More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1439 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1439  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  100 
 
 		 460 aa  927    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535279 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1483  fumarate lyase  72.54 
 
 		 450 aa  689    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.151746  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0014  fumarate lyase  72.36 
 
 		 450 aa  670    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000353189  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0757  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  79.5 
 
 		 457 aa  714    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.3705  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4598  fumarate lyase  76.44 
 
 		 458 aa  710    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.604906  normal  0.691601 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1072  adenylosuccinate lyase  67.33 
 
 		 455 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3622  fumarate lyase  61.09 
 
 		 456 aa  539  9.999999999999999e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0741551  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04011  conserved hypothetical protein  57.78 
 
 		 476 aa  523  1e-147  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.981247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3487  fumarate lyase  52.48 
 
 		 450 aa  475  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3811  fumarate lyase  52.46 
 
 		 449 aa  472  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.647921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2418  fumarate lyase  53.72 
 
 		 448 aa  469  1.0000000000000001e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.259458 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4557  fumarate lyase  51.9 
 
 		 449 aa  468  9.999999999999999e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4409  fumarate lyase  50.9 
 
 		 446 aa  436  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2745  fumarate lyase  51.23 
 
 		 473 aa  432  1e-120  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.632463  normal  0.0578708 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21250  adenylosuccinate lyase  46.17 
 
 		 452 aa  377  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0991556  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2341  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  45.33 
 
 		 453 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2125  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  45.1 
 
 		 453 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.398562 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1906  putative lyase  41.4 
 
 		 445 aa  350  4e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1273  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  45.56 
 
 		 454 aa  341  2e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.281218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1019  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  45.56 
 
 		 450 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531997 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4344  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  44.44 
 
 		 450 aa  340  5e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.339693  normal  0.0393048 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38190  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  45.86 
 
 		 450 aa  339  5.9999999999999996e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569484  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1379  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  44.44 
 
 		 450 aa  339  7e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.449914  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0170  adenylosuccinate lyase  40.27 
 
 		 454 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00265741  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5023  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  46.74 
 
 		 462 aa  336  7e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.261629  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4374  adenylosuccinate lyase  39.77 
 
 		 451 aa  335  7.999999999999999e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.25048e-22 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4459  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  45.47 
 
 		 476 aa  335  9e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.484308 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0215  adenylosuccinate lyase  39.86 
 
 		 454 aa  335  9e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.314002  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3997  adenylosuccinate lyase  39.41 
 
 		 454 aa  333  5e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00709346  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4188  adenylosuccinate lyase  39.64 
 
 		 454 aa  332  6e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0645  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  46.77 
 
 		 459 aa  332  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0741414 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3160  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  46.44 
 
 		 457 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4015  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  47.38 
 
 		 490 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0773124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3127  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  46.54 
 
 		 457 aa  325  7e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4314  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  46.31 
 
 		 459 aa  323  3e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.417348  normal  0.728676 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5286  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  47 
 
 		 451 aa  322  7e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.335784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0280  adenylosuccinate lyase  38.78 
 
 		 454 aa  321  1.9999999999999998e-86  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18830  adenylosuccinate lyase  41.36 
 
 		 477 aa  319  7.999999999999999e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0801563 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5019  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  46.36 
 
 		 460 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2505  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  44.29 
 
 		 452 aa  317  4e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3210  adenylosuccinate lyase  40.23 
 
 		 452 aa  316  5e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.127423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0056  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  45.85 
 
 		 452 aa  316  5e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0457569  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2456  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  46.41 
 
 		 453 aa  316  5e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.786558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0048  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  45.62 
 
 		 465 aa  316  6e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1555  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  45.62 
 
 		 452 aa  315  9e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0048  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  45.62 
 
 		 452 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1630  adenylosuccinate lyase  40.81 
 
 		 477 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1485  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  45.62 
 
 		 452 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0069  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  45.62 
 
 		 452 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.675451  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0058  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  45.62 
 
 		 452 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.593603  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1202  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  45.62 
 
 		 452 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02908  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  45.37 
 
 		 450 aa  311  1e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1536  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  41.28 
 
 		 438 aa  310  2e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0157227  normal  0.182398 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5748  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  46.31 
 
