More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_5067 on replicon NC_009717
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009717  Xaut_5067  fumarate lyase  100 
 
 		 446 aa  898    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.185188  normal  0.273207 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5054  fumarate lyase  69.13 
 
 		 456 aa  617  1e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0605282  normal  0.269052 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4874  fumarate lyase  69.13 
 
 		 456 aa  586  1e-166  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0760075  normal  0.0695852 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4818  fumarate lyase  44.15 
 
 		 451 aa  309  5e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.327057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4837  fumarate lyase  44.57 
 
 		 450 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.616525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18830  adenylosuccinate lyase  42.27 
 
 		 477 aa  299  6e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0801563 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1630  adenylosuccinate lyase  40.45 
 
 		 477 aa  287  2e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3210  adenylosuccinate lyase  39.1 
 
 		 452 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.127423  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0280  adenylosuccinate lyase  35.97 
 
 		 454 aa  273  5.000000000000001e-72  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21250  adenylosuccinate lyase  37.44 
 
 		 452 aa  267  2e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0991556  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0170  adenylosuccinate lyase  35.47 
 
 		 454 aa  266  7e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00265741  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0215  adenylosuccinate lyase  35.7 
 
 		 454 aa  265  1e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.314002  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1582  adenylosuccinate lyase  36.67 
 
 		 455 aa  261  2e-68  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1393  adenylosuccinate lyase  36.22 
 
 		 455 aa  259  7e-68  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00268576  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0005  adenylosuccinate lyase  35.75 
 
 		 454 aa  255  1.0000000000000001e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3997  adenylosuccinate lyase  33.18 
 
 		 454 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00709346  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4188  adenylosuccinate lyase  33.18 
 
 		 454 aa  251  1e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4374  adenylosuccinate lyase  32.29 
 
 		 451 aa  241  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.25048e-22 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2958  adenylosuccinate lyase  37 
 
 		 471 aa  238  1e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121926  hitchhiker  0.00625137 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18850  adenylosuccinate lyase  35.87 
 
 		 483 aa  237  3e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.110706 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2745  fumarate lyase  33.33 
 
 		 473 aa  234  2.0000000000000002e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.632463  normal  0.0578708 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3811  fumarate lyase  32.89 
 
 		 449 aa  231  3e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.647921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1631  adenylosuccinate lyase  34.32 
 
 		 483 aa  230  4e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2418  fumarate lyase  33.41 
 
 		 448 aa  230  4e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.259458 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3487  fumarate lyase  32.21 
 
 		 450 aa  229  6e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4557  fumarate lyase  32.95 
 
 		 449 aa  227  3e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4409  fumarate lyase  33.93 
 
 		 446 aa  225  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2341  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  34.65 
 
 		 453 aa  224  3e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1439  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  37.31 
 
 		 460 aa  223  4e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535279 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1072  adenylosuccinate lyase  35.52 
 
 		 455 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1273  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  34.38 
 
 		 454 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.281218  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1483  fumarate lyase  31.35 
 
 		 450 aa  215  9.999999999999999e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.151746  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0014  fumarate lyase  32.74 
 
 		 450 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000353189  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2125  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  34.03 
 
 		 453 aa  212  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.398562 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1906  putative lyase  32.2 
 
 		 445 aa  210  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0757  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  33.94 
 
 		 457 aa  209  7e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.3705  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4598  fumarate lyase  35.1 
 
 		 458 aa  209  7e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.604906  normal  0.691601 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1379  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  33.64 
 
 		 450 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.449914  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4344  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  33.64 
 
 		 450 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.339693  normal  0.0393048 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3622  fumarate lyase  31.15 
 
 		 456 aa  199  7.999999999999999e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0741551  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1019  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  34.27 
 
 		 450 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531997 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0986  adenylosuccinate lyase  31.24 
 
 		 448 aa  196  9e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00836427  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0316  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  36.02 
 
 		 459 aa  194  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1217  adenylosuccinate lyase  28.67 
 
 		 457 aa  192  1e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0739358  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02908  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  35.43 
 
 		 450 aa  192  1e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0794  adenylosuccinate lyase  31.97 
 
 		 449 aa  191  2e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.652976  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23110  adenylosuccinate lyase  31.1 
 
 		 431 aa  191  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0315  adenylosuccinate lyase  34.13 
 
