49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2701 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4161  helicase domain-containing protein  60.04 
 
 		 600 aa  647    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.17704 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2368  plasmid-related protein  59.85 
 
 		 757 aa  805    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2220  helicase domain-containing protein  59.71 
 
 		 756 aa  800    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.525219 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1417  helicase domain-containing protein  58.89 
 
 		 759 aa  798    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1285  helicase domain-containing protein  59.04 
 
 		 759 aa  795    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2701  helicase domain-containing protein  100 
 
 		 788 aa  1628    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0540  DEAD-like helicase  58.09 
 
 		 757 aa  798    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0972  DEAD-like helicase  59.8 
 
 		 756 aa  795    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2839  DEAD-like helicase  60.15 
 
 		 756 aa  810    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59540  hypothetical protein  60.73 
 
 		 749 aa  822    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0020175  hitchhiker  2.4674200000000003e-18 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0667  DEAD-like helicase  59.85 
 
 		 760 aa  808    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0881388  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0457  DEAD-like helicase  58.07 
 
 		 759 aa  788    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.888566  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2330  helicase-like protein  59.18 
 
 		 759 aa  797    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00169623  unclonable  0.000000304607 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1202  putative, plasmid-related, DNA/RNA helicase  58.89 
 
 		 768 aa  800    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.898229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1463  DEAD/DEAH box helicase  60.15 
 
 		 752 aa  810    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1646  DEAD-like helicase  58.36 
 
 		 759 aa  792    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.509694  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4493  DEAD/DEAH box helicase  60.88 
 
 		 749 aa  823    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3405  helicase domain-containing protein  59.33 
 
 		 759 aa  796    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.342787 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0012  hypothetical protein  26.51 
 
 		 1098 aa  207  5e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0013  hypothetical protein  24.86 
 
 		 861 aa  168  4e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0004  helicase conserved C- domain protein  24.69 
 
 		 1116 aa  163  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.251802  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0012  hypothetical protein  31.29 
 
 		 562 aa  156  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_4999  hypothetical protein  29.2 
 
 		 802 aa  122  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.664639  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0124  hypothetical protein  30.3 
 
 		 502 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3723  type III restriction enzyme, res subunit  25.83 
 
 		 1113 aa  80.9  0.00000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2164  hypothetical protein  26.47 
 
 		 1118 aa  74.7  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.736314  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0123  hypothetical protein  23.06 
 
 		 597 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0268  type III restriction protein res subunit  25.94 
 
 		 1117 aa  70.9  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.885001  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0015  hypothetical protein  21.99 
 
 		 559 aa  55.5  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.423513 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2939  SNF2-related protein  22.66 
 
 		 1131 aa  55.5  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37662  predicted protein  23.25 
 
 		 589 aa  51.2  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0801404  normal  0.0201777 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  39.68 
 
 		 1084 aa  50.4  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40372  predicted protein  22.56 
 
 		 663 aa  49.3  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  38.1 
 
 		 1084 aa  50.1  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  23.56 
 
 		 959 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1036  SNF2 helicase associated domain-containing protein  28.57 
 
 		 832 aa  46.6  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  32.35 
 
 		 1125 aa  45.1  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  22.45 
 
 		 1403 aa  45.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3286  SNF2-related protein  38.57 
 
 		 988 aa  45.1  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02285  Putative DNA helicase ino80 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BAZ5]  37.14 
 
 		 1612 aa  44.7  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.885389 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  34.07 
 
 		 1084 aa  45.1  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  21.74 
 
 		 1086 aa  45.1  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2922  SNF2-related protein  22.81 
 
 		 660 aa  44.7  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.64681  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16860  predicted protein  22.47 
 
 		 821 aa  44.7  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.210208  normal  0.0295097 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0505  non-specific serine/threonine protein kinase  41.38 
 
 		 617 aa  44.3  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND02890  DNA supercoiling, putative  22.86 
 
 		 818 aa  44.3  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.525864  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0160  Cpp14  32.26 
 
 		 2117 aa  44.3  0.008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.296407  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0921  Non-specific serine/threonine protein kinase  22.95 
 
 		 895 aa  44.7  0.008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.203055  normal  0.885337 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1215  SNF2-related protein  24.43 
 
 		 958 aa  44.3  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.559784  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>