 		 452 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.955684  normal  0.122503 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2251  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  47.53 
 
 		 453 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.001838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4435  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  43.33 
 
 		 450 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.115184  normal  0.0129696 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4475  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  46.77 
 
 		 452 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02830  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  47.84 
 
 		 459 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289129 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1582  adenylosuccinate lyase  38.65 
 
 		 455 aa  303  4.0000000000000003e-81  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1393  adenylosuccinate lyase  38.43 
 
 		 455 aa  301  1e-80  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00268576  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2063  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  46.19 
 
 		 453 aa  299  7e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.146832  normal  0.884924 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5111  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  46.88 
 
 		 406 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2695  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  43.61 
 
 		 453 aa  293  4e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0450627  normal  0.5058 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0316  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  47.84 
 
 		 459 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2084  fumarate lyase  47.09 
 
 		 451 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.252524  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0005  adenylosuccinate lyase  35.83 
 
 		 454 aa  280  4e-74  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0824  adenylosuccinate lyase  36.22 
 
 		 446 aa  269  8.999999999999999e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.116488 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1579  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  44.42 
 
 		 448 aa  268  1e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.13236  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7931  3-carboxy-cis,cis-muconate cyclo-isomerase  42.21 
 
 		 452 aa  267  4e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46399  normal  0.48372 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4654  fumarate lyase  44.74 
 
 		 451 aa  265  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.179746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2958  adenylosuccinate lyase  36.65 
 
 		 471 aa  261  2e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121926  hitchhiker  0.00625137 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1160  adenylosuccinate lyase  35.86 
 
 		 446 aa  260  4e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1701  adenylosuccinate lyase  37.1 
 
 		 445 aa  258  2e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.259986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1631  adenylosuccinate lyase  36.43 
 
 		 483 aa  257  3e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1055  fumarate lyase  38.2 
 
 		 488 aa  255  9e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0781  adenylosuccinate lyase  37.21 
 
 		 446 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0994774  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0673  adenylosuccinate lyase  34.55 
 
 		 448 aa  251  1e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0794  adenylosuccinate lyase  35.21 
 
 		 449 aa  249  6e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.652976  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2385  fumarate lyase  41.57 
 
 		 463 aa  249  6e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.72571  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4837  fumarate lyase  35.99 
 
 		 450 aa  248  1e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.616525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13030  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  40.09 
 
 		 462 aa  246  4e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18850  adenylosuccinate lyase  35.27 
 
 		 483 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.110706 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1121  adenylosuccinate lyase  35.54 
 
 		 447 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1162  adenylosuccinate lyase  33.33 
 
 		 446 aa  244  3e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4654  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  39.3 
 
 		 464 aa  242  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0817649  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1217  adenylosuccinate lyase  32.64 
 
 		 457 aa  240  4e-62  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0739358  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0216  adenylosuccinate lyase  34.99 
 
 		 449 aa  236  6e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.595584 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0294  adenylosuccinate lyase  34.23 
 
 		 449 aa  233  6e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.437352  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1218  adenylosuccinate lyase  37.01 
 
 		 445 aa  233  6e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5054  fumarate lyase  33.41 
 
 		 456 aa  233  7.000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0605282  normal  0.269052 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1684  adenylosuccinate lyase  34.99 
 
 		 449 aa  233  7.000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.29073  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0986  adenylosuccinate lyase  33.86 
 
 		 448 aa  230  3e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00836427  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2833  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  42.46 
 
 		 464 aa  224  4e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0819  adenylosuccinate lyase  31.09 
 
 		 438 aa  224  4e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23110  adenylosuccinate lyase  30.77 
 
 		 431 aa  222  9.999999999999999e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3410  adenylosuccinate lyase  33.56 
 
 		 431 aa  222  9.999999999999999e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000391938  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2094  adenylosuccinate lyase  33.18 
 
 		 431 aa  219  6e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0018  adenylosuccinate lyase  32.49 
 
 		 458 aa  219  8.999999999999998e-56  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.146335  decreased coverage  0.000415583 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4818  fumarate lyase  33.48 
 
 		 451 aa  219  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.327057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4169  adenylosuccinate lyase  32.1 
 
 		 431 aa  219  1e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.618231  normal  0.283805 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>