More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_02771 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008816  A9601_02771  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  100 
 
 		 207 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.385201  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0257  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  83.57 
 
 		 207 aa  353  1e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.420219  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02881  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  76.21 
 
 		 206 aa  331  4e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.130398  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02781  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  70.94 
 
 		 212 aa  289  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3629  isopropylmalate isomerase small subunit  52.76 
 
 		 206 aa  235  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02811  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  56.37 
 
 		 207 aa  228  7e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1621  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  56.41 
 
 		 206 aa  222  4e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1327  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  50 
 
 		 197 aa  221  6e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.507856  normal  0.452578 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03331  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  56.41 
 
 		 206 aa  221  7e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5027  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  51.02 
 
 		 201 aa  220  9.999999999999999e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.162476  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0257  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  53.09 
 
 		 204 aa  217  7.999999999999999e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24681  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  51.49 
 
 		 210 aa  216  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3761  isopropylmalate isomerase small subunit  50.76 
 
 		 197 aa  214  9e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3810  isopropylmalate isomerase small subunit  50.76 
 
 		 197 aa  214  9e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2087  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  51.02 
 
 		 204 aa  212  2.9999999999999995e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3966  isopropylmalate isomerase small subunit  45.92 
 
 		 202 aa  204  6e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.05677  normal  0.0175805 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2548  isopropylmalate isomerase small subunit  46.67 
 
 		 202 aa  201  4e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0488432  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0871  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  44.28 
 
 		 217 aa  185  4e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0900  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  46.97 
 
 		 223 aa  183  1.0000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0643  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  43.07 
 
 		 206 aa  182  3e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2764  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  44.9 
 
 		 211 aa  177  8e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0321  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  42.71 
 
 		 203 aa  176  2e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00352929  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1847  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  42.93 
 
 		 201 aa  174  9e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2681  isopropylmalate isomerase small subunit  46.11 
 
 		 201 aa  173  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2657  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  44.06 
 
 		 214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1602  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  42.19 
 
 		 201 aa  165  5e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0187865 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0667  isopropylmalate isomerase small subunit  43.3 
 
 		 202 aa  164  1.0000000000000001e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1545  aconitate hydratase domain protein  45.26 
 
 		 209 aa  160  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.831045  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2224  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  36.67 
 
 		 202 aa  111  7.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0126  isopropylmalate isomerase small subunit  37.24 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.899902  normal  0.029238 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4211  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  38.89 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1562  isopropylmalate isomerase small subunit  36.11 
 
 		 193 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0121  isopropylmalate isomerase small subunit  36.73 
 
 		 201 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.886111  normal  0.157977 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0372  isopropylmalate isomerase small subunit  38.6 
 
 		 201 aa  106  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0126  isopropylmalate isomerase small subunit  36.73 
 
 		 201 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0963  isopropylmalate isomerase small subunit  36.84 
 
 		 200 aa  106  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0119  isopropylmalate isomerase small subunit  36.32 
 
 		 201 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0122  isopropylmalate isomerase small subunit  36.22 
 
 		 201 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.14126  normal  0.46492 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0296  isopropylmalate isomerase small subunit  38.01 
 
 		 201 aa  105  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.447651 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1314  isopropylmalate isomerase small subunit  35.56 
 
 		 193 aa  105  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1423  isopropylmalate isomerase small subunit  35.56 
 
 		 193 aa  105  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0423  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  35.75 
 
 		 194 aa  105  5e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0497347 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3269  isopropylmalate isomerase small subunit  45.74 
 
 		 209 aa  105  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0340  isopropylmalate isomerase small subunit  38.01 
 
 		 201 aa  105  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2148  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  36.81 
 
 		 207 aa  105  6e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0323042  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4358  isopropylmalate isomerase small subunit  39.18 
 
 		 201 aa  104  7e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2134  isopropylmalate isomerase small subunit  36.36 
 
 		 190 aa  105  7e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1494  isopropylmalate isomerase small subunit  35.56 
 
 		 193 aa  105  7e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2097  isopropylmalate isomerase small subunit  36.36 
 
 		 190 aa  105  7e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1523  isopropylmalate isomerase small subunit  35 
 
 		 193 aa  104  8e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1287  isopropylmalate isomerase small subunit  34.64 
 
