More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0018 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0018  adenylosuccinate lyase  100 
 
 
458 aa  932    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.146335  decreased coverage  0.000415583 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1217  adenylosuccinate lyase  65.17 
 
 
457 aa  610  1e-173  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0739358  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0824  adenylosuccinate lyase  39.58 
 
 
446 aa  331  2e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.116488 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1162  adenylosuccinate lyase  40.76 
 
 
446 aa  330  4e-89  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1218  adenylosuccinate lyase  41.67 
 
 
445 aa  329  6e-89  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1121  adenylosuccinate lyase  39.19 
 
 
447 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0129  fumarate lyase  48.22 
 
 
408 aa  325  9e-88  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0673  adenylosuccinate lyase  38 
 
 
448 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1160  adenylosuccinate lyase  38.88 
 
 
446 aa  319  7e-86  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0794  adenylosuccinate lyase  38.15 
 
 
449 aa  317  2e-85  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.652976  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1197  adenylosuccinate lyase  46.97 
 
 
403 aa  317  2e-85  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0147  adenylosuccinate lyase  45.65 
 
 
403 aa  317  4e-85  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0520722  normal  0.203508 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1455  adenylosuccinate lyase  38.94 
 
 
453 aa  315  9.999999999999999e-85  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0781  adenylosuccinate lyase  38.01 
 
 
446 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0994774  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0161  adenylosuccinate lyase  45.07 
 
 
406 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.576792  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1701  adenylosuccinate lyase  38.62 
 
 
445 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.259986  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0216  adenylosuccinate lyase  37.7 
 
 
449 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.595584 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1684  adenylosuccinate lyase  37.92 
 
 
449 aa  301  1e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.29073  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1118  adenylosuccinate lyase  38.74 
 
 
446 aa  302  1e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.984181  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0986  adenylosuccinate lyase  36.4 
 
 
448 aa  300  4e-80  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00836427  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0294  adenylosuccinate lyase  38.13 
 
 
449 aa  292  8e-78  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.437352  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0307  adenylosuccinate lyase  37.62 
 
 
430 aa  292  9e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.141521  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1446  adenylosuccinate lyase  36.49 
 
 
433 aa  292  9e-78  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000278594  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0455  Adenylosuccinate lyase  37.15 
 
 
430 aa  290  4e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.547071  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2587  adenylosuccinate lyase  36.93 
 
 
431 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184004  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3530  adenylosuccinate lyase  36.93 
 
 
431 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3743  adenylosuccinate lyase  37.26 
 
 
422 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.391342 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1446  adenylosuccinate lyase  35.66 
 
 
431 aa  281  2e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.149725  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16551  adenylosuccinate lyase  34.03 
 
 
431 aa  278  1e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16451  adenylosuccinate lyase  33.8 
 
 
431 aa  277  3e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.721255  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1943  adenylosuccinate lyase  36.21 
 
 
431 aa  276  5e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0840  adenylosuccinate lyase  35.08 
 
 
451 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16671  adenylosuccinate lyase  34.03 
 
 
431 aa  275  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0393  adenylosuccinate lyase  36.36 
 
 
430 aa  274  2.0000000000000002e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.623936  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1558  adenylosuccinate lyase  34.03 
 
 
431 aa  274  3e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1423  adenylosuccinate lyase  35.58 
 
 
435 aa  274  3e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0786  adenylosuccinate lyase  36.99 
 
 
430 aa  273  5.000000000000001e-72  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0346499  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2464  adenylosuccinate lyase  36.85 
 
 
438 aa  273  6e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.495777  hitchhiker  0.00480262 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2052  adenylosuccinate lyase  35.9 
 
 
431 aa  272  1e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0154529  normal  0.110523 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_744  adenylosuccinate lyase  34.84 
 
 
451 aa  272  1e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0759  adenylosuccinate lyase  34.84 
 
 
451 aa  271  2e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04631  adenylosuccinate lyase  34.57 
 
 
431 aa  271  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0136  adenylosuccinate lyase  36.89 
 
 
431 aa  270  4e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000687142  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1963  adenylosuccinate lyase  33.8 
 
 
431 aa  270  4e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.739677  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0315  adenylosuccinate lyase  35.96 
 
 
431 aa  270  4e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1997  adenylosuccinate lyase  33.8 
 
 
431 aa  270  4e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.035377  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4233  adenylosuccinate lyase  34.03 
 
 
431 aa  270  5e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000273894 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1473  adenylosuccinate lyase  35.75 
 
 
431 aa  270  5e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1390  adenylosuccinate lyase  34.42 
 
 
431 aa  268  1e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.98811  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2064  adenylosuccinate lyase  34.81 
 