 		 431 aa  190  4e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38190  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  34.42 
 
 		 450 aa  190  4e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569484  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0307  adenylosuccinate lyase  34.54 
 
 		 430 aa  189  8e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.141521  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0824  adenylosuccinate lyase  30.38 
 
 		 446 aa  189  1e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.116488 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0645  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  32.3 
 
 		 459 aa  188  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0741414 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02830  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  35.35 
 
 		 459 aa  188  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289129 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1145  adenylosuccinate lyase  32.08 
 
 		 431 aa  188  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3410  adenylosuccinate lyase  34.07 
 
 		 431 aa  187  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000391938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4435  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  33.64 
 
 		 450 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.115184  normal  0.0129696 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1121  adenylosuccinate lyase  32.93 
 
 		 447 aa  187  3e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0255  adenylosuccinate lyase  31.8 
 
 		 431 aa  187  4e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00422824  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1536  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  33.93 
 
 		 438 aa  187  4e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0157227  normal  0.182398 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04011  conserved hypothetical protein  30.34 
 
 		 476 aa  186  1.0000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.981247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0759  adenylosuccinate lyase  30.62 
 
 		 451 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2333  adenylosuccinate lyase  31.35 
 
 		 431 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.943471  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4314  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  32.3 
 
 		 459 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.417348  normal  0.728676 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4463  adenylosuccinate lyase  33.03 
 
 		 438 aa  185  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.34436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3530  adenylosuccinate lyase  32.93 
 
 		 431 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2456  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  33.04 
 
 		 453 aa  184  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.786558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2587  adenylosuccinate lyase  32.93 
 
 		 431 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0294  adenylosuccinate lyase  31.35 
 
 		 449 aa  184  3e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.437352  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1684  adenylosuccinate lyase  32.43 
 
 		 449 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.29073  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0216  adenylosuccinate lyase  32.2 
 
 		 449 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.595584 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2952  adenylosuccinate lyase  32.63 
 
 		 431 aa  182  7e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.582746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1943  adenylosuccinate lyase  30.88 
 
 		 431 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2064  adenylosuccinate lyase  29.08 
 
 		 431 aa  181  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1887  adenylosuccinate lyase  30.88 
 
 		 431 aa  182  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0840  adenylosuccinate lyase  30.14 
 
 		 451 aa  180  5.999999999999999e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2251  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  34.15 
 
 		 453 aa  180  5.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.001838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1131  adenylosuccinate lyase  31.55 
 
 		 431 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2385  fumarate lyase  35.26 
 
 		 463 aa  179  7e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.72571  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1446  adenylosuccinate lyase  29.19 
 
 		 431 aa  178  1e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.149725  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0393  adenylosuccinate lyase  31.68 
 
 		 430 aa  179  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.623936  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0048  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  33.19 
 
 		 452 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1555  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  33.19 
 
 		 452 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0058  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  33.19 
 
 		 452 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.593603  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1485  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  33.19 
 
 		 452 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1202  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  33.19 
 
 		 452 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0069  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  33.19 
 
 		 452 aa  178  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.675451  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2695  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  32.52 
 
 		 453 aa  178  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0450627  normal  0.5058 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1160  adenylosuccinate lyase  30.43 
 
 		 446 aa  177  3e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4169  adenylosuccinate lyase  32.12 
 
 		 431 aa  177  3e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.618231  normal  0.283805 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_744  adenylosuccinate lyase  29.9 
 
 		 451 aa  177  4e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0056  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  32.97 
 
 		 452 aa  177  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0457569  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4233  adenylosuccinate lyase  32.25 
 
 		 431 aa  177  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000273894 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0219  adenylosuccinate lyase  30.5 
 
 		 432 aa  177  4e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.550323  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0729  adenylosuccinate lyase  31.85 
 
 		 430 aa  177  5e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0673  adenylosuccinate lyase  29.93 
 
 		 448 aa  176  7e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5286  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  34.12 
 
 		 451 aa  176  8e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.335784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2063  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  33.71 
 
 		 453 aa  176  9e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.146832  normal  0.884924 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3127  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  33.8 
 
 		 457 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0018  adenylosuccinate lyase  29.32 
 
 		 458 aa  176  9.999999999999999e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.146335  decreased coverage  0.000415583 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2695  adenylosuccinate lyase  32.31 
 
 		 431 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0303486  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>