220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_4106 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_4106  protein of unknown function DUF179  100 
 
 
197 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4073  protein of unknown function DUF179  99.49 
 
 
197 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.424244  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3962  hypothetical protein  95.94 
 
 
197 aa  359  1e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0457  hypothetical protein  77.01 
 
 
199 aa  261  4e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3637  argininosuccinate lyase  39.55 
 
 
203 aa  135  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755097  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0675  hypothetical protein  38.8 
 
 
190 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2910  protein of unknown function DUF179  37.78 
 
 
186 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3764  hypothetical protein  37.36 
 
 
188 aa  128  6e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03574  hypothetical protein  33.51 
 
 
189 aa  127  9.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0705  hypothetical protein  38.46 
 
 
193 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03293  Transcription regulator  35.64 
 
 
208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.856515  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2743  hypothetical protein  39.01 
 
 
193 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0264  protein of unknown function DUF179  36.26 
 
 
214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1286  hypothetical protein  32.62 
 
 
197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.921549  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3962  hypothetical protein  37.43 
 
 
193 aa  125  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000136745 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0400  hypothetical protein  37.84 
 
 
201 aa  125  6e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0368  hypothetical protein  37.21 
 
 
187 aa  124  7e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2336  hypothetical protein  38.64 
 
 
188 aa  123  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3893  hypothetical protein  37.5 
 
 
186 aa  123  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0705  hypothetical protein  35.05 
 
 
200 aa  123  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0019  hypothetical protein  32.45 
 
 
200 aa  121  5e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2472  putative transcriptional regulator  36.11 
 
 
189 aa  121  6e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.888778  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5311  hypothetical protein  36.96 
 
 
190 aa  121  7e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00562319  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3346  hypothetical protein  34.57 
 
 
187 aa  121  8e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0619  hypothetical protein  37.16 
 
 
190 aa  121  8e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3034  hypothetical protein  36.72 
 
 
200 aa  121  8e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000468613  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1237  hypothetical protein  36.72 
 
 
186 aa  121  8e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.198149 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3019  hypothetical protein  36.72 
 
 
200 aa  121  8e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00383877  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2681  hypothetical protein  38.76 
 
 
187 aa  121  8e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0732107  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3177  hypothetical protein  36.72 
 
 
187 aa  120  9e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000779638  hitchhiker  0.00595197 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1344  protein of unknown function DUF179  36.72 
 
 
187 aa  120  9e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0111665  hitchhiker  0.000000000584431 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0567  hypothetical protein  37.16 
 
 
190 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.7379  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1153  hypothetical protein  33.14 
 
 
198 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0938  hypothetical protein  39.33 
 
 
192 aa  120  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.147168  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2478  hypothetical protein  36.36 
 
 
186 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0940  hypothetical protein  37.78 
 
 
188 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.335136  normal  0.481513 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1462  hypothetical protein  35.2 
 
 
207 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0243  hypothetical protein  34.44 
 
 
210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.763394  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002461  hypothetical protein  32.95 
 
 
174 aa  119  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1997  hypothetical protein  35.2 
 
 
192 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.938009  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3170  hypothetical protein  35.2 
 
 
192 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2524  hypothetical protein  35.75 
 
 
192 aa  119  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.811534  normal  0.166085 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0916  hypothetical protein  35.2 
 
 
192 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2746  hypothetical protein  35.2 
 
 
192 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.770221  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3112  hypothetical protein  35.2 
 
 
192 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3148  hypothetical protein  35.2 
 
 
192 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.199133  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1859  hypothetical protein  35.2 
 
 
192 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3695  protein of unknown function DUF179  37.08 
 
 
191 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0382  hypothetical protein  35.2 
 
 
192 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.653476  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0835  hypothetical protein  35.2 
 
 
192 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186487  hitchhiker  0.000370502 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0864  hypothetical protein  35.2 
 
 
192 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3962  hypothetical protein  35.2 
 
