More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1051 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_1051  patatin  100 
 
 		 345 aa  704    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0742  Patatin  75.35 
 
 		 346 aa  526  1e-148  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.165524  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0779  patatin  75.07 
 
 		 346 aa  524  1e-148  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0392351 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0703  patatin  70.95 
 
 		 365 aa  504  9.999999999999999e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5552  patatin  68.9 
 
 		 343 aa  479  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.231044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3052  patatin  53.28 
 
 		 394 aa  370  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.896027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0908  patatin  54.91 
 
 		 359 aa  371  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3621  patatin  54.78 
 
 		 444 aa  364  1e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0810  Patatin  46.5 
 
 		 347 aa  322  5e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.163365 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0557  patatin  48.88 
 
 		 405 aa  319  3.9999999999999996e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1038  patatin  47.69 
 
 		 343 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0726  hypothetical protein  42.21 
 
 		 341 aa  300  2e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0706  hypothetical protein  42.21 
 
 		 341 aa  300  2e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0078  alpha/beta fold family hydrolase  47.35 
 
 		 433 aa  300  2e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.141844 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5616  patatin  47.6 
 
 		 349 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196838  normal  0.302344 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1495  patatin  47.38 
 
 		 353 aa  295  9e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3930  patatin  47.23 
 
 		 375 aa  295  1e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.664139 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6724  patatin  47.6 
 
 		 349 aa  294  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5833  patatin  47.31 
 
 		 349 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.200172  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1734  patatin  43.48 
 
 		 355 aa  292  7e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.761645  hitchhiker  0.00491151 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5355  Patatin  46.18 
 
 		 382 aa  291  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137697  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3639  patatin  45.82 
 
 		 349 aa  290  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3463  hypothetical protein  46.49 
 
 		 358 aa  290  3e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.702595  normal  0.0993418 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1886  patatin  45.58 
 
 		 346 aa  288  7e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0279531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5048  patatin  45.43 
 
 		 386 aa  281  1e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837426 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3008  patatin  41.74 
 
 		 354 aa  281  1e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0931291 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1641  Patatin  46.2 
 
 		 382 aa  281  1e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2551  hypothetical protein  44.35 
 
 		 349 aa  277  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.712482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1769  patatin  43.44 
 
 		 360 aa  276  3e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1598  patatin  45.48 
 
 		 414 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3249  patatin  41.57 
 
 		 383 aa  271  9e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1202  patatin  42.61 
 
 		 375 aa  270  2.9999999999999997e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1879  Patatin  45.19 
 
 		 414 aa  268  8e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.817162  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1858  patatin  41.14 
 
 		 344 aa  258  1e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000552891  normal  0.630364 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1045  Patatin  41.23 
 
 		 346 aa  258  1e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150468 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1614  patatin  41.69 
 
 		 347 aa  256  6e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.46652 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1341  patatin  39.89 
 
 		 342 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16840  FabD/lysophospholipase-like protein  41.35 
 
 		 340 aa  251  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.0025923  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0732  patatin  40.33 
 
 		 384 aa  251  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4690  putative esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily, Patatin-like phospholipase domain-containing protein  40.22 
 
 		 350 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000250129  normal  0.2345 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0792  patatin  40.67 
 
 		 347 aa  249  5e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4482  patatin  39.77 
 
 		 357 aa  246  4.9999999999999997e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0829  patatin  41.09 
 
 		 341 aa  244  9.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0136404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0550  Patatin  41.26 
 
 		 348 aa  243  5e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2026  patatin  40.23 
 
 		 362 aa  241  9e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.456959  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07230  FabD/lysophospholipase  40.85 
 
 		 315 aa  238  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2313  patatin  38.97 
 
 		 348 aa  234  2.0000000000000002e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.150597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1543  hypothetical protein  37.04 
 
 		 346 aa  224  1e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0910805  normal  0.119184 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2766  patatin  42.77 
 
 		 352 aa  224  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.104488 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1814  patatin  38.92 
 
 		 351 aa  206  7e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0348448  normal  0.0254439 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2491  patatin  39.28 
 
 		 346 aa  202  5e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5464  Patatin  36.26 
 
 		 370 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4728  hypothetical protein  34.15 
 
 		 470 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0856  Patatin  32.52 
 
 		 321 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2137  patatin  33.23 
 
 		 309 aa  144  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1824  Patatin  34.3 
 
 		 342 aa  141  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4953  Patatin  33.73 
 
 		 442 aa  137  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1906  patatin  30.84 
 
 		 349 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3988  Patatin  27.22 
 
 		 354 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1390  patatin  31.71 
 
 		 330 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.986013 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1783  Patatin  33.23 
 
 		 321 aa  118  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.503728  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1914  hypothetical protein  26.36 
 
 		 334 aa  102  8e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0721  patatin  31.39 
 
 		 384 aa  102  9e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0151  patatin  30.96 
 
 		 442 aa  100  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0196  patatin  28.2 
 
 		 429 aa  100  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2818  Patatin  26.61 
 
 		 356 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.119451 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1925  hypothetical protein  25.76 
 
 		 339 aa  98.2  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4448  Patatin  30.34 
 
 		 365 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5565  patatin  30.39 
 
 		 427 aa  96.7  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2310  Patatin  28.04 
 
 		 371 aa  95.9  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2219  Patatin  35 
 
 		 403 aa  95.1  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4147  Patatin  31.31 
 
 		 387 aa  93.6  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.649145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0386  patatin  31.49 
 
 		 387 aa  92.8  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2410  Patatin  31.48 
 
 		 423 aa  92.8  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648582  normal  0.741283 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4913  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.97 
 
 		 765 aa  91.3  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1865  patatin  29.92 
 
 		 387 aa  91.7  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5528  patatin  29.97 
 
 		 417 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.510398  hitchhiker  0.00846558 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5712  patatin  30.63 
 
 		 405 aa  90.1  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25761  normal  0.0781089 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4527  patatin  30.63 
 
 		 405 aa  90.1  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0502566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5147  patatin  30.63 
 
 		 405 aa  90.1  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.569515  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2694  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.18 
 
 		 763 aa  87.8  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.93746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4797  patatin  29.9 
 
 		 389 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105547 
 
 
-
 
NC_003296  RS02397  putative transmembrane protein  30.68 
 
 		 377 aa  87.4  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.104475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5313  patatin  30.09 
 
 		 405 aa  87.4  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0014  hypothetical protein  28.29 
 
 		 371 aa  87.4  4e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0014  hypothetical protein  28.29 
 
 		 371 aa  87  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1394  Patatin  28.97 
 
 		 412 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  hitchhiker  0.00234319 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3155  transpatatin- like phospholipase domain-containing protein  28.35 
 
 		 412 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.382595 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3124  patatin  29.47 
 
 		 405 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4981  patatin  29.47 
 
 		 405 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4269  Patatin  32.39 
 
 		 420 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.59934  normal  0.695585 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4379  Patatin  32.39 
 
 		 420 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.227942 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0020  patatin family phospholipase  29.31 
 
 		 412 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0016  patatin-like phospholipase  29.31 
 
 		 390 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1446  patatin-like phospholipase  29.31 
 
 		 412 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.369795  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1960  patatin  28.88 
 
 		 417 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.508656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1523  patatin-like phospholipase  29.31 
 
 		 412 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3168  patatin  28.9 
 
 		 405 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0020  patatin family phospholipase  29.31 
 
 		 412 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1166  patatin family phospholipase  29.31 
 
 		 412 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>