More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1455 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1455  adenylosuccinate lyase  100 
 
 
453 aa  924    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0794  adenylosuccinate lyase  38.24 
 
 
449 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.652976  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1160  adenylosuccinate lyase  39.46 
 
 
446 aa  335  1e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0824  adenylosuccinate lyase  39.69 
 
 
446 aa  334  2e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.116488 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0986  adenylosuccinate lyase  37.56 
 
 
448 aa  332  7.000000000000001e-90  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00836427  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0216  adenylosuccinate lyase  38.69 
 
 
449 aa  330  3e-89  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.595584 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1684  adenylosuccinate lyase  38.46 
 
 
449 aa  328  9e-89  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.29073  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23110  adenylosuccinate lyase  41.49 
 
 
431 aa  325  8.000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1121  adenylosuccinate lyase  39.91 
 
 
447 aa  323  6e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1963  adenylosuccinate lyase  40.43 
 
 
431 aa  320  3.9999999999999996e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.739677  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1997  adenylosuccinate lyase  40.43 
 
 
431 aa  320  3.9999999999999996e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.035377  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0294  adenylosuccinate lyase  38.91 
 
 
449 aa  319  6e-86  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.437352  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1446  adenylosuccinate lyase  40 
 
 
431 aa  319  7.999999999999999e-86  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.149725  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0673  adenylosuccinate lyase  37.1 
 
 
448 aa  318  9e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1701  adenylosuccinate lyase  37.39 
 
 
445 aa  316  6e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.259986  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0781  adenylosuccinate lyase  37.84 
 
 
446 aa  315  8e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0994774  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0018  adenylosuccinate lyase  38.94 
 
 
458 aa  315  9.999999999999999e-85  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.146335  decreased coverage  0.000415583 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0393  adenylosuccinate lyase  39.81 
 
 
430 aa  314  1.9999999999999998e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.623936  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1218  adenylosuccinate lyase  39.17 
 
 
445 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1118  adenylosuccinate lyase  37.64 
 
 
446 aa  309  8e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.984181  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2052  adenylosuccinate lyase  41.47 
 
 
431 aa  307  2.0000000000000002e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0154529  normal  0.110523 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0307  adenylosuccinate lyase  40.53 
 
 
430 aa  301  2e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.141521  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1131  adenylosuccinate lyase  38.39 
 
 
431 aa  300  4e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1721  adenylosuccinate lyase  38.86 
 
 
431 aa  299  7e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1648  adenylosuccinate lyase  38.86 
 
 
431 aa  299  8e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1162  adenylosuccinate lyase  35.97 
 
 
446 aa  299  8e-80  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1217  adenylosuccinate lyase  36.38 
 
 
457 aa  298  1e-79  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0739358  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2587  adenylosuccinate lyase  39.15 
 
 
431 aa  296  4e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184004  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3530  adenylosuccinate lyase  39.15 
 
 
431 aa  296  4e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0255  adenylosuccinate lyase  39.34 
 
 
431 aa  296  5e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00422824  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1423  adenylosuccinate lyase  37.91 
 
 
435 aa  295  8e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4169  adenylosuccinate lyase  38.3 
 
 
431 aa  295  8e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.618231  normal  0.283805 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2094  adenylosuccinate lyase  39.72 
 
 
431 aa  295  1e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4984  adenylosuccinate lyase  39.48 
 
 
435 aa  295  2e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0319  adenylosuccinate lyase  39.48 
 
 
435 aa  294  3e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0271  adenylosuccinate lyase  39.24 
 
 
435 aa  294  3e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0363  adenylosuccinate lyase  39.48 
 
 
435 aa  294  3e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1779  adenylosuccinate lyase  38.22 
 
 
434 aa  293  3e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00299045  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0277  adenylosuccinate lyase  39.24 
 
 
435 aa  293  4e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351809  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0262  adenylosuccinate lyase  39.24 
 
 
435 aa  293  4e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0265  adenylosuccinate lyase  39.24 
 
 
435 aa  293  4e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0631795  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0290  adenylosuccinate lyase  39.24 
 
 
435 aa  293  4e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1648  adenylosuccinate lyase  37.2 
 
 
431 aa  293  4e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0322  adenylosuccinate lyase  39.24 
 
 
435 aa  293  4e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0336  adenylosuccinate lyase  39.24 
 
 
435 aa  293  5e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1634  adenylosuccinate lyase  39.57 
 
 
432 aa  292  7e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2370  adenylosuccinate lyase  39.1 
 
 
430 aa  292  8e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3743  adenylosuccinate lyase  38.85 
 
 
422 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.391342 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0269  adenylosuccinate lyase  39.01 
 
 
433 aa  291  1e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3410  adenylosuccinate lyase  38.77 
 
