More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_08281 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_08281  ribulose-phosphate 3-epimerase  100 
 
 
251 aa  523  1e-147  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.43124  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08261  ribulose-phosphate 3-epimerase  96.02 
 
 
252 aa  502  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0774  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  94.42 
 
 
252 aa  499  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08171  ribulose-phosphate 3-epimerase  88.05 
 
 
251 aa  476  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0172  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  78.4 
 
 
250 aa  425  1e-118  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.468732  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08041  ribulose-phosphate 3-epimerase  78 
 
 
250 aa  423  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0416891  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3649  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  41.92 
 
 
224 aa  199  3e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0165  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.48 
 
 
224 aa  193  2e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2590  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.89 
 
 
234 aa  193  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0691249  normal  0.0209735 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1619  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.18 
 
 
234 aa  193  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1646  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.18 
 
 
234 aa  193  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1959  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.2 
 
 
218 aa  191  9e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1716  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.2 
 
 
218 aa  190  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3229  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.73 
 
 
235 aa  187  2e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.247025  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2606  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.36 
 
 
236 aa  185  5e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.203389 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5270  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.83 
 
 
235 aa  184  9e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.12238 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0287  ribulose-phosphate 3-epimerase  39.57 
 
 
232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3971  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  41.48 
 
 
224 aa  182  6e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0517248  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4675  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.85 
 
 
235 aa  181  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1069  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.75 
 
 
221 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2195  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.38 
 
 
216 aa  180  2e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1951  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.87 
 
 
229 aa  180  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1284  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.83 
 
 
214 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000283492  hitchhiker  0.00041943 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2292  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.6 
 
 
227 aa  179  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0604  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.96 
 
 
247 aa  179  4e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000939667  normal  0.65152 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0584  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.52 
 
 
236 aa  179  4.999999999999999e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.821706  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2620  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.86 
 
 
233 aa  179  4.999999999999999e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.498011  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3908  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.83 
 
 
214 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3902  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.83 
 
 
214 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000909006  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0850  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.24 
 
 
225 aa  178  5.999999999999999e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3711  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.83 
 
 
214 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000326882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3601  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.83 
 
 
214 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000335974  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3619  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.83 
 
 
214 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3998  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.83 
 
 
214 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000394109  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3874  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.83 
 
 
214 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9214700000000005e-28 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2302  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.52 
 
 
231 aa  178  7e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.492163  hitchhiker  0.000182482 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0842  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.24 
 
 
225 aa  178  7e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2512  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.31 
 
 
214 aa  178  7e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000411423  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1537  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.63 
 
 
222 aa  178  8e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1776  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.91 
 
 
220 aa  177  1e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0576  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  40.79 
 
 
220 aa  177  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.885825  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4780  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.23 
 
 
221 aa  177  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.833549 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3959  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.35 
 
 
214 aa  177  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2376  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.49 
 
 
225 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3527  ribulose-phosphate 3-epimerase  38.22 
 
 
221 aa  177  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3593  ribulose-phosphate 3-epimerase  38.22 
 
 
221 aa  177  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1941  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  43.06 
 
 
220 aa  177  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0479  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.69 
 
 
224 aa  176  3e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1996  ribulose-phosphate 3-epimerase  39 
 
 
238 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1994  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.33 
 
 
229 aa  176  4e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1252  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.41 
 
 
227 aa  175  6e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0447  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.86 
 
 
230 aa  175  7e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.423262  normal  0.174808 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00503  ribulose-phosphate 3-epimerase  38.84 
 
 
239 aa  175  7e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1918  Ribulose-phosphate 3-epimerase  42.06 
 
 
225 aa  174  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.301545  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3683  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.35 
 
 
214 aa  174  9e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00141472  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1739  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.6 
 
 
227 aa  174  9e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.178471  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0104  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  42.23 
 
 
219 aa  174  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0175  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.62 
 
 
228 aa  174  9.999999999999999e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1715  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  40.44 
 
 
229 aa  173  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3251  ketose-bisphosphate aldolase class-II  40.91 
 
 
224 aa  172  3.9999999999999995e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1747  ribulose-phosphate 3-epimerase  38.05 
 
 
216 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000490404  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3128  ribulose-phosphate 3-epimerase  39.53 
 
 
223 aa  172  5e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002331  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.09 
 
 
223 aa  172  6.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.556001  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0790  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  45.02 
 
 
226 aa  171  7.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0292  ribulose-phosphate 3-epimerase  39.29 
 
 
225 aa  171  9e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0067  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  40.44 
 
 
221 aa  171  9e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0253  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  39.29 
 
 
225 aa  171  9e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3466  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  40 
 
 
229 aa  171  1e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0874335  normal  0.826504 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3689  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.26 
 
 
232 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00024  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.09 
 
 
223 aa  171  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4077  ribulose-phosphate 3-epimerase  39.06 
 
 
224 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3515  ribulose-phosphate 3-epimerase  39.39 
 
 
228 aa  170  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5120  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.44 
 
 
224 aa  170  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.802026  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2125  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.38 
 
 
225 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00642843 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4107  ribulose-phosphate 3-epimerase  39.06 
 
 
224 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.887514  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3997  Ribulose-phosphate 3-epimerase  39.06 
 
 
224 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2696  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.22 
 
 
227 aa  170  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4195  ribulose-phosphate 3-epimerase  39.06 
 
 
224 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0346  ribulose-phosphate 3-epimerase  39.11 
 
 
224 aa  170  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3700  ribulose-phosphate 3-epimerase  39.06 
 
 
236 aa  170  2e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2726  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.26 
 
 
225 aa  170  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1047  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.79 
 
 
221 aa  170  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000178019  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3842  Ribulose-phosphate 3-epimerase  40 
 
 
224 aa  169  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0107323  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2907  ribulose-phosphate 3-epimerase  38.89 
 
 
243 aa  170  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0566  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.18 
 
 
224 aa  169  4e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4611  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.18 
 
 
224 aa  169  4e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1489  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.45 
 
 
226 aa  169  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0453865 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2858  ribulose-phosphate 3-epimerase  39.06 
 
 
228 aa  169  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3888  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  38.84 
 
 
225 aa  169  4e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.384968 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3362  ribulose-phosphate 3-epimerase  39.73 
 
 
230 aa  169  5e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0267  ribulose-phosphate 3-epimerase  39.29 
 
 
222 aa  169  5e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.137082  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4259  ribulose-phosphate 3-epimerase  39.73 
 
 
224 aa  169  5e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0110433 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4056  ribulose-phosphate 3-epimerase  37.95 
 
 
225 aa  169  5e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00103124  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07910  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.74 
 
 
224 aa  169  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242873 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0508  ribulose-phosphate 3-epimerase  39.06 
 
 
228 aa  168  6e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.471552  normal  0.840535 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4787  ribulose-phosphate 3-epimerase  39.83 
 
 
224 aa  168  6e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.750334 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0219  ribulose-phosphate 3-epimerase  38.84 
 
 
224 aa  168  6e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4115  Ribulose-phosphate 3-epimerase  40.61 
 
 
224 aa  169  6e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0155127  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4082  Ribulose-phosphate 3-epimerase  40.61 
 
 
224 aa  169  6e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.349999  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0167  ribulose-phosphate 3-epimerase  39.55 
 
 
222 aa  168  7e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>