 
192 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.554384 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3811  hypothetical protein  36.16 
 
 
221 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0754  hypothetical protein  35.2 
 
 
192 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.173115  normal  0.270249 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0737  hypothetical protein  35.2 
 
 
192 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.270978  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0868  hypothetical protein  36.16 
 
 
192 aa  118  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0761346 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1132  hypothetical protein  35.59 
 
 
190 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.214662  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02000  hypothetical protein  37.5 
 
 
188 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1356  protein of unknown function DUF179  34.08 
 
 
216 aa  117  9.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1199  hypothetical protein  35.03 
 
 
187 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000139258  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1270  hypothetical protein  35.03 
 
 
187 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000905389  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0349  hypothetical protein  35.23 
 
 
191 aa  117  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242257  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1200  hypothetical protein  35.03 
 
 
187 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0314769  normal  0.527879 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1252  hypothetical protein  29.63 
 
 
234 aa  116  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252452  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2669  protein of unknown function DUF179  37.08 
 
 
185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.670234  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3712  hypothetical protein  34.39 
 
 
187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.081023  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3062  hypothetical protein  37.08 
 
 
185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0331  protein of unknown function DUF179  35.53 
 
 
198 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502019  normal  0.568849 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1574  hypothetical protein  37.5 
 
 
184 aa  115  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0297031  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0485  hypothetical protein  35.14 
 
 
190 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127846  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4617  protein of unknown function DUF179  35.64 
 
 
199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4027  hypothetical protein  34.92 
 
 
187 aa  114  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375113  hitchhiker  0.00119286 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2327  hypothetical protein  35.2 
 
 
191 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0686759 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1144  hypothetical protein  33.33 
 
 
185 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.496045  normal  0.0336297 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0501  hypothetical protein  32.8 
 
 
187 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.232417  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1142  hypothetical protein  34.08 
 
 
195 aa  112  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.873097  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1517  hypothetical protein  37.04 
 
 
200 aa  112  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3910  hypothetical protein  33.33 
 
 
187 aa  112  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0230557  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2219  hypothetical protein  32.39 
 
 
181 aa  112  4.0000000000000004e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277771  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0469  hypothetical protein  37.3 
 
 
189 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2193  transcriptional regulator  32.39 
 
 
194 aa  112  4.0000000000000004e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.996839  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05290  hypothetical protein  35.53 
 
 
189 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.535405  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5037  hypothetical protein  33.67 
 
 
190 aa  112  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0636  hypothetical protein  32.11 
 
 
187 aa  112  5e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0620  hypothetical protein  32.11 
 
 
187 aa  112  5e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2850  hypothetical protein  32.77 
 
 
186 aa  112  5e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.507234  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1337  hypothetical protein  33.33 
 
 
186 aa  112  5e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0174957  hitchhiker  0.000402511 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0436  hypothetical protein  36.41 
 
 
190 aa  111  6e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.972531  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2896  protein of unknown function DUF179  34.36 
 
 
199 aa  111  6e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3573  hypothetical protein  34.36 
 
 
199 aa  111  6e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.425942 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4995  hypothetical protein  36.41 
 
 
189 aa  111  9e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2406  protein of unknown function DUF179  35.23 
 
 
192 aa  110  9e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.802635  normal  0.951535 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0726  hypothetical protein  36.67 
 
 
186 aa  111  9e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58244  normal  0.917839 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4869  hypothetical protein  36.41 
 
 
189 aa  111  9e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0147719 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2579  hypothetical protein  34.25 
 
 
185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0876832 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5045  hypothetical protein  35.87 
 
 
189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3090  hypothetical protein  33.71 
 
 
187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132976  decreased coverage  0.00000221223 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0747  protein of unknown function DUF179  33.71 
 
 
211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.364395  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3380  hypothetical protein  33.71 
 
 
187 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.966977  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0009  hypothetical protein  30.39 
 
 
187 aa  109  2.0000000000000002e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>