 		 193 aa  104  9e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1325  isopropylmalate isomerase small subunit  35.98 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0159  isopropylmalate isomerase small subunit  35.2 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.949563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1456  isopropylmalate isomerase small subunit  33.52 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2522  isopropylmalate isomerase small subunit  34.72 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.68534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3888  isopropylmalate isomerase small subunit  33.52 
 
 		 193 aa  102  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3028  isopropylmalate isomerase small subunit  46.09 
 
 		 201 aa  102  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.295047 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1126  isopropylmalate isomerase small subunit  36.59 
 
 		 193 aa  102  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.76367  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03088  isopropylmalate isomerase small subunit  37.91 
 
 		 201 aa  102  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1288  isopropylmalate isomerase small subunit  34.64 
 
 		 193 aa  102  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0827  isopropylmalate isomerase small subunit  45.74 
 
 		 211 aa  102  4e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0619  isopropylmalate isomerase small subunit  35.23 
 
 		 201 aa  102  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1424  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  45.67 
 
 		 201 aa  102  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1147  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  44.09 
 
 		 201 aa  102  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00108201 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3281  isopropylmalate isomerase small subunit  37.7 
 
 		 207 aa  102  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.186191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0279  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  32.4 
 
 		 195 aa  102  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0396  isopropylmalate isomerase small subunit  37.11 
 
 		 201 aa  102  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184497 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2764  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  35.15 
 
 		 221 aa  102  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001659  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  35.45 
 
 		 200 aa  101  6e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.57325  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1960  isopropylmalate isomerase small subunit  38.75 
 
 		 204 aa  101  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0883  isopropylmalate isomerase small subunit  45.67 
 
 		 201 aa  101  7e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2590  isopropylmalate isomerase small subunit  36.14 
 
 		 197 aa  101  7e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000283256  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0083  isopropylmalate isomerase small subunit  44.88 
 
 		 201 aa  101  7e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.384389  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1246  isopropylmalate isomerase small subunit  37.06 
 
 		 204 aa  101  8e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4222  isopropylmalate isomerase small subunit  44.53 
 
 		 202 aa  101  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.233647 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0862  isopropylmalate isomerase small subunit  34.08 
 
 		 201 aa  101  9e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2521  isopropylmalate isomerase small subunit  34.08 
 
 		 201 aa  101  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0216  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  38.51 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247072  normal  0.136168 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0040  isopropylmalate isomerase small subunit  36.51 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00442875 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3469  isopropylmalate isomerase small subunit  36.65 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.068645  normal  0.363086 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1548  isopropylmalate isomerase small subunit  44.44 
 
 		 204 aa  101  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.165609  normal  0.0663452 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00814  isopropylmalate isomerase small subunit  35.45 
 
 		 200 aa  101  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1185  isopropylmalate isomerase small subunit  43.94 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.840345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0215  isopropylmalate isomerase small subunit  35.71 
 
 		 202 aa  100  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.20437 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1704  isopropylmalate isomerase small subunit  34.22 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.045793  hitchhiker  0.00210823 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2915  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  35.16 
 
 		 195 aa  100  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3297  isopropylmalate isomerase small subunit  45.31 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0041  isopropylmalate isomerase small subunit  35.35 
 
 		 200 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3898  isopropylmalate isomerase small subunit  43.75 
 
 		 202 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106034  normal  0.223457 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4547  isopropylmalate isomerase small subunit  36.55 
 
 		 201 aa  99.8  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.258236  normal  0.011903 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1811  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  32.66 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.382373  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0414  isopropylmalate isomerase small subunit  36.32 
 
 		 201 aa  99.4  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000110574 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0230  isopropylmalate isomerase small subunit  43.31 
 
 		 201 aa  99.4  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00838951 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28677  predicted protein  34.95 
 
 		 722 aa  99.4  3e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0400  isopropylmalate isomerase small subunit  36.32 
 
 		 201 aa  99.4  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000488217 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0388  isopropylmalate isomerase small subunit  36.32 
 
 		 201 aa  99.4  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0498  isopropylmalate isomerase small subunit  42.52 
 
 		 201 aa  99  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.701221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1564  isopropylmalate isomerase small subunit  32.37 
 
 		 215 aa  99  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126411  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2791  isopropylmalate isomerase small subunit  43.31 
 
 		 201 aa  99  5e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0389  isopropylmalate isomerase small subunit  35.79 
 
 		 201 aa  99  5e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>