More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1630 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1630  adenylosuccinate lyase  100 
 
 		 477 aa  954    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18830  adenylosuccinate lyase  87.84 
 
 		 477 aa  849    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0801563 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0170  adenylosuccinate lyase  45.27 
 
 		 454 aa  391  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00265741  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0215  adenylosuccinate lyase  43.92 
 
 		 454 aa  389  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.314002  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3997  adenylosuccinate lyase  43.11 
 
 		 454 aa  377  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00709346  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0280  adenylosuccinate lyase  43.89 
 
 		 454 aa  378  1e-103  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4188  adenylosuccinate lyase  43.33 
 
 		 454 aa  375  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21250  adenylosuccinate lyase  44.74 
 
 		 452 aa  368  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0991556  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1393  adenylosuccinate lyase  42.63 
 
 		 455 aa  362  8e-99  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00268576  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1582  adenylosuccinate lyase  42.63 
 
 		 455 aa  361  1e-98  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0005  adenylosuccinate lyase  43.21 
 
 		 454 aa  358  8e-98  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3210  adenylosuccinate lyase  43.92 
 
 		 452 aa  354  2e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.127423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1631  adenylosuccinate lyase  42.08 
 
 		 483 aa  333  4e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3811  fumarate lyase  39.86 
 
 		 449 aa  330  3e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.647921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18850  adenylosuccinate lyase  41.57 
 
 		 483 aa  326  6e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.110706 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4557  fumarate lyase  38.74 
 
 		 449 aa  322  9.999999999999999e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1483  fumarate lyase  38.48 
 
 		 450 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.151746  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4374  adenylosuccinate lyase  38.7 
 
 		 451 aa  320  5e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.25048e-22 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3487  fumarate lyase  38.51 
 
 		 450 aa  319  6e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4598  fumarate lyase  41.31 
 
 		 458 aa  317  3e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.604906  normal  0.691601 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1439  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  40.81 
 
 		 460 aa  314  1.9999999999999998e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535279 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2418  fumarate lyase  39.1 
 
 		 448 aa  311  2e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.259458 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0014  fumarate lyase  39.64 
 
 		 450 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000353189  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0757  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  41.18 
 
 		 457 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.3705  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2958  adenylosuccinate lyase  41.65 
 
 		 471 aa  302  7.000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121926  hitchhiker  0.00625137 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5054  fumarate lyase  40.71 
 
 		 456 aa  299  6e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0605282  normal  0.269052 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3622  fumarate lyase  38.84 
 
 		 456 aa  291  1e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0741551  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4837  fumarate lyase  40.09 
 
 		 450 aa  290  5.0000000000000004e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.616525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1072  adenylosuccinate lyase  40.41 
 
 		 455 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4874  fumarate lyase  41.88 
 
 		 456 aa  286  7e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0760075  normal  0.0695852 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2745  fumarate lyase  36.24 
 
 		 473 aa  285  1.0000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.632463  normal  0.0578708 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4818  fumarate lyase  39.37 
 
 		 451 aa  281  1e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.327057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0794  adenylosuccinate lyase  38.07 
 
 		 449 aa  281  2e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.652976  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4409  fumarate lyase  36.26 
 
 		 446 aa  276  7e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5067  fumarate lyase  40.45 
 
 		 446 aa  274  3e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.185188  normal  0.273207 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0986  adenylosuccinate lyase  37.16 
 
 		 448 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00836427  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1906  putative lyase  35.63 
 
 		 445 aa  273  6e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0216  adenylosuccinate lyase  38.07 
 
 		 449 aa  265  2e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.595584 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0824  adenylosuccinate lyase  35.99 
 
 		 446 aa  263  4e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.116488 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1684  adenylosuccinate lyase  37.84 
 
 		 449 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.29073  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04011  conserved hypothetical protein  34.55 
 
 		 476 aa  259  6e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.981247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4015  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  39.51 
 
 		 490 aa  256  5e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0773124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1160  adenylosuccinate lyase  36.45 
 
 		 446 aa  256  9e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5023  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  36.79 
 
 		 462 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.261629  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0673  adenylosuccinate lyase  36.07 
 
 		 448 aa  251  1e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2341  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  37.23 
 
