39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2721 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_2721  type II secretion system protein  100 
 
 		 361 aa  736    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0449144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0361  toxin co-regulated pilus biosynthesis protein E  21.47 
 
 		 340 aa  89.7  7e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.358963  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2834  Type II secretion system F domain protein  23.99 
 
 		 358 aa  82.8  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.433586 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1606  type IV pilus biogenesis protein  22.44 
 
 		 358 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164754  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0652  BfpE  22.44 
 
 		 358 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.778877  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0662  type IV pilus biogenesis protein  22.44 
 
 		 358 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2169  type IV pilus biogenesis protein  22.44 
 
 		 358 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0735578  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2253  type IV pilus biogenesis protein  22.44 
 
 		 358 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1983  type IV pilus biogenesis protein  22.44 
 
 		 358 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.611702  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5876  type II secretion system protein  21.9 
 
 		 358 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5659  type II secretion system protein  21.9 
 
 		 358 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.867335  hitchhiker  0.00476713 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0064  putative type IV secretion system protein PilR  22.25 
 
 		 354 aa  65.5  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0773  type IV pilus biogenesis protein  22.14 
 
 		 358 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.7274  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5913  type II secretion system protein  23.57 
 
 		 358 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.649484  decreased coverage  0.00495524 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4207  type II secretion system protein  23.6 
 
 		 360 aa  61.2  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5027  type II secretion system protein  23.56 
 
 		 346 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5433  type II secretion system protein  23.56 
 
 		 346 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0018  type II secretion system protein F  21.93 
 
 		 359 aa  57  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0113  integral membrane protein  21.21 
 
 		 365 aa  56.6  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6560  hypothetical protein  22.02 
 
 		 377 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0853  type II secretion system protein  25.09 
 
 		 399 aa  54.7  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000781273  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0830  type II secretion system protein  25.09 
 
 		 399 aa  54.7  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000760113  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59310  type IV B pilus protein  18.96 
 
 		 359 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0474078  hitchhiker  0.000000000806613 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4475  type IV B pilus protein  18.96 
 
 		 359 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  23.55 
 
 		 401 aa  54.3  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1513  type II secretion system protein  19.74 
 
 		 363 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5556  type II secretion system protein  20.2 
 
 		 377 aa  46.2  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.747245  normal  0.134799 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1011  type II secretion system protein  21.07 
 
 		 413 aa  45.1  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002544  type 4 fimbrial assembly protein PilC  21.32 
 
 		 407 aa  44.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000177594  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  20.31 
 
 		 405 aa  44.3  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1342  type II secretion system protein  21.94 
 
 		 395 aa  44.3  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0374  type II secretion system protein  21.27 
 
 		 407 aa  43.5  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.777573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03470  hypothetical protein  20.3 
 
 		 407 aa  43.5  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4184  type II secretion system protein  18.84 
 
 		 404 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.130479 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  22.46 
 
 		 405 aa  43.1  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3701  hypothetical protein  24.77 
 
 		 413 aa  43.1  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.911939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  20.9 
 
 		 406 aa  43.1  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1749  type II secretion system protein  23.66 
 
 		 397 aa  42.7  0.009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.28453  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  21.19 
 
 		 408 aa  42.7  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>