 
431 aa  268  2e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23110  adenylosuccinate lyase  34.35 
 
 
431 aa  267  2.9999999999999995e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1632  adenylosuccinate lyase  35.05 
 
 
431 aa  267  4e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328122  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2094  adenylosuccinate lyase  34.27 
 
 
431 aa  265  1e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1740  adenylosuccinate lyase  35.86 
 
 
442 aa  264  2e-69  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.483488  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0819  adenylosuccinate lyase  36.28 
 
 
438 aa  263  4e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3102  adenylosuccinate lyase  36.13 
 
 
436 aa  263  6e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.611529  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1721  adenylosuccinate lyase  34.5 
 
 
431 aa  263  6e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1125  adenylosuccinate lyase  35.15 
 
 
433 aa  262  8.999999999999999e-69  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.814931  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4169  adenylosuccinate lyase  34.56 
 
 
431 aa  262  1e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.618231  normal  0.283805 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1648  adenylosuccinate lyase  34.27 
 
 
431 aa  261  2e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0047  adenylosuccinate lyase  34.95 
 
 
432 aa  260  3e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.727181  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0379  adenylosuccinate lyase  33.56 
 
 
430 aa  259  5.0000000000000005e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0255  adenylosuccinate lyase  33.88 
 
 
431 aa  259  9e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00422824  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1887  adenylosuccinate lyase  33.88 
 
 
431 aa  259  1e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3410  adenylosuccinate lyase  33.57 
 
 
431 aa  258  1e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000391938  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1131  adenylosuccinate lyase  35.42 
 
 
431 aa  258  2e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1779  adenylosuccinate lyase  33.87 
 
 
434 aa  256  4e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00299045  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0660  adenylosuccinate lyase  35.66 
 
 
437 aa  256  6e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0610462  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15851  adenylosuccinate lyase  34.42 
 
 
431 aa  256  7e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2370  adenylosuccinate lyase  34.26 
 
 
430 aa  256  8e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1243  adenylosuccinate lyase  36.07 
 
 
427 aa  256  9e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1139  adenylosuccinate lyase  34.93 
 
 
425 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.863394  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2151  adenylosuccinate lyase  34.11 
 
 
431 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0064  adenylosuccinate lyase  34.03 
 
 
432 aa  255  1.0000000000000001e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0729  adenylosuccinate lyase  34.75 
 
 
430 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4928  adenylosuccinate lyase  33.8 
 
 
433 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000014766  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1804  adenylosuccinate lyase  34.71 
 
 
431 aa  254  3e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000252731  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2333  adenylosuccinate lyase  33.41 
 
 
431 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.943471  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1819  adenylosuccinate lyase  32.27 
 
 
442 aa  253  7e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1526  adenylosuccinate lyase  34.45 
 
 
425 aa  253  7e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1468  adenylosuccinate lyase  34.97 
 
 
432 aa  252  1e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2095  adenylosuccinate lyase  33.26 
 
 
443 aa  252  1e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0991  adenylosuccinate lyase  34.67 
 
 
434 aa  252  1e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0269  adenylosuccinate lyase  33.49 
 
 
433 aa  251  1e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1108  adenylosuccinate lyase  35.29 
 
 
434 aa  251  1e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.34197  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2695  adenylosuccinate lyase  34.5 
 
 
431 aa  251  2e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0303486  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0265  adenylosuccinate lyase  33.87 
 
 
435 aa  251  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0631795  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1121  adenylosuccinate lyase  32.59 
 
 
447 aa  251  2e-65  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1145  adenylosuccinate lyase  32.87 
 
 
431 aa  251  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0219  adenylosuccinate lyase  34.49 
 
 
432 aa  251  2e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.550323  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1894  adenylosuccinate lyase  32.27 
 
 
443 aa  251  2e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0271  adenylosuccinate lyase  33.95 
 
 
435 aa  251  3e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3011  adenylosuccinate lyase  35.2 
 
 
431 aa  250  4e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.367246  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1307  adenylosuccinate lyase  34.45 
 
 
427 aa  250  4e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.325105  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0322  adenylosuccinate lyase  33.49 
 
 
435 aa  249  6e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0277  adenylosuccinate lyase  33.49 
 
 
435 aa  249  6e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351809  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0262  adenylosuccinate lyase  33.49 
 
 
435 aa  249  6e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0290  adenylosuccinate lyase  33.49 
 
 
435 aa  249  6e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0336  adenylosuccinate lyase  33.49 
 
 
435 aa  249  7e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0319  adenylosuccinate lyase  33.26 
 
 
435 aa  249  8e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>