 		 453 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0294  adenylosuccinate lyase  37.61 
 
 		 449 aa  251  2e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.437352  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2125  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  37.87 
 
 		 453 aa  250  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.398562 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1121  adenylosuccinate lyase  36.64 
 
 		 447 aa  250  4e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1019  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  38.17 
 
 		 450 aa  249  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531997 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1379  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  37.24 
 
 		 450 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.449914  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4344  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  37.24 
 
 		 450 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.339693  normal  0.0393048 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4314  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  38.69 
 
 		 459 aa  248  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.417348  normal  0.728676 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0645  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  38.01 
 
 		 459 aa  246  9e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0741414 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3127  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  39.41 
 
 		 457 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2456  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  39.36 
 
 		 453 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.786558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4459  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  38.24 
 
 		 476 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.484308 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0781  adenylosuccinate lyase  37.36 
 
 		 446 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0994774  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0393  adenylosuccinate lyase  35.89 
 
 		 430 aa  244  3e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.623936  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2251  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  41.06 
 
 		 453 aa  243  7e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.001838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3160  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  39.81 
 
 		 457 aa  242  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2505  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  40 
 
 		 452 aa  241  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5019  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  39.55 
 
 		 460 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1555  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  39.58 
 
 		 452 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0056  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  39.81 
 
 		 452 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0457569  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1202  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  39.58 
 
 		 452 aa  239  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0048  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  39.58 
 
 		 452 aa  239  1e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1485  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  39.58 
 
 		 452 aa  239  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0058  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  39.58 
 
 		 452 aa  239  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.593603  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0069  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  39.58 
 
 		 452 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.675451  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2695  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  41.18 
 
 		 453 aa  238  2e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0450627  normal  0.5058 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5748  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  39.81 
 
 		 452 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.955684  normal  0.122503 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0048  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  39.58 
 
 		 465 aa  236  7e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1273  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  37.08 
 
 		 454 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.281218  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38190  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  39.21 
 
 		 450 aa  234  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569484  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1701  adenylosuccinate lyase  34.94 
 
 		 445 aa  234  3e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.259986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5286  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  39.34 
 
 		 451 aa  233  5e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.335784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4435  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  37 
 
 		 450 aa  232  9e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.115184  normal  0.0129696 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02908  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  36.85 
 
 		 450 aa  232  9e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1218  adenylosuccinate lyase  35.38 
 
 		 445 aa  231  2e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1162  adenylosuccinate lyase  34.1 
 
 		 446 aa  230  4e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4475  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  40.05 
 
 		 452 aa  229  7e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0307  adenylosuccinate lyase  36.21 
 
 		 430 aa  229  1e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.141521  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2063  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  39.36 
 
 		 453 aa  228  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.146832  normal  0.884924 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7931  3-carboxy-cis,cis-muconate cyclo-isomerase  37.64 
 
 		 452 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46399  normal  0.48372 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5111  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  39.4 
 
 		 406 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2052  adenylosuccinate lyase  34.53 
 
 		 431 aa  223  4.9999999999999996e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0154529  normal  0.110523 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2151  adenylosuccinate lyase  34.93 
 
 		 431 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1943  adenylosuccinate lyase  33.97 
 
 		 431 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2370  adenylosuccinate lyase  35.8 
 
 		 430 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1536  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  33.49 
 
 		 438 aa  220  5e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0157227  normal  0.182398 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23110  adenylosuccinate lyase  31.85 
 
 		 431 aa  218  2e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1632  adenylosuccinate lyase  33.49 
 
 		 431 aa  216  7e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328122  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2084  fumarate lyase  38.35 
 
 		 451 aa  216  9e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.252524  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0455  Adenylosuccinate lyase  33.18 
 
 		 430 aa  214  1.9999999999999998e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.547071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4928  adenylosuccinate lyase  34.53 
 
 		 433 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000014766  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0818  adenylosuccinate lyase  36.6 
 
 		 425 aa  211  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1446  adenylosuccinate lyase  32.32 
 
 		 433 aa  211  2e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000278594  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1455  adenylosuccinate lyase  30.37 
 
 		 453 aa  211  2e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0255  adenylosuccinate lyase  33.49 
 
 		 431 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00422824  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>