More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_18850 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1631  adenylosuccinate lyase  92.13 
 
 		 483 aa  914    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18850  adenylosuccinate lyase  100 
 
 		 483 aa  985    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.110706 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2958  adenylosuccinate lyase  49.78 
 
 		 471 aa  423  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121926  hitchhiker  0.00625137 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18830  adenylosuccinate lyase  42.92 
 
 		 477 aa  341  2e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0801563 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1630  adenylosuccinate lyase  41.57 
 
 		 477 aa  326  6e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21250  adenylosuccinate lyase  40.82 
 
 		 452 aa  325  1e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0991556  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4188  adenylosuccinate lyase  36.12 
 
 		 454 aa  295  9e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0170  adenylosuccinate lyase  36.34 
 
 		 454 aa  293  4e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00265741  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3997  adenylosuccinate lyase  35.67 
 
 		 454 aa  293  4e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00709346  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0215  adenylosuccinate lyase  35.67 
 
 		 454 aa  290  3e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.314002  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4837  fumarate lyase  38.15 
 
 		 450 aa  283  7.000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.616525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3210  adenylosuccinate lyase  37.5 
 
 		 452 aa  276  5e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.127423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4374  adenylosuccinate lyase  34.3 
 
 		 451 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.25048e-22 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0280  adenylosuccinate lyase  34.38 
 
 		 454 aa  258  2e-67  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1483  fumarate lyase  34.3 
 
 		 450 aa  257  3e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.151746  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0794  adenylosuccinate lyase  34.25 
 
 		 449 aa  256  6e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.652976  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4818  fumarate lyase  35.75 
 
 		 451 aa  256  8e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.327057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4598  fumarate lyase  34.3 
 
 		 458 aa  251  3e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.604906  normal  0.691601 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1582  adenylosuccinate lyase  34.83 
 
 		 455 aa  249  7e-65  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1393  adenylosuccinate lyase  34.61 
 
 		 455 aa  248  1e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00268576  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4409  fumarate lyase  32.81 
 
 		 446 aa  246  6e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1439  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  35.27 
 
 		 460 aa  245  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535279 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0005  adenylosuccinate lyase  34.66 
 
 		 454 aa  245  9.999999999999999e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1121  adenylosuccinate lyase  33.94 
 
 		 447 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5054  fumarate lyase  33.33 
 
 		 456 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0605282  normal  0.269052 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0757  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  35 
 
 		 457 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.3705  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0014  fumarate lyase  33.94 
 
 		 450 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000353189  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0986  adenylosuccinate lyase  33.71 
 
 		 448 aa  242  1e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00836427  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3622  fumarate lyase  35.08 
 
 		 456 aa  241  2.9999999999999997e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0741551  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1684  adenylosuccinate lyase  34.47 
 
 		 449 aa  238  1e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.29073  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2125  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  34.92 
 
 		 453 aa  238  3e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.398562 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3487  fumarate lyase  30.09 
 
 		 450 aa  237  3e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1555  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  37.88 
 
 		 452 aa  237  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3127  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  37 
 
 		 457 aa  237  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0645  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  36.94 
 
 		 459 aa  237  4e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0741414 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1485  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  37.64 
 
 		 452 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0048  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  37.64 
 
 		 452 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0058  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  37.64 
 
 		 452 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.593603  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1202  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  37.64 
 
 		 452 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0056  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  37.64 
 
 		 452 aa  236  7e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0457569  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2341  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  34.18 
 
 		 453 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0216  adenylosuccinate lyase  34.02 
 
 		 449 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.595584 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0069  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  37.64 
 
 		 452 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.675451  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04011  conserved hypothetical protein  32.86 
 
 		 476 aa  234  3e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.981247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3160  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  37.24 
 
 		 457 aa  234  3e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4459  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  36.71 
 
 		 476 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.484308 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2418  fumarate lyase  29.15 
 
 		 448 aa  233  8.000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.259458 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4557  fumarate lyase  31.22 
 
 		 449 aa  232  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2745  fumarate lyase  32.13 
 
 		 473 aa  231  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.632463  normal  0.0578708 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0824  adenylosuccinate lyase  32.88 
 
 		 446 aa  230  3e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.116488 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4314  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  37.18 
 
