 483 aa  288  9e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.110706 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1906  putative lyase  35.35 
 
 		 445 aa  286  4e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1701  adenylosuccinate lyase  38.18 
 
 		 445 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.259986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4874  fumarate lyase  38.71 
 
 		 456 aa  285  2.0000000000000002e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0760075  normal  0.0695852 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2341  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  37.59 
 
 		 453 aa  280  4e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1160  adenylosuccinate lyase  35.19 
 
 		 446 aa  279  8e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0824  adenylosuccinate lyase  36.26 
 
 		 446 aa  277  4e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.116488 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0781  adenylosuccinate lyase  37.53 
 
 		 446 aa  273  6e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0994774  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2125  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  36.85 
 
 		 453 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.398562 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0673  adenylosuccinate lyase  35.43 
 
 		 448 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5067  fumarate lyase  39.1 
 
 		 446 aa  267  2.9999999999999995e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.185188  normal  0.273207 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0794  adenylosuccinate lyase  34.62 
 
 		 449 aa  261  1e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.652976  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1121  adenylosuccinate lyase  35.55 
 
 		 447 aa  261  2e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0645  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  38.46 
 
 		 459 aa  261  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0741414 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0986  adenylosuccinate lyase  34.02 
 
 		 448 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00836427  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4928  adenylosuccinate lyase  37 
 
 		 433 aa  254  3e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000014766  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1162  adenylosuccinate lyase  34.62 
 
 		 446 aa  251  1e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0307  adenylosuccinate lyase  37.17 
 
 		 430 aa  249  5e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.141521  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1019  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  36.32 
 
 		 450 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531997 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1273  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  36.53 
 
 		 454 aa  246  6e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.281218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0095  adenylosuccinate lyase  37.67 
 
 		 436 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38190  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  37.79 
 
 		 450 aa  245  9.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569484  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1684  adenylosuccinate lyase  34.85 
 
 		 449 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.29073  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4015  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  37.41 
 
 		 490 aa  245  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0773124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0294  adenylosuccinate lyase  34.62 
 
 		 449 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.437352  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0393  adenylosuccinate lyase  35.35 
 
 		 430 aa  244  3e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.623936  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5023  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  37.21 
 
 		 462 aa  243  5e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.261629  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4314  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  37.33 
 
 		 459 aa  243  6e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.417348  normal  0.728676 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0216  adenylosuccinate lyase  34.62 
 
 		 449 aa  241  1e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.595584 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1118  adenylosuccinate lyase  36.9 
 
 		 446 aa  242  1e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.984181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1218  adenylosuccinate lyase  35.25 
 
 		 445 aa  242  1e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4344  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  35.4 
 
 		 450 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.339693  normal  0.0393048 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5286  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  39.22 
 
 		 451 aa  241  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.335784  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1379  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  35.4 
 
 		 450 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.449914  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2746  fumarate lyase  37.77 
 
 		 461 aa  241  2.9999999999999997e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.382939  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1446  adenylosuccinate lyase  33.96 
 
 		 431 aa  239  8e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.149725  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1963  adenylosuccinate lyase  33.87 
 
 		 431 aa  238  1e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.739677  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1555  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  38.04 
 
 		 452 aa  239  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1997  adenylosuccinate lyase  33.87 
 
 		 431 aa  238  1e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.035377  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0056  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  38.04 
 
 		 452 aa  239  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0457569  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1536  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  35 
 
 		 438 aa  238  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0157227  normal  0.182398 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0058  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  37.81 
 
 		 452 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.593603  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0048  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  37.81 
 
 		 452 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3127  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  36.78 
 
 		 457 aa  238  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1485  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  37.81 
 
 		 452 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1202  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  37.81 
 
 		 452 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0069  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  37.81 
 
 		 452 aa  237  3e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.675451  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1943  adenylosuccinate lyase  34.34 
 
 		 431 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4459  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  35.63 
 
 		 476 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.484308 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1011  adenylosuccinate lyase  34.99 
 
 		 431 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0255  adenylosuccinate lyase  34.66 
 
 		 431 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00422824  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3160  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  36.67 
 
 		 457 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0379  adenylosuccinate lyase  33.25 
 
 		 430 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2064  adenylosuccinate lyase  33.41 
 
 		 431 aa  233  5e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1455  adenylosuccinate lyase  31.71 
 
 		 453 aa  233  6e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3743  adenylosuccinate lyase  34.8 
 
 		 422 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.391342 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3530  adenylosuccinate lyase  34.45 
 
 		 431 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1779  adenylosuccinate lyase  33.26 
 
 		 434 aa  231  2e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00299045  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2587  adenylosuccinate lyase  34.45 
 
 		 431 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0455  Adenylosuccinate lyase  33.64 
 
 		 430 aa  231  2e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.547071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1446  adenylosuccinate lyase  34.26 
 
 		 433 aa  229  9e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000278594  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2356  adenylosuccinate lyase  36.13 
 
 		 435 aa  227  4e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2333  adenylosuccinate lyase  34.34 
 
 		 431 aa  227  4e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.943471  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1131  adenylosuccinate lyase  33.96 
 
 		 431 aa  227  4e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1990  adenylosuccinate lyase  36.13 
 
 		 435 aa  227  4e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.246521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4984  adenylosuccinate lyase  32.94 
 
 		 435 aa  226  6e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2370  adenylosuccinate lyase  33.97 
 
 		 430 aa  226  6e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5748  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  36.78 
 
 		 452 aa  226  7e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.955684  normal  0.122503 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>