More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCG9842_B4374 on replicon NC_011772
Organism: Bacillus cereus G9842



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B4374  adenylosuccinate lyase  100 
 
 
451 aa  934    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  6.25048e-22 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21250  adenylosuccinate lyase  41.93 
 
 
452 aa  397  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0991556  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0757  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  42.18 
 
 
457 aa  359  4e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.3705  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4598  fumarate lyase  40.36 
 
 
458 aa  359  5e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.604906  normal  0.691601 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1483  fumarate lyase  41.48 
 
 
450 aa  354  2e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.151746  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0215  adenylosuccinate lyase  39.5 
 
 
454 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.314002  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3210  adenylosuccinate lyase  39.25 
 
 
452 aa  349  6e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.127423  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0170  adenylosuccinate lyase  38.37 
 
 
454 aa  348  8e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00265741  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0014  fumarate lyase  41.31 
 
 
450 aa  346  4e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000353189  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1439  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  39.77 
 
 
460 aa  343  2.9999999999999997e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.535279 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4188  adenylosuccinate lyase  39.5 
 
 
454 aa  341  1e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3997  adenylosuccinate lyase  39.28 
 
 
454 aa  340  2e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00709346  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3811  fumarate lyase  38.83 
 
 
449 aa  338  9.999999999999999e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.647921  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04011  conserved hypothetical protein  38.01 
 
 
476 aa  337  1.9999999999999998e-91  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.981247  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18830  adenylosuccinate lyase  40.04 
 
 
477 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0801563 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2418  fumarate lyase  37.44 
 
 
448 aa  334  2e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.259458 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1072  adenylosuccinate lyase  40.95 
 
 
455 aa  334  2e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4557  fumarate lyase  38.37 
 
 
449 aa  332  6e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3487  fumarate lyase  38.83 
 
 
450 aa  332  1e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1630  adenylosuccinate lyase  38.7 
 
 
477 aa  331  2e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0280  adenylosuccinate lyase  41.74 
 
 
454 aa  326  5e-88  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4837  fumarate lyase  37.47 
 
 
450 aa  323  5e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.616525  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4818  fumarate lyase  37.47 
 
 
451 aa  317  2e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.327057  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1582  adenylosuccinate lyase  41.99 
 
 
455 aa  317  3e-85  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1393  adenylosuccinate lyase  42.44 
 
 
455 aa  317  3e-85  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00268576  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0005  adenylosuccinate lyase  41.07 
 
 
454 aa  315  9.999999999999999e-85  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4409  fumarate lyase  37 
 
 
446 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2745  fumarate lyase  36.79 
 
 
473 aa  313  3.9999999999999997e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.632463  normal  0.0578708 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3622  fumarate lyase  38.18 
 
 
456 aa  312  6.999999999999999e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0741551  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0986  adenylosuccinate lyase  37.19 
 
 
448 aa  296  4e-79  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00836427  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1273  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  37.53 
 
 
454 aa  296  4e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.281218  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2125  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  35.32 
 
 
453 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.398562 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1631  adenylosuccinate lyase  34.3 
 
 
483 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2341  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  34.32 
 
 
453 aa  290  3e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1906  putative lyase  33.79 
 
 
445 aa  289  7e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0794  adenylosuccinate lyase  37.3 
 
 
449 aa  288  2e-76  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.652976  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18850  adenylosuccinate lyase  34.3 
 
 
483 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.110706 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5023  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  36.64 
 
 
462 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.261629  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4015  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  37.47 
 
 
490 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0773124  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2958  adenylosuccinate lyase  33.71 
 
 
471 aa  283  4.0000000000000003e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121926  hitchhiker  0.00625137 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0824  adenylosuccinate lyase  37.9 
 
 
446 aa  282  8.000000000000001e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.116488 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0781  adenylosuccinate lyase  35.71 
 
 
446 aa  279  8e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0994774  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1379  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  35.76 
 
 
450 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.449914  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38190  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  35.39 
 
 
450 aa  278  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569484  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2456  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  35.51 
 
 
453 aa  278  2e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.786558  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4344  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  35.76 
 