 		 459 aa  230  4e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.417348  normal  0.728676 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1906  putative lyase  32.08 
 
 		 445 aa  230  4e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5286  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  36.77 
 
 		 451 aa  228  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.335784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5019  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  36.72 
 
 		 460 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5748  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  36.77 
 
 		 452 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.955684  normal  0.122503 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4874  fumarate lyase  32.73 
 
 		 456 aa  227  4e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0760075  normal  0.0695852 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4344  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  35.62 
 
 		 450 aa  227  4e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.339693  normal  0.0393048 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1379  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  35.62 
 
 		 450 aa  226  6e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.449914  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3811  fumarate lyase  30.54 
 
 		 449 aa  226  6e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.647921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1160  adenylosuccinate lyase  33.56 
 
 		 446 aa  225  1e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0294  adenylosuccinate lyase  33.86 
 
 		 449 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.437352  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0048  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  36.41 
 
 		 465 aa  221  3e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4475  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  36.77 
 
 		 452 aa  219  7e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1273  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  33.87 
 
 		 454 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.281218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1019  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  34.76 
 
 		 450 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531997 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5067  fumarate lyase  35.87 
 
 		 446 aa  218  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.185188  normal  0.273207 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0673  adenylosuccinate lyase  32.87 
 
 		 448 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2505  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  34.73 
 
 		 452 aa  217  5e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16451  adenylosuccinate lyase  32.41 
 
 		 431 aa  215  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.721255  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16551  adenylosuccinate lyase  32.41 
 
 		 431 aa  215  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3743  adenylosuccinate lyase  33.9 
 
 		 422 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.391342 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5111  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  35.34 
 
 		 406 aa  211  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4015  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  35 
 
 		 490 aa  209  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0773124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1162  adenylosuccinate lyase  31.34 
 
 		 446 aa  207  2e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1701  adenylosuccinate lyase  32.57 
 
 		 445 aa  207  4e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.259986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1072  adenylosuccinate lyase  34.59 
 
 		 455 aa  207  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16671  adenylosuccinate lyase  31.94 
 
 		 431 aa  207  4e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0136  adenylosuccinate lyase  32.07 
 
 		 431 aa  207  4e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000687142  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0781  adenylosuccinate lyase  31.32 
 
 		 446 aa  206  5e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0994774  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4233  adenylosuccinate lyase  32.86 
 
 		 431 aa  206  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000273894 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1558  adenylosuccinate lyase  31.94 
 
 		 431 aa  205  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2587  adenylosuccinate lyase  32.11 
 
 		 431 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4169  adenylosuccinate lyase  34.45 
 
 		 431 aa  206  1e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.618231  normal  0.283805 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3530  adenylosuccinate lyase  32.11 
 
 		 431 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0819  adenylosuccinate lyase  31.25 
 
 		 438 aa  205  1e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2695  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  35.55 
 
 		 453 aa  204  2e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0450627  normal  0.5058 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5023  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  32.71 
 
 		 462 aa  204  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.261629  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2456  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  33.56 
 
 		 453 aa  202  8e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.786558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1963  adenylosuccinate lyase  30.52 
 
 		 431 aa  202  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.739677  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1997  adenylosuccinate lyase  30.52 
 
 		 431 aa  202  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.035377  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1455  adenylosuccinate lyase  30.41 
 
 		 453 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2094  adenylosuccinate lyase  32.39 
 
 		 431 aa  200  3.9999999999999996e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0455  Adenylosuccinate lyase  29.93 
 
 		 430 aa  200  5e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.547071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1536  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  32.18 
 
 		 438 aa  198  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0157227  normal  0.182398 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1446  adenylosuccinate lyase  30.26 
 
 		 431 aa  197  3e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.149725  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4435  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  34.93 
 
 		 450 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.115184  normal  0.0129696 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0018  adenylosuccinate lyase  29.98 
 
 		 458 aa  197  5.000000000000001e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.146335  decreased coverage  0.000415583 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0759  adenylosuccinate lyase  29.23 
 
 		 451 aa  196  6e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38190  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  34.02 
 
 		 450 aa  196  6e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569484  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3410  adenylosuccinate lyase  32.16 
 
 		 431 aa  196  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000391938  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>