More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_18830 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1630  adenylosuccinate lyase  87.84 
 
 		 477 aa  849    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18830  adenylosuccinate lyase  100 
 
 		 477 aa  958    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0801563 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0170  adenylosuccinate lyase  44.59 
 
 		 454 aa  390  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00265741  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0215  adenylosuccinate lyase  43.69 
 
 		 454 aa  388  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.314002  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3997  adenylosuccinate lyase  42.79 
 
 		 454 aa  379  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00709346  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4188  adenylosuccinate lyase  42.79 
 
 		 454 aa  377  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0280  adenylosuccinate lyase  43.4 
 
 		 454 aa  372  1e-102  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21250  adenylosuccinate lyase  44.94 
 
 		 452 aa  362  1e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0991556  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3210  adenylosuccinate lyase  44.14 
 
 		 452 aa  359  7e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.127423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1393  adenylosuccinate lyase  42.19 
 
 		 455 aa  357  2.9999999999999997e-97  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00268576  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1582  adenylosuccinate lyase  42.19 
 
 		 455 aa  356  5e-97  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0005  adenylosuccinate lyase  42.54 
 
 		 454 aa  351  2e-95  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1631  adenylosuccinate lyase  43.37 
 
 		 483 aa  348  1e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18850  adenylosuccinate lyase  42.92 
 
 		 483 aa  341  1e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.110706 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4374  adenylosuccinate lyase  40.04 
 
 		 451 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.25048e-22 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1483  fumarate lyase  38.26 
 
 		 450 aa  324  3e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.151746  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3811  fumarate lyase  38.96 
 
 		 449 aa  322  8e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.647921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4598  fumarate lyase  40.72 
 
 		 458 aa  320  3.9999999999999996e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.604906  normal  0.691601 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1439  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  41.36 
 
 		 460 aa  319  7.999999999999999e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535279 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4557  fumarate lyase  38.29 
 
 		 449 aa  317  3e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0757  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  41.7 
 
 		 457 aa  315  9e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.3705  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3487  fumarate lyase  37.39 
 
 		 450 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0014  fumarate lyase  38.72 
 
 		 450 aa  310  5e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000353189  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2418  fumarate lyase  38.88 
 
 		 448 aa  309  8e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.259458 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4837  fumarate lyase  41.89 
 
 		 450 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.616525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2958  adenylosuccinate lyase  42.6 
 
 		 471 aa  306  5.0000000000000004e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121926  hitchhiker  0.00625137 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5054  fumarate lyase  39.69 
 
 		 456 aa  302  7.000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0605282  normal  0.269052 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1072  adenylosuccinate lyase  40.48 
 
 		 455 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4818  fumarate lyase  40.67 
 
 		 451 aa  300  4e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.327057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3622  fumarate lyase  39.46 
 
 		 456 aa  291  2e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0741551  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4874  fumarate lyase  40.44 
 
 		 456 aa  285  9e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0760075  normal  0.0695852 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5067  fumarate lyase  42.27 
 
 		 446 aa  285  9e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.185188  normal  0.273207 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4409  fumarate lyase  37.16 
 
 		 446 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0794  adenylosuccinate lyase  36.67 
 
 		 449 aa  279  6e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.652976  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1906  putative lyase  35.52 
 
 		 445 aa  279  9e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2745  fumarate lyase  36.04 
 
 		 473 aa  278  1e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.632463  normal  0.0578708 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04011  conserved hypothetical protein  35.23 
 
 		 476 aa  269  8e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.981247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0986  adenylosuccinate lyase  35.08 
 
 		 448 aa  265  2e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00836427  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0216  adenylosuccinate lyase  36.67 
 
 		 449 aa  263  4e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.595584 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5023  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  37.47 
 
 		 462 aa  261  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.261629  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0824  adenylosuccinate lyase  35.97 
 
 		 446 aa  259  6e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.116488 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4015  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  38.53 
 
 		 490 aa  259  7e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0773124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1684  adenylosuccinate lyase  36.45 
 
 		 449 aa  259  8e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.29073  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2505  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  40.05 
 
 		 452 aa  257  4e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4344  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  38.17 
 
 		 450 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.339693  normal  0.0393048 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1379  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  38.17 
 
 		 450 aa  256  7e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.449914  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2125  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  36.7 
 
