61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_12271 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008816  A9601_12271  porin  100 
 
 		 355 aa  691    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12251  porin  87.8 
 
 		 369 aa  611  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.624505  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1131  porin precursor-like  51.34 
 
 		 371 aa  307  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00125322  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12271  porin  49.87 
 
 		 385 aa  296  2e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.319358  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12121  porin  45.99 
 
 		 383 aa  271  1e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1130  porin precursor-like  42.89 
 
 		 384 aa  233  5e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0788851  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12261  porin  42.33 
 
 		 399 aa  227  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12401  porin  41.16 
 
 		 449 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.137225  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0721  porin precursor-like  35.03 
 
 		 440 aa  160  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13641  porin-like protein  30.29 
 
 		 432 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13341  porin  31.21 
 
 		 426 aa  133  6e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1264  porin-like  28.64 
 
 		 437 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08291  hypothetical protein  32.16 
 
 		 450 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0885219  hitchhiker  0.0000555529 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13551  porin-like protein  31.66 
 
 		 432 aa  127  3e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.564802  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16211  porin-like protein  29.52 
 
 		 415 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.191112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0777  porin-like protein  27.99 
 
 		 414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04791  hypothetical protein  33.87 
 
 		 333 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0282732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1057  porin-like protein  32.55 
 
 		 335 aa  102  7e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1757  porin-like protein  33.69 
 
 		 332 aa  102  9e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1512  hypothetical protein  27.83 
 
 		 431 aa  100  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.486809  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19301  hypothetical protein  31.38 
 
 		 336 aa  92.8  8e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.665373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12111  hypothetical protein  31.31 
 
 		 415 aa  87.4  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1575  porin  25.74 
 
 		 514 aa  79  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415305  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11511  porin  28 
 
 		 328 aa  77  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0116362 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0440  porin-like protein  27.08 
 
 		 328 aa  73.6  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2367  porin  37.3 
 
 		 500 aa  73.2  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0324  porin  29.8 
 
 		 510 aa  72.8  0.000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1999  porin  23.68 
 
 		 524 aa  72  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0137122  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0323  porin  36.15 
 
 		 513 aa  70.1  0.00000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222297  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1591  porin  26.72 
 
 		 528 aa  68.9  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411467  hitchhiker  0.00286278 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11091  porin  29.84 
 
 		 555 aa  63.5  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.559273 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12591  hypothetical protein  41.18 
 
 		 515 aa  60.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.375416  hitchhiker  0.00229564 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2012  porin  34.81 
 
 		 518 aa  57.4  0.0000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1515  hypothetical protein  24.32 
 
 		 384 aa  57  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.116312  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14071  porin  31.62 
 
 		 531 aa  56.6  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4440  S-layer region-like  25.12 
 
 		 531 aa  56.2  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.016737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1464  porin  25.63 
 
 		 531 aa  56.2  0.0000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00000540569  normal  0.0535262 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12581  hypothetical protein  38.82 
 
 		 515 aa  56.2  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00206869 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26321  porin  34.9 
 
 		 543 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2366  porin  26.54 
 
 		 561 aa  55.8  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.231063  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3779  carbohydrate-selective porin OprB  31.67 
 
 		 561 aa  54.7  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000785609  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4567  carbohydrate-selective porin OprB  26.38 
 
 		 529 aa  55.5  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.316045  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1635  porin; major outer membrane protein  30.05 
 
 		 548 aa  53.1  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00492408  normal  0.132701 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4223  Carbohydrate-selective porin OprB  25.24 
 
 		 581 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219563  normal  0.747154 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4184  Carbohydrate-selective porin OprB  25.24 
 
 		 581 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1607  porin; major outer membrane protein  26.42 
 
 		 518 aa  52.8  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.657278 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1095  porin  30.6 
 
 		 475 aa  50.8  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.319287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0823  S-layer domain protein  36 
 
 		 578 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000211926  normal  0.0522919 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18981  hypothetical protein  22.04 
 
 		 390 aa  50.8  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1463  porin  30.82 
 
 		 543 aa  50.4  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000578184  normal  0.0560138 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1234  carbohydrate-selective porin OprB  28.97 
 
 		 639 aa  50.4  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.373435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0838  carbohydrate-selective porin OprB  29.36 
 
 		 550 aa  49.7  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.832217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0200  hypothetical protein  32.81 
 
 		 533 aa  49.3  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4466  carbohydrate-selective porin OprB  30.38 
 
 		 491 aa  48.9  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.666985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2510  S-layer region-like  29.49 
 
 		 574 aa  47.4  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000393409  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08801  hypothetical protein  57.5 
 
 		 188 aa  47  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2174  S-layer region-like  30.71 
 
 		 530 aa  46.6  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.721353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1069  Carbohydrate-selective porin OprB  26.83 
 
 		 658 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000390313  unclonable  0.000000000285099 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1028  hypothetical protein  22.25 
 
 		 409 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4536  S-layer region-like  41.33 
 
 		 624 aa  43.9  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4140  S-layer region-like  27.61 
 
 		 600 aa  43.1  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0020254  normal  0.0305803 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>