 
431 aa  291  2e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000391938  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16551  adenylosuccinate lyase  39.01 
 
 
431 aa  291  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16451  adenylosuccinate lyase  39.48 
 
 
431 aa  290  3e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.721255  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2151  adenylosuccinate lyase  38.02 
 
 
431 aa  290  3e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0455  Adenylosuccinate lyase  38.28 
 
 
430 aa  290  3e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.547071  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1558  adenylosuccinate lyase  39.72 
 
 
431 aa  290  4e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04631  adenylosuccinate lyase  36.97 
 
 
431 aa  289  6e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4928  adenylosuccinate lyase  39.34 
 
 
433 aa  289  7e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000014766  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16671  adenylosuccinate lyase  39.24 
 
 
431 aa  288  1e-76  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2952  adenylosuccinate lyase  37.27 
 
 
431 aa  288  1e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.582746  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15851  adenylosuccinate lyase  38.39 
 
 
431 aa  288  1e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0379  adenylosuccinate lyase  38.35 
 
 
430 aa  288  2e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1446  adenylosuccinate lyase  39.47 
 
 
433 aa  287  2e-76  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000278594  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0047  adenylosuccinate lyase  38.76 
 
 
432 aa  285  1.0000000000000001e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.727181  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1804  adenylosuccinate lyase  37.27 
 
 
431 aa  284  2.0000000000000002e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000252731  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0688  adenylosuccinate lyase  37.38 
 
 
435 aa  283  4.0000000000000003e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.930148  normal  0.150396 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0095  adenylosuccinate lyase  36.11 
 
 
436 aa  282  9e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0064  adenylosuccinate lyase  38.52 
 
 
432 aa  282  9e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2064  adenylosuccinate lyase  36.11 
 
 
431 aa  281  1e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0992  adenylosuccinate lyase  36.02 
 
 
435 aa  282  1e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4233  adenylosuccinate lyase  38.06 
 
 
431 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000273894 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0759  adenylosuccinate lyase  36.97 
 
 
451 aa  281  2e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0819  adenylosuccinate lyase  37.83 
 
 
438 aa  281  2e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_744  adenylosuccinate lyase  37.04 
 
 
451 aa  281  2e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0840  adenylosuccinate lyase  36.73 
 
 
451 aa  279  6e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1887  adenylosuccinate lyase  36.81 
 
 
431 aa  279  1e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0469  adenylosuccinate lyase  36.97 
 
 
431 aa  278  1e-73  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.802188  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2333  adenylosuccinate lyase  36.81 
 
 
431 aa  278  1e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.943471  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2095  adenylosuccinate lyase  35.56 
 
 
443 aa  278  2e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0729  adenylosuccinate lyase  37.44 
 
 
430 aa  277  2e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0786  adenylosuccinate lyase  35.65 
 
 
430 aa  277  3e-73  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0346499  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0136  adenylosuccinate lyase  36.97 
 
 
431 aa  276  5e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000687142  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0996  adenylosuccinate lyase  37.2 
 
 
431 aa  276  5e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.134084  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0660  adenylosuccinate lyase  37.83 
 
 
437 aa  276  5e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0610462  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2167  adenylosuccinate lyase  36.02 
 
 
435 aa  276  6e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0172588  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1243  adenylosuccinate lyase  37.44 
 
 
427 aa  276  8e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1943  adenylosuccinate lyase  35.65 
 
 
431 aa  275  8e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2209  adenylosuccinate lyase  36.73 
 
 
431 aa  275  9e-73  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.895264  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18651  adenylosuccinate lyase  37.2 
 
 
431 aa  275  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.537762  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0315  adenylosuccinate lyase  36.88 
 
 
431 aa  275  1.0000000000000001e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1819  adenylosuccinate lyase  36.04 
 
 
442 aa  275  1.0000000000000001e-72  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0991  adenylosuccinate lyase  36.88 
 
 
434 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1145  adenylosuccinate lyase  36.97 
 
 
431 aa  274  3e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1492  adenylosuccinate lyase  35.55 
 
 
435 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0862733 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1125  adenylosuccinate lyase  35.65 
 
 
433 aa  273  4.0000000000000004e-72  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.814931  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1058  adenylosuccinate lyase  36.08 
 
 
436 aa  273  7e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0818  adenylosuccinate lyase  40.95 
 
 
425 aa  271  1e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2695  adenylosuccinate lyase  36.73 
 
 
431 aa  271  2e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0303486  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1390  adenylosuccinate lyase  35.57 
 
 
431 aa  271  2e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.98811  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4474  adenylosuccinate lyase  34.56 
 
 
432 aa  271  2.9999999999999997e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.457482  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0059  adenylosuccinate lyase  37.88 
 
 
432 aa  270  2.9999999999999997e-71  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.169461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>