 
450 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.339693  normal  0.0393048 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1160  adenylosuccinate lyase  36.78 
 
 
446 aa  276  6e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1684  adenylosuccinate lyase  37.53 
 
 
449 aa  275  9e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.29073  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0645  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  36.6 
 
 
459 aa  275  9e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0741414 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0216  adenylosuccinate lyase  37.53 
 
 
449 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.595584 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1019  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  35.43 
 
 
450 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00531997 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3127  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  37.41 
 
 
457 aa  273  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1701  adenylosuccinate lyase  36.09 
 
 
445 aa  273  3e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.259986  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4459  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  37.82 
 
 
476 aa  273  7e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.484308 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5054  fumarate lyase  32.51 
 
 
456 aa  271  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0605282  normal  0.269052 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1121  adenylosuccinate lyase  36 
 
 
447 aa  270  5e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0069  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  37.1 
 
 
452 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.675451  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0048  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  37.1 
 
 
452 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1202  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  37.1 
 
 
452 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1485  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  37.1 
 
 
452 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1536  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  36.04 
 
 
438 aa  268  1e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0157227  normal  0.182398 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0058  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  37.1 
 
 
452 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.593603  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0056  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  37.1 
 
 
452 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0457569  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4314  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  37.06 
 
 
459 aa  268  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.417348  normal  0.728676 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1555  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  37.1 
 
 
452 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0393  adenylosuccinate lyase  35.54 
 
 
430 aa  266  4e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.623936  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3160  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  37.41 
 
 
457 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0294  adenylosuccinate lyase  37.56 
 
 
449 aa  265  1e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.437352  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0673  adenylosuccinate lyase  36.04 
 
 
448 aa  264  2e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1218  adenylosuccinate lyase  37.09 
 
 
445 aa  264  2e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2251  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  34.16 
 
 
453 aa  263  4.999999999999999e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.001838  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2695  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  34.75 
 
 
453 aa  262  1e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0450627  normal  0.5058 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5019  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  37.41 
 
 
460 aa  262  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4435  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  35.54 
 
 
450 aa  260  4e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.115184  normal  0.0129696 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5748  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  36.95 
 
 
452 aa  260  4e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.955684  normal  0.122503 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2063  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  34.61 
 
 
453 aa  259  6e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.146832  normal  0.884924 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5286  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  39.6 
 
 
451 aa  259  8e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.335784  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0759  adenylosuccinate lyase  34.63 
 
 
451 aa  256  4e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0048  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  36.64 
 
 
465 aa  256  5e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02830  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  35.73 
 
 
459 aa  256  7e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00289129 
 
 
-
 
NC_002936  DET0840  adenylosuccinate lyase  34.55 
 
 
451 aa  256  8e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_744  adenylosuccinate lyase  34.17 
 
 
451 aa  256  8e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2505  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  34.92 
 
 
452 aa  255  1.0000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0316  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  36.4 
 
 
459 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4475  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  37.18 
 
 
452 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4874  fumarate lyase  32.74 
 
 
456 aa  254  3e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0760075  normal  0.0695852 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5111  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  37 
 
 
406 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1118  adenylosuccinate lyase  36.78 
 
 
446 aa  249  9e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.984181  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0336  adenylosuccinate lyase  34.63 
 
 
435 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1455  adenylosuccinate lyase  32.13 
 
 
453 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0271  adenylosuccinate lyase  34.32 
 
 
435 aa  246  6e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4984  adenylosuccinate lyase  34.63 
 
 
435 aa  246  6e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1217  adenylosuccinate lyase  35.35 
 
 
457 aa  245  9.999999999999999e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0739358  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0363  adenylosuccinate lyase  34.63 
 
 
435 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0319  adenylosuccinate lyase  34.63 
 
 
435 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0277  adenylosuccinate lyase  34.4 
 
 
435 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351809  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0262  adenylosuccinate lyase  34.4 
 
 
435 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0290  adenylosuccinate lyase  34.4 
 
 
435 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0322  adenylosuccinate lyase  34.4 
 
 
435 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0265  adenylosuccinate lyase  34.4 
 
 
435 aa  244  3e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0631795  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>