44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_1962 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010830  Aasi_1962  hypothetical protein  100 
 
 		 1031 aa  2085    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2038  TPR repeat-containing protein  32.54 
 
 		 1024 aa  519  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.144797 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1052  TPR repeat-containing protein  30.94 
 
 		 1019 aa  472  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.273667 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1538  TPR repeat-containing protein  31.41 
 
 		 1012 aa  461  9.999999999999999e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0101738  normal  0.837321 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2327  TPR repeat-containing protein  30.03 
 
 		 1023 aa  370  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.930727  normal  0.708749 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1172  Tetratricopeptide domain protein  27.33 
 
 		 1005 aa  363  1e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00175  TPR-domain containing protein  25.44 
 
 		 1006 aa  305  4.0000000000000003e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2246  TPR repeat-containing protein  25.03 
 
 		 1004 aa  291  5.0000000000000004e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0551  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.34 
 
 		 1001 aa  266  1e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.874554  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1517  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  23.49 
 
 		 1000 aa  169  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261003  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1651  TPR domain-containing protein  21.81 
 
 		 995 aa  144  9.999999999999999e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.874566 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  22.86 
 
 		 573 aa  60.1  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  20.51 
 
 		 573 aa  58.9  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  23.01 
 
 		 4079 aa  56.2  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  29.73 
 
 		 561 aa  55.1  0.000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.61 
 
 		 572 aa  54.7  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  29.19 
 
 		 561 aa  53.5  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2219  tetratricopeptide domain-containing protein  34.78 
 
 		 252 aa  53.1  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85463  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  22.92 
 
 		 985 aa  52.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2583  TPR repeat-containing protein  24.43 
 
 		 729 aa  52.8  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1484  soluble lytic murein transglycosylase, putative  23.61 
 
 		 747 aa  52.4  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.180895  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1377  lytic transglycosylase, catalytic  23.56 
 
 		 719 aa  51.6  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.010256 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.13 
 
 		 1077 aa  51.2  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  26.17 
 
 		 1276 aa  50.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  21.41 
 
 		 1979 aa  50.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0772  tol-pal system protein YbgF  28.95 
 
 		 285 aa  50.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0818446 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2094  tetratricopeptide TPR_2  30.08 
 
 		 259 aa  48.9  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127674  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22 
 
 		 572 aa  48.9  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0757  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 264 aa  48.5  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2360  TPR repeat-containing protein  26.77 
 
 		 346 aa  48.5  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0361524  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  23.48 
 
 		 1297 aa  48.1  0.0007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0817  TPR repeat-containing protein  20.82 
 
 		 594 aa  47.8  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.02661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  26.67 
 
 		 782 aa  47.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0376  tetratricopeptide TPR_4  26.85 
 
 		 929 aa  47  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3396  tol-pal system protein YbgF  29.63 
 
 		 260 aa  47.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14649  normal  0.0107304 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0977  hypothetical protein  27.64 
 
 		 281 aa  46.2  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0268883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0410  hypothetical protein  28.16 
 
 		 222 aa  45.8  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000196847  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0301  tol-pal system protein YbgF  28.57 
 
 		 243 aa  46.2  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.658955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2048  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 		 253 aa  45.4  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.400973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1013  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 		 265 aa  45.1  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1979  tol-pal system protein YbgF  29.63 
 
 		 261 aa  45.1  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3117  tol-pal system protein YbgF  28.44 
 
 		 272 aa  44.7  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.35815  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4645  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 349 aa  44.7  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.656867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1725  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 		 261 aa  45.1  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.039074 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>