240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1152 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1152  HNH endonuclease domain protein  100 
 
 		 181 aa  381  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0166  HNH endonuclease domain protein  59.2 
 
 		 184 aa  209  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0345  HNH endonuclease  59.2 
 
 		 184 aa  209  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.585904 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0252  HNH endonuclease  51.7 
 
 		 193 aa  198  3e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0319112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2772  HNH endonuclease  51.12 
 
 		 199 aa  195  4.0000000000000005e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.583807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2778  HNH endonuclease  56.07 
 
 		 221 aa  193  9e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.572366  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2596  HNH endonuclease domain-containing protein  50.28 
 
 		 196 aa  193  1e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.821966  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2277  HNH endonuclease  50 
 
 		 194 aa  192  3e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4034  HNH endonuclease  52.87 
 
 		 185 aa  189  2.9999999999999997e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000888657 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01815  restriction endonuclease  53.71 
 
 		 184 aa  186  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000133785  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0934  HNH endonuclease  54.07 
 
 		 186 aa  184  5e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.39126  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1053  hypothetical protein  53.45 
 
 		 204 aa  183  1.0000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.368832  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0423  hypothetical protein  51.7 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01172  HNH endonuclease family protein  52.02 
 
 		 220 aa  182  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.572297  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4054  HNH endonuclease  53.33 
 
 		 191 aa  182  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000779297  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0267  HNH endonuclease domain-containing protein  48.86 
 
 		 194 aa  181  5.0000000000000004e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1257  HNH endonuclease  48.88 
 
 		 189 aa  179  1e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0960  HNH endonuclease  44.94 
 
 		 189 aa  174  8e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.639629  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3215  hypothetical protein  48.04 
 
 		 193 aa  173  9e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1434  HNH endonuclease  47.4 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212887  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3448  HNH endonuclease  46.82 
 
 		 185 aa  164  5e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.19182  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2733  HNH endonuclease  46.82 
 
 		 185 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.560093  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3397  HNH endonuclease  46.82 
 
 		 185 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3847  HNH endonuclease  47.4 
 
 		 185 aa  162  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0889  HNH endonuclease  43.82 
 
 		 189 aa  161  5.0000000000000005e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.184851  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1270  HNH endonuclease  45.66 
 
 		 186 aa  160  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.210243  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5382  HNH endonuclease  48.54 
 
 		 202 aa  157  6e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631878 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2107  HNH endonuclease  46.82 
 
 		 185 aa  155  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6164  HNH endonuclease  44.51 
 
 		 187 aa  154  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0295  hypothetical protein  46.24 
 
 		 187 aa  153  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0984641 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3227  HNH endonuclease  45.09 
 
 		 185 aa  152  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0513  HNH endonuclease  51.14 
 
 		 176 aa  90.9  9e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  50.62 
 
 		 171 aa  90.5  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  49.38 
 
 		 166 aa  89.7  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_478  restriction endonuclease  48.86 
 
 		 176 aa  89  3e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1834  HNH endonuclease  33.15 
 
 		 165 aa  89  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1582  HNH endonuclease  35 
 
 		 167 aa  89  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0860  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 168 aa  89  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2202  HNH nuclease  33.77 
 
 		 165 aa  87.8  8e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.815076 
 
 
-
 
NC_002936  DET0537  HNH endonuclease domain-containing protein  48.86 
 
 		 177 aa  86.7  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  47.13 
 
 		 169 aa  86.3  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0389  HNH endonuclease  32.54 
 
 		 165 aa  86.3  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.235309  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  35 
 
 		 168 aa  86.7  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0346  HNH nuclease  36.42 
 
 		 174 aa  86.3  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  33.77 
 
 		 171 aa  86.3  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1715  HNH endonuclease  32.91 
 
 		 197 aa  84.7  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4460  HNH endonuclease  48.75 
 
 		 181 aa  84.7  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.282325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17361  HNH endonuclease family protein  33.11 
 
 		 185 aa  84.3  7e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.334321  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1995  HNH endonuclease  32.28 
 
 		 168 aa  84.3  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0301593 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3201  HNH endonuclease  47.83 
 
