147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1870 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1870  hypothetical protein  100 
 
 		 440 aa  863    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1545  hypothetical protein  100 
 
 		 470 aa  865    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402889 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0974  hypothetical protein  32.59 
 
 		 473 aa  151  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6157  hypothetical protein  32.13 
 
 		 498 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.594108  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2794  hypothetical protein  31.77 
 
 		 487 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42838  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2887  hypothetical protein  31.91 
 
 		 495 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524264  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0691  hypothetical protein  30.5 
 
 		 491 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0509  hypothetical protein  30.5 
 
 		 491 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0526  hypothetical protein  30.72 
 
 		 491 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1475  hypothetical protein  30.3 
 
 		 488 aa  126  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2903  hypothetical protein  30.3 
 
 		 488 aa  126  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0113  hypothetical protein  30.3 
 
 		 491 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2745  hypothetical protein  31.91 
 
 		 495 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0476  hypothetical protein  30.56 
 
 		 495 aa  124  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2214  hypothetical protein  32.13 
 
 		 483 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55600  hypothetical protein  30.46 
 
 		 471 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.325851 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2827  hypothetical protein  32.13 
 
 		 498 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0608535  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2838  hypothetical protein  32.13 
 
 		 463 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0829  hypothetical protein  30.41 
 
 		 467 aa  119  9e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.692902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0444  hypothetical protein  29.63 
 
 		 491 aa  119  9e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.404806  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1941  hypothetical protein  29.55 
 
 		 479 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0469275 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2598  hypothetical protein  25.31 
 
 		 506 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4840  hypothetical protein  30.91 
 
 		 471 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6270  hypothetical protein  28.11 
 
 		 492 aa  114  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.656674 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6830  hypothetical protein  28.05 
 
 		 459 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2739  hypothetical protein  33.43 
 
 		 472 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.203149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1935  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  32.69 
 
 		 473 aa  110  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal  0.612311 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2522  hypothetical protein  29 
 
 		 476 aa  109  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0740789  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6870  hypothetical protein  28.27 
 
 		 459 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2599  hypothetical protein  31.5 
 
 		 472 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2427  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  32.07 
 
 		 472 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3118  hypothetical protein  31.21 
 
 		 472 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6768  hypothetical protein  28.63 
 
 		 486 aa  106  8e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02090  hypothetical protein  31.8 
 
 		 472 aa  105  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1533  hypothetical protein  32.05 
 
 		 466 aa  105  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0110393  normal  0.601822 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1094  hypothetical protein  33.04 
 
 		 437 aa  103  7e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.095311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0203  hypothetical protein  28.04 
 
 		 487 aa  102  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.276332 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3150  hypothetical protein  30.39 
 
 		 471 aa  101  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2902  hypothetical protein  29.45 
 
 		 547 aa  100  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.107212 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1971  hypothetical protein  28.6 
 
 		 489 aa  99.8  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1383  hypothetical protein  30.11 
 
 		 593 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.573523  normal  0.0118968 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1834  hypothetical protein  30.41 
 
 		 478 aa  94  5e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000159073 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2299  hypothetical protein  29.32 
 
 		 505 aa  94  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1743  hypothetical protein  30.34 
 
 		 432 aa  93.6  6e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02867  hypothetical protein  27.15 
 
 		 467 aa  93.2  9e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3165  hypothetical protein  29.28 
 
 		 589 aa  92.8  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.907765 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2399  cytosolic protein  24.15 
 
 		 500 aa  90.5  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.843761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4129  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  28.2 
 
 		 527 aa  90.1  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2379  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  30.16 
 
 		 469 aa  86.7  8e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.286987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003015  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  24.84 
 
 		 467 aa  85.9  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.600573  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01908  hypothetical protein  27.95 
 
 		 523 aa  85.5  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.223055 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0035  hypothetical protein  24 
 
 		 484 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4524  hypothetical protein  28.94 
 