 		 453 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.398562 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0673  adenylosuccinate lyase  36.49 
 
 		 448 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1019  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  37.94 
 
 		 450 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531997 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2341  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  36.12 
 
 		 453 aa  254  3e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1160  adenylosuccinate lyase  35.7 
 
 		 446 aa  254  3e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2456  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  40.14 
 
 		 453 aa  252  1e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.786558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4314  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  38.01 
 
 		 459 aa  250  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.417348  normal  0.728676 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0294  adenylosuccinate lyase  36.49 
 
 		 449 aa  249  6e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.437352  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0645  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  37.78 
 
 		 459 aa  249  9e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0741414 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3127  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  38.64 
 
 		 457 aa  248  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0056  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  39.86 
 
 		 452 aa  247  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0457569  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1555  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  39.63 
 
 		 452 aa  247  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1121  adenylosuccinate lyase  36.66 
 
 		 447 aa  247  4e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3160  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  38.88 
 
 		 457 aa  246  6e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1485  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  39.63 
 
 		 452 aa  246  8e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0048  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  39.63 
 
 		 452 aa  246  8e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1202  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  39.63 
 
 		 452 aa  246  8e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0058  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  39.63 
 
 		 452 aa  246  8e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.593603  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0393  adenylosuccinate lyase  36.6 
 
 		 430 aa  245  9.999999999999999e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.623936  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0069  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  39.63 
 
 		 452 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.675451  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4459  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  37.33 
 
 		 476 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.484308 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2251  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  39.68 
 
 		 453 aa  242  9e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.001838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5019  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  38.88 
 
 		 460 aa  242  9e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0048  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  39.39 
 
 		 465 aa  241  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4435  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  37.94 
 
 		 450 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.115184  normal  0.0129696 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5748  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  38.88 
 
 		 452 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.955684  normal  0.122503 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0781  adenylosuccinate lyase  37.13 
 
 		 446 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0994774  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5286  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  38.88 
 
 		 451 aa  239  8e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.335784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1273  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  36.6 
 
 		 454 aa  239  8e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.281218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1701  adenylosuccinate lyase  36.32 
 
 		 445 aa  239  1e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.259986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1218  adenylosuccinate lyase  38.27 
 
 		 445 aa  238  1e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38190  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  37.93 
 
 		 450 aa  236  6e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569484  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1162  adenylosuccinate lyase  33.71 
 
 		 446 aa  236  6e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2695  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  38.75 
 
 		 453 aa  236  9e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0450627  normal  0.5058 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2063  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  40.5 
 
 		 453 aa  236  9e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.146832  normal  0.884924 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4475  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  38.88 
 
 		 452 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1536  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  33.71 
 
 		 438 aa  227  3e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0157227  normal  0.182398 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5111  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  38.4 
 
 		 406 aa  227  4e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02908  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  35.23 
 
 		 450 aa  227  5.0000000000000005e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0307  adenylosuccinate lyase  35.97 
 
 		 430 aa  226  1e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.141521  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2151  adenylosuccinate lyase  35.65 
 
 		 431 aa  225  2e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2052  adenylosuccinate lyase  34.77 
 
 		 431 aa  223  4e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0154529  normal  0.110523 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23110  adenylosuccinate lyase  31.75 
 
 		 431 aa  222  9.999999999999999e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1446  adenylosuccinate lyase  32.78 
 
 		 431 aa  217  4e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.149725  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7931  3-carboxy-cis,cis-muconate cyclo-isomerase  36.51 
 
 		 452 aa  217  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46399  normal  0.48372 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2370  adenylosuccinate lyase  34.29 
 
 		 430 aa  217  5e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0729  adenylosuccinate lyase  33.33 
 
 		 430 aa  216  8e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1446  adenylosuccinate lyase  31.37 
 
 		 433 aa  216  8e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000278594  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0095  adenylosuccinate lyase  35.46 
 
 		 436 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1131  adenylosuccinate lyase  33.81 
 
 		 431 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0255  adenylosuccinate lyase  33.73 
 
 		 431 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00422824  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1943  adenylosuccinate lyase  33.33 
 
 		 431 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1997  adenylosuccinate lyase  32.78 
 
 		 431 aa  213  7.999999999999999e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.035377  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1963  adenylosuccinate lyase  32.78 
 
 		 431 aa  213  7.999999999999999e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.739677  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>