 		 186 aa  84.3  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177111  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1905  HNH endonuclease  47.14 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16481  HNH endonuclease family protein  34.44 
 
 		 168 aa  82.8  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.587799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2059  HNH endonuclease  42.86 
 
 		 198 aa  82.4  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.26208  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0745  HNH endonuclease  47.73 
 
 		 191 aa  82.4  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0613  HNH endonuclease  48.86 
 
 		 185 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3285  HNH endonuclease  33.11 
 
 		 165 aa  82.8  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1974  HNH endonuclease  42.86 
 
 		 198 aa  82.4  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54643  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2838  HNH endonuclease  33.11 
 
 		 165 aa  82.8  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3479  HNH endonuclease  45.35 
 
 		 169 aa  82.4  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0281943  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4220  HNH endonuclease  41.35 
 
 		 177 aa  82  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17101  HNH endonuclease family protein  32.45 
 
 		 187 aa  82  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3060  HNH endonuclease  41.51 
 
 		 183 aa  81.6  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137861  normal  0.0666766 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0558  HNH endonuclease  48.86 
 
 		 185 aa  81.6  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0931  HNH endonuclease  32.5 
 
 		 174 aa  81.6  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.432363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3490  HNH endonuclease  47.73 
 
 		 185 aa  81.3  0.000000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4342  HNH endonuclease  39.62 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2814  HNH endonuclease  46.51 
 
 		 177 aa  81.3  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0623363 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4555  HNH endonuclease  41.51 
 
 		 183 aa  81.3  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00702162  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2818  HNH endonuclease  45.12 
 
 		 173 aa  81.3  0.000000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1417  HNH endonuclease  45.12 
 
 		 174 aa  80.9  0.000000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.421094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0342  HNH endonuclease  48.86 
 
 		 185 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.440485  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2350  HNH endonuclease  46.74 
 
 		 188 aa  80.5  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.459711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0978  HNH endonuclease  38.78 
 
 		 170 aa  80.1  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19741  HNH endonuclease family protein  41.76 
 
 		 168 aa  80.1  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17201  HNH endonuclease family protein  32.45 
 
 		 185 aa  80.9  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0405  HNH endonuclease  34.62 
 
 		 169 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.359772 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5379  HNH endonuclease  39.62 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.785631  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0162  HNH endonuclease  29.49 
 
 		 170 aa  79.7  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.504267  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1621  HNH endonuclease family protein  31.79 
 
 		 185 aa  79.7  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0891  HNH endonuclease  44.05 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.374169  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1099  HNH endonuclease family protein  41.76 
 
 		 168 aa  79.3  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0478  HNH endonuclease  48.86 
 
 		 185 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1131  putative HNH endonuclease  46.59 
 
 		 185 aa  79  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3111  HNH endonuclease  45.12 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.599577 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0411  HNH endonuclease  29.78 
 
 		 165 aa  78.6  0.00000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4834  HNH endonuclease  39.62 
 
 		 182 aa  78.2  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  normal  0.684674 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4001  hypothetical protein  47.5 
 
 		 185 aa  78.2  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2501  HNH endonuclease  30.97 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000947022  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5301  HNH endonuclease  39.62 
 
 		 182 aa  78.2  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.480344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2497  HNH endonuclease  32.28 
 
 		 170 aa  77.8  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1202  HNH endonuclease  43.06 
 
 		 205 aa  77.8  0.00000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2729  restriction endonuclease  47.5 
 
 		 194 aa  77.4  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0771488  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2524  HNH endonuclease  49.37 
 
 		 216 aa  77.8  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.434338 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1387  HNH endonuclease  47.5 
 
 		 194 aa  77.8  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.322582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23331  HNH endonuclease family protein  32.45 
 
 		 189 aa  77  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3843  HNH endonuclease  45.56 
 
 		 196 aa  76.3  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2211  HNH nuclease  45.05 
 
 		 184 aa  76.6  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1954  HNH endonuclease  39.29 
 
 		 197 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.843087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2776  HNH endonuclease  46.84 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.228269  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4633  HNH endonuclease  46.43 
 
 		 177 aa  75.5  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.57722  normal  0.0386344 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>