 		 528 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4489  hypothetical protein  26.23 
 
 		 527 aa  82.8  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0757544  normal  0.599232 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4622  hypothetical protein  26.23 
 
 		 540 aa  82.8  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0814384  normal  0.0497308 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3264  hypothetical protein  26.92 
 
 		 477 aa  81.3  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2165  hypothetical protein  28.8 
 
 		 492 aa  80.1  0.00000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.255686  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1226  hypothetical protein  29.88 
 
 		 431 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1326  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  25.85 
 
 		 473 aa  78.2  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4575  hypothetical protein  27.73 
 
 		 500 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.782674  normal  0.448511 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3808  hypothetical protein  25.17 
 
 		 465 aa  75.9  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3891  putative nucleotidyltransferase protein  25.81 
 
 		 471 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0759407 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5035  hypothetical protein  27.73 
 
 		 467 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.878273  normal  0.0411477 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5093  hypothetical protein  28.79 
 
 		 471 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1332  hypothetical protein  26.65 
 
 		 472 aa  73.9  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3766  hypothetical protein  23.85 
 
 		 486 aa  73.6  0.000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0176  hypothetical protein  25.23 
 
 		 433 aa  72.4  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.876193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0809  hypothetical protein  26.43 
 
 		 507 aa  71.6  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3469  hypothetical protein  25.32 
 
 		 480 aa  70.9  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5202  hypothetical protein  23.33 
 
 		 474 aa  69.7  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.45217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2295  hypothetical protein  26.36 
 
 		 472 aa  69.3  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1072  hypothetical protein  24.4 
 
 		 488 aa  69.3  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.289779 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2387  hypothetical protein  27 
 
 		 476 aa  68.9  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.434046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3205  hypothetical protein  26.02 
 
 		 449 aa  68.6  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0102672  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3381  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  22.34 
 
 		 499 aa  68.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.130693  normal  0.720575 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0080  hypothetical protein  26.05 
 
 		 489 aa  68.6  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2733  hypothetical protein  28.28 
 
 		 441 aa  67.4  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.340285  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0070  hypothetical protein  25.8 
 
 		 483 aa  66.2  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1458  putative DNA repair enzyme  26.27 
 
 		 534 aa  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5158  putative nucleotidyltransferase protein  24.95 
 
 		 474 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1830  hypothetical protein  26.93 
 
 		 449 aa  66.2  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3022  hypothetical protein  24.19 
 
 		 471 aa  65.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.302557 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3146  hypothetical protein  24.89 
 
 		 507 aa  65.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41691  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5156  hypothetical protein  26.48 
 
 		 472 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.249554  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0108  putative DNA repair enzyme  26.57 
 
 		 534 aa  65.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0727599 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2530  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  25.11 
 
 		 548 aa  65.1  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397333 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00039  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  20.93 
 
 		 484 aa  65.5  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000511104  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2005  hypothetical protein  26.16 
 
 		 478 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5604  hypothetical protein  25.79 
 
 		 503 aa  64.7  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000770787 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2201  hypothetical protein  27.05 
 
 		 555 aa  64.3  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0055  hypothetical protein  28.1 
 
 		 536 aa  63.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.845742 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4054  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  25.26 
 
 		 526 aa  63.2  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1766  hypothetical protein  26.84 
 
 		 469 aa  63.2  0.000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.569912  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1966  hypothetical protein  26.84 
 
 		 469 aa  63.2  0.000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.630688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2344  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  23.06 
 
 		 499 aa  62.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0116755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2801  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  23.85 
 
 		 452 aa  62  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.236313 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4462  hypothetical protein  25.62 
 
 		 525 aa  61.6  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.234838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5394  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  23.3 
 
 		 503 aa  59.3  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.280036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2779  hypothetical protein  24.75 
 
 		 545 aa  59.3  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.989391 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3293  nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair-like protein  24.4 
 
 		 522 aa  59